林远在碇真嗣的身体里醒来已经十五年了，但他对这个世界的理解依然支离破碎。
雨滴敲打着列车车窗，将第三新东京市的轮廓晕染成模糊的水彩画。真嗣看着自己的倒影——黑色的短发，略显苍白的脸颊，那双属于十四岁少年的眼睛却沉淀着成年人的审慎。他穿着整洁的学生制服，手提箱放在膝盖上，整个人显得拘谨而克制。
列车广播响起即将到站的通知。真嗣整理了一下思绪，回想这次突如其来的召唤。三天前，一封署名“葛城美里”的信件送达他寄宿的亲戚家中，要求他立即前往第三新东京市。信件措辞礼貌但不容拒绝，附有一张单程车票和简单的地图指示。
更让他警惕的是信中那句：“你的父亲需要你。”
碇源堂——那个几乎从他记事起就消失在他生活中的男人，那个只在每年生日时寄来一张冰冷贺卡的名字。真嗣对这位“父亲”的记忆稀少而模糊，仅存的几个片段中，那个戴眼镜的男人总是背对着他，身影在实验室的冷光中显得遥远而不可触及。
列车缓缓停靠。真嗣提起手提箱，跟随人流走下站台。雨中的城市带着某种刻意的整洁感，街道宽阔得异乎寻常，建筑物之间的间距大得不符合城市规划常识。他注意到许多楼房屋顶都有可开合的结构，像是某种伪装。
“碇真嗣君？”
一个女性的声音从身后传来。真嗣转身，看到一个约莫二十多岁的女性站在雨中，没打伞，栗色短发被雨水打湿贴在脸颊。她穿着红色夹克和短裙，笑容热情得有些刻意。
“我是葛城美里，NERV战术作战部的。”她走上前，自然地接过真嗣的手提箱，“一路辛苦了。你的父亲让我来接你。”
“NERV？”真嗣重复这个陌生的缩写，脑海中快速检索记忆。没有任何相关信息。这不是学校课程中会出现的内容，也不是新闻报道中常见的机构名称。
美里似乎意识到自己说了不该说的话，表情僵硬了一瞬，随即又扬起笑容：“啊，这个嘛……总之我们先回住处吧，雨越来越大了。”
真嗣点点头，没有追问。多年的经验告诉他，当别人试图掩饰信息时，过早的追问只会让信息源更加警惕。他沉默地跟随美里走向停车场，观察着周围环境：车站的安保人员制服上有奇怪的徽章，远处的山体有巨大的人工开凿痕迹，天空中偶尔有造型特殊的飞行器掠过。
一切都指向一个结论：第三新东京市不是普通的城市。
“就是这辆！”美里停在一辆鲜黄色的雷诺Alpine A310前，车型复古得像是从博物馆开出来的展品。她拉开车门，做了个“请”的手势。
真嗣坐进副驾驶座，车内弥漫着淡淡的啤酒味和快餐包装纸。美里发动引擎，车子发出不情愿的轰鸣声，驶入雨中的街道。
“那个……真嗣君，你父亲应该告诉过你为什么叫你来吧？”美里边开车边试探地问，眼睛不时瞥向真嗣。
“没有。”真嗣平静地回答，目光落在窗外飞逝的街景上，“他只说‘需要你过来’。”
美里握方向盘的手指微微收紧。真嗣捕捉到了这个小动作，心中警铃轻响。这个葛城美里显然知道一些他不了解的内情，而且那些内情让她感到紧张或不安。
车子穿过数个检查站，每个检查站都有持枪警卫，他们对美里的证件仔细核查后才放行。真嗣注意到警卫的武器不是普通的警用装备，而是某种重型军事武器。
“我们快到了。”美里将车开进一栋高层公寓的地下停车场，“我的公寓在七楼，有点乱，别介意啊。”
电梯上升过程中，真嗣继续收集信息：停车场有加固结构，电梯内部有额外的安全摄像头，走廊的防火门比标准规格厚实。这一切都表明这栋建筑有超出民用需求的防护等级。
美里的公寓门打开时，真嗣几乎被眼前的混乱景象怔住了。玄关堆满未拆封的纸箱，客厅地板上散落着空啤酒罐、披萨盒和各种文件。唯一的整洁区域是墙上巨大的世界地图，上面用红蓝两色图钉做了密密麻麻的标记。
“抱歉抱歉，最近工作太忙了。”美里匆忙踢开地上的杂物，清出一条通路，“你的房间在这边，我已经简单收拾过了。”
真嗣走进分配给自己的房间。与客厅相比，这里整洁得过分——一张床，一个书桌，一个衣柜，除此之外几乎空无一物。窗户对着城市东侧，可以看到远处山体上巨大的几何形结构。
