不知道多久的未来后。
自7月2日后，许多不知名的远古要塞拔地而起。像是吹响了地狱的号角声一样，一道幽蓝色的光芒从距地球十几光年远的地方出发，以接近光的速度砸向地球。
不是像《新石纪》这部番剧描述的一样，全地球的人类都被这道光变成石像，退出繁盛的历史舞台，然后在几千年后幸存的人类复苏，互相抱团取暖，重衍文明。要真是这样的话，地球联邦会笑得乐翻天的。他们有足够的信心在新的石器时代完整复苏，繁衍出更加昌盛的人类文明。
只可惜，现实十分残酷，完全不想他们所想的方向发展。被那道光照耀到的远古要塞就像是得到了活动必须的能源，巨大的齿轮互相咬合，开始运作。紧闭的大门被一个个精巧的齿轮带动，向外敞开。门里面没有任何光源，整个黑漆漆的一片。但是，就是这种来自远古的恶意给人类文明造成了巨大的创伤。
自秦朝后就几乎消失殆尽的灵气再次复苏，给人类带来福利的同时也造成了不小的麻烦。最直观的表现就是动物变异成《山海经》和其他玄幻作品中登场的生物，有神兽血统和大气运的动物更是直接返祖，体内不断产生比灵力还要厉害许多倍的仙力。一些拥有智力的变异动物在某次意外中发现人类的肉体中蕴含有大量的灵力，吃下它可以更快、更稳定的增加自己的实力。于是，猎人和猎物的位置又调换了，人类毫无抵抗之力，成为那些变异动物的唐僧肉。
不仅如此，本该消散的鬼魂得到了灵力的支撑，在本能操控下无差别袭击人类，通过此种手段获取来更多更多的灵力。一些怨气特别重的鬼魂在灵力的作用下，觉醒成鬼王，向仇人报仇后统治鬼族大军对人类发动一次又一次的猛攻。
人类一方苦不能言，只能被动挨打，牺牲了不少生命。普通的武器对那些鬼魂不起作用，就算是对那些变异动物使用也是效果甚微，核武器则是不敢拿出来使用。谁使用核武器，谁就是人类的死敌，必须被不惜一切代价打倒。
得到灵力的人类在联邦的统一管理下欣欣向荣，努力为人类的生存做贡献。但也有一些不法分子，企图推翻地方政权，自己做地头蛇。最后，他们都是被联邦血腥镇压，尸体被送到各大实验室进行研究。
8月25日，人类铸造的堡垒一座座沦陷，所幸人员及时撤离，没有造成太大的伤亡。
9月3日，联邦高层意识到人类的力量与那些生存了几千万年，甚至十几亿年的动物相比还是太过弱小。想要成功生存，就必须出奇至胜。经联邦高层一直同意，伊琳诺顿博士和旗下研究员脱离原先的研究所，人工失踪，断绝和外界的所有联系，在圣地利安开展“基兰计划”。
11月27日，埃尔总将授命联邦高层，向蒂丽安元首发出通知，要求即刻应用“基兰计划”的研究成果。人类在这场规模浩大的战争中节节失利，付出了巨大的牺牲才勉强保留住人类的薪火。
人类不能等了，也等不下去了。最近，艾诺斯特教授通过对比，发现了一个惊天真相。他观测的平行世界二十一世纪以前的历史大致上是一致的，但一旦和他们的世界对比就会发现，在日本的江户时代有一个断层，将它拿出来和平行世界衔接却衔接不上。由此作出判断，他们的历史被篡改过，具体地点就是在日本。
战国时期出现了一个主宰了国家命运的刀匠——四季崎记纪，他锻造的刀用当时的眼界是很难想象到它们所蕴含的技术。毫不夸张的说，在当时那个落后的时代，那些刀就算是称之为神器也不过分。但据文献记载，四季崎一族世代都是以占卜为生。四季崎记纪是他们一族的天才，但他却走向刀匠这条路上，这着实令人好奇。
四季崎一族似乎在布置一场惊天大局，用自己的方法去篡改日本的命运。
世界对偏离轨迹的历史会作出修正，只是手段有些粗暴，一点都不温柔。人类只是寄宿在地球上的病毒，时时刻刻的不在啃食地球。而地球虽然对人类恨得咬牙切齿，但在规则的束缚下，它不能无理由的对人类进行清理活动。四季崎一族对历史的篡改主动地给了它动手的理由，所以追根究底他们要想生存下去的话就必须派人回去修正历史。
圣地利安。
这里是人类少数没有沦陷的地方，与外界彻底断绝关系，补给物资都是通过分子合成得到的。人数大概也就只有两三百人，基本上能自给自足，维持正常的生活水平。
圣地利安就仿若一个奇迹，在“基兰计划”执行的那天宛若从天而降，一夜之间建成。里面没有任何防御系统，只有必要的研究设施，但从来没看到过这里有一个入侵者出现过，仿佛这里被从历史中删除，从不存在过一样。和蓬莱山辉夜的“永远”之力有些相似，因为没有历史，所以才不会被时间腐朽，永远保存下来。
事实上，研究出这种技术的科学家还正好是东方project的爱慕者，自己手动制作了无数手办。有一天，他突发奇想，为什么不能将幻想乡那些少女的能力应用在现实之中呢？妖精的能力是自然元素的运用，都太过简单，凭现在的人类科技水平就可以轻松实现。时间的能力倒是有些挑战性，他结合某本笔记的资料实验无数次，凭借着强大的毅力，终于在第七千七百七十七次实验中成功，发明出月之表。被联邦高层知道后，他的这项发明被运用在圣地利安的防御系统中。但是，为了保证圣地利安可以让特定的人类进出自如，里森博士又研发出一套识别系统，持有资格的人方可进入。
第二重空间中，一艘航天母舰缓慢飞行。这艘航天母舰名普罗米修斯号，意为人类文明的火种。材料选用可以在千万倍重力下安然无恙的具有黑洞的十分之一密度的奈特合金，坚不可摧。人类一方在意外发现它的时候曾想用它作为修建人类堡垒的材料，但这种合金数量极少，可遇不可求，所以人类也就放弃了这种不切实际的幻想，用这种合金打造出人类一方的终极武器——普罗米修斯号。
舰身约3000米长，500米宽，50米高，配有副炮108门，主炮50门。副炮采用的武器是从内部分解物体本身的量子崩裂炮，歼灭了无数变异动物，在人类战场上赫赫有名。主炮采用的武器无从得知，只知道超负荷输出下可以将整个太阳系毁灭。
舰长室内，蒂丽安元首坐在方桌一旁的座椅上，双手交叉，支撑着头部。在她对面坐着埃尔总将。他们两人一直互相紧盯着对方，空气一时间凝固起来。
蒂丽安元首严肃地说道：“你真的决定好了吗？”
埃尔总将没有回答她的问题，笑眯眯地看着她，但这就是最好的回答，沉默就表示同意。
“唉……”蒂丽安元首叹了一口气，她早就想到会这样。联邦高层瞒着她执行“基兰计划”就是为了不让她担心。她这个人什么都好，就是内心有点柔软，狠不下心下手。所以前任元首李宁退位前曾对执事会下达最高指令，事关人类的生死存亡，为了人类的生存可以不必向元首请示，直接发布命令。
普罗米修斯号的目的地是消失在历史中的圣地利安，在第二重空间中行驶无比安全。灵气复苏的时间不长，至今为止也才五个月不到。那些变异动物虽然实力强大，但还没有突破空间的能力，就算是那些神兽也只能自由穿梭在第一重空间，无法接触到第二重空间。
空间泛起幽蓝色的波纹，普罗米修斯号逐渐虚化，消失在历史中。
圣地利安。