“那是学校的方向。”美里不知何时出现在门口，“你明天就要转学过去了，第三新东京市第一中学。”
真嗣没有回应，他的注意力完全被山体上的结构吸引。那些结构不符合任何已知的建筑类型，更像是某种工业设施或军事基地的入口。更诡异的是，其中几个结构有明显的损伤痕迹，像是被巨大力量撞击过。
“美里小姐。”真嗣转过身，目光平静而直接，“我父亲到底要我做什么？”
美里明显措手不及。她张了张嘴，又闭上，最后叹了口气：“这件事……最好由你父亲亲自解释。明天我会带你去见他。”
“NERV是什么机构？”真嗣追问，“车站的警卫有你们的徽章，城市的检查站只对你们的车辆快速放行。这不是普通的研究机构，对吗？”
美里惊讶地看着他，显然没料到这个看似内向的少年会有如此敏锐的观察力。“真嗣君，这些问题……”
“如果我要在这里生活，我有权知道基本的情况。”真嗣的声音依然平静，但语气中带着不容退让的坚持，“至少告诉我，这座城市为什么需要这么多军事级别的防护？”
两人在狭小的房间中对峙。雨敲打着窗户，远处传来隐约的警报声，短暂响起后又归于沉寂。
美里揉着太阳穴，终于妥协：“第三新东京市是世界上防御最严密的城市，因为我们需要应对一种特殊的威胁。NERV就是为此成立的国际组织。你父亲是这里的最高指挥官。”
“什么样的威胁？”真嗣追问。
“现在还不能告诉你。”美里的表情变得严肃，“但我保证，明天见到你父亲后，你会知道一切。”
真嗣点点头，知道这是目前能获得的全部信息。他走到窗边，再次望向远处的山体结构。雨水顺着玻璃流淌，将那些巨大的几何形扭曲成怪异的图案。
一种本能的预感告诉他，那些结构与他被召唤到这里的原因直接相关。而他那位陌生的父亲，正身处那些结构的深处。
“晚餐想吃什么？”美里试图打破沉默，“我点外卖，炸鸡怎么样？”
“都可以。”真嗣说，目光依然停留在窗外。
美里离开房间后，真嗣打开手提箱，取出几本笔记。这是他多年来记录观察和分析的本子，每一页都写满了对各种现象的思考和推测。他翻到空白页，开始记录今天的观察：
“第三新东京市——明显为应对某种大型威胁而设计的城市，街道宽度异常，建筑物有伪装结构，地下可能有大片空间。”
“NERV——国际组织，军事级别权限，负责人是碇源堂（我的‘父亲’）。”
“葛城美里——NERV成员，军衔不明，知情但被限制透露信息，有明显的焦虑迹象。”
“山体结构——用途不明，有战斗损伤痕迹，尺寸巨大，可能是某种设施的入口。”
写到这里，真嗣停笔思考。如果这座城市是为应对威胁而建，那么威胁来自何方？恐怖组织？敌对国？还是……某种超乎常规的存在？
警报声再次响起，这次更清晰，持续时间更长。真嗣走到窗边，看到街道上的行人开始有序地进入地下入口，整个过程训练有素，显然是经常演练的撤离程序。
天空阴沉，雨势渐大。在乌云缝隙间，真嗣似乎看到某种巨大的阴影在空中移动，但转瞬即逝，让人怀疑是否是错觉。
他重新坐回书桌前，翻开另一本笔记。这本笔记的开头记录着他最早的记忆——不是碇真嗣的记忆，而是林远的记忆。那个来自另一个世界的灵魂，在一个完全陌生的身体中苏醒的记忆。
十五年过去了，他依然不了解这个世界的基本规则，不了解自己为何在此，更不了解那个被称为“父亲”的男人的真实意图。
但有一点他很确定：碇源堂不会因为亲情而召唤他。这次召唤一定有某种实用目的，而他要做的，就是在信息不对等的情况下，尽可能保护自己，弄清真相。
窗外，城市的灯光在雨中一盏盏亮起。真嗣合上笔记，准备迎接他在第三新东京市的第一个夜晚。
明天，他将见到那位陌生的父亲。
明天，他将开始揭开这个世界的谜团。
而在城市下方的巨大空间深处，紫色的巨人在拘束器中静静沉睡着，等待驾驶者的到来。