这是一座没有任何生机的城市，与外界断绝了关系，活像一座监狱。里面的人出不去，而外面的人也基本进不来。在这里的科学家早就已经做出了为人类文明献身的觉悟，他们的后事都以被安排得好好的，家人自加入“基兰计划”后就一直得到联邦的厚待，让他们后顾无忧，心无杂事，全神贯注的投入时间机械的研发工作。
他们的研究速度很快，前人就几乎已经为他们铺平了道路。20世纪，爱因斯坦教授就已经写出时间机械的计算公式，研发出时间机械，但在不久后就销毁，资料也是在大火之中烧尽。22世纪，人类再次研发出时间机械，通过时间机械，窃取到平行世界爱因斯坦教授撰写的大部分资料，其中就包括时间机械。
无论是哪个世界的爱因斯坦教授，他发明的时间机械都是不完全体，穿梭的时间实际上是平行世界的时空，回来后也是在平行世界的时空，造成了原世界时间修改的假象。
在6月2日的考古活动中，人类从第1号坑中发掘出更加完善的时间机械的资料，“基兰计划”就是以这份资料为基础执行的。
所谓的“基兰计划”，人类一方集结大量的科学家通过资料逆运算得出真正的时间机械的发明步骤。与其说发明，倒不如说制造。
“元首大人好！”正在工作的科学家见到蒂丽安元首，一个个都放下手头的工作，向她行礼。
“嗯。”蒂丽安元首点头示意，领着身后的埃尔总将走向核心部位的实验室。
核心部位的实验室出奇的狭窄，大约只有100平方米，地面上杂乱堆放着许多手稿，剩下的地方就都摆放着电脑，最里面摆放着一个奇怪的机械，一个鹤发童颜的研究员不断修正指数。
“伊琳诺顿博士，时间机械可以正好投入使用了吗？”蒂丽安元首问道。
“元首大人，和发掘出来的资料对比倒是没有误差。我们之前也试着将几个死刑犯用这台机械送回到过去，结果也正如我们所想的一样，他们全部失去了联系，历史上也多了一些不相干的闲杂人士，被我们所留下的后手杀死了。所以，这台机械基本上可以投入工作。但是……”伊琳诺顿博士在这里停顿了一下，故意卖了个关子。
“但是什么？”
“时间机械因为研发过急，稳定性不好，成功率只有一成。”伊琳诺顿博士解释道。
“一成的成功率吗？行！埃尔总将，是你为人类文明的未来献身的时候了。我在问你最后一次，你真的决定好了吗？”
“没问题，我尊敬美丽的元首大人，埃尔总将已随时做好准备。”
“那好，伊琳诺顿博士，启动时间机械吧。”
“遵从您的指示，元首大人。”
伊琳诺顿博士在电脑上输出一道道指令，十指仿若在键盘上跳舞。
时间机械的舱们打开，露出里面白色的狭窄空间。埃尔总将对蒂丽安元首做出献出心脏的礼仪。
“为人类文明的未来献出心脏！”
“为人类文明的未来献出心脏！”蒂丽安元首同样将右手放在心脏处，弯腰行礼。
“埃尔总将，你要记住，你身上背负着人类文明最后的火种，千万别辜负了我们的期望，我们等着你将希望的曙光带给我们。”
“知道了，我烦躁无味的元首大人，埃尔总将会完成修正历史的光荣使命的。”
埃尔总将走进了时间机械，舱门紧紧闭合。一道道绚丽的光芒闪过，里面的人影在时间的伟力下消失了。
“埃尔总将，埃尔总将，收到请回答，收到请回答。”
对讲机另一边许久没有回应。
片刻的沉默后，实验室内爆发出一阵阵热烈的欢呼声。
“成功了？”
“成功了！”
“人类文明万岁！”
——
实验后，蒂丽安元首接过文献，翻阅后脸上失去了色彩。
“失败了？”
“埃尔总将对历史的修正失败了？”
“通知伊琳诺顿博士，执行第二套方案！”
人类的文明，绝不能就此覆灭！
蒂丽安元首攥紧手心，指甲因用力过大而在雪白纤细的手上留下道道浅浅的印痕。