接下来实际上是两个剧情主场，一个是阿米娅对初雪，一个是ff0对斯卡蒂。
阿米娅和ff0的目的是达成阿米娅的计划，把“四个关键人物”凑到一起，然后一起自杀，以此完成对书记的破局，让博士带着剩下的“理智恢复”的干员来战胜书记。
期间会有W和书记的补充视角，来埋下书记真正目的的暗线。至于为什么四个关键人物自杀退出会回复其他人的理智，书记表示这四个人是营造这个局面的“精神支柱”，之前也是她们四个在间会期间受到了最严重拜多的精神影响，换句话说，书记表示，自己是通过四场幻觉在她们四个人的意识里埋了暗雷，才最终诱导形成了当下的局面。
那么书记的真正目的是什么呢？
这其实是主线，我先把初雪和斯卡蒂那边的支线交代清楚。预计里也是用支线来逐渐把这个目的诱导出来的。初雪那边的状态很简单，她内心实际上十分嫉妒阿米娅。在她看来，两个人的位置和承担的责任其实相似，但阿米娅却可以一直在博士身边，向他撒娇。原本这没什么，但在这种情况下她的不甘情绪彻底爆发了，由此引发了二人之间的冲突。但阿米娅其实早就意识到，博士实际上是有心上人的。在她意识到自己的感情是爱情的那一刻起，她就明白了这一点。她其实并不是特别在意年龄和身份的问题，这个真相才是她迟迟不表明心意的原因，所以这边的冲突在阿米娅崩溃地说出这一点后，实质变成了两个败犬互舔伤口的结果，由此阿米娅得到了初雪的支持。在这边的支线里，阿米娅一直都会看到另一个自己诱惑她把博士的情感彻底向自己扭曲，这也是书记主线的伏笔。
之后是斯卡蒂那边，引出是W引出的。在W和临光成功把无人机引开，让博士逃离之后，她就一直紧盯着书记的动态。随后，她一边躲避无处不在的监视无人机，一边跟踪战斗无人机，最终来到了ff0和斯卡蒂对峙的现场，然后视角回到ff0，她在与斯卡蒂对峙后绝望地发现，为了赢得这场“大逃杀”的胜利，斯卡蒂已经向深海献上了自己，以此换取跟深海承诺博士这个个体将永远属于她。ff0本来已经要山穷水尽了，但书记的无人机成功阻止了斯卡蒂的进一步行动。不仅如此，书记还把在暗中偷窥的W点了出来，同时怒斥深海表示自己很失望，拜多居然已经退化到了这种地步，完全简直就是亵渎人类种族的巨大牺牲。
拜多应当是某种对行星级生物武器，但深海却学会了语言，能够与其他种族沟通，这跟当初的设计目的完全相违背，而语言功能诞生的代驾就是深海的侵蚀通化能力远逊于拜多，这一点让书记像个偏执狂一样地对斯卡蒂进行了嘲讽。然后就是深海化的斯卡蒂被无人机的一发冲击加农炮打回原形。这时书记依然在大放厥词，还嘲讽W说多谢她把自己说的那句“斯卡蒂拜多化了”带话给博士，自己才能亲眼见证拜多的彻底退化。但这时候W表示自己根本没能跟博士说上话，只顾着从他手下逃跑了。这段叙述是在书记视角呈现的，之前的书记视角会描写他多次找烟抽但完全找不到，嗓子难受得很。但W话说出来之后，他瞳孔明显放大了一下，随后点点头，从衣服口袋里抽出一根烟来，慢慢地点上，他丰富的、潜意识里的反拜多经验让他终于成功逼出来了幕后黑手，就是他面前这个跟他二女儿无比形似的某种东西。
然后这人就被书记一顿披头痛骂，说你根本不是我女儿，我女儿左腿有严重的静脉曲张但右腿没有，所以高傲的自尊心让她坚持只穿单边压力袜，右腿不穿，以此证明彰显自己的健康。
书记算不算黑幕，其实真的应该两说，他一开始就觉着事情不对劲，博士口中的经过应该不是完全的真相，所以他的目的之一就是找到或许存在的黑幕。目的之二其实是，书记察觉到博士实际上是在勉强自己变得冷血无情。他既然做出了毁灭性举措并确实造成了一定的人身和认知危害，那就算是黑幕了，而在意识世界，两人对话之中的发言，加剧了博士的自我暗示，只是性质的轻重差异，而且黑幕也只是一个扮演角色的代指而已。因此他必须想办法逼迫博士否认这点，否则强装出来的冷血无情迟早会有崩溃的那天。书记之后直面博士的时候会做出发言:
“真正冷酷无情的人怎么会使用棋手棋子那种屌比喻。未免太过于装逼了。”
“冷酷无情很大程度上是一种天赋，办不到千万不能勉强自己。以我的人生经历来看，后者的下场一般不怎么好。”
“何况，无情并非英明决策的必要条件。你不要把自己逼得太狠了。”
所以博士大彻大悟决定平等博爱每一个人，后日谈里博士确实会渣男一把
跟他在意识世界里发生过关系的一猫一狗一马（煌临光）会患上只针对于他的性瘾，他自己也会偶尔出现剧烈头痛的现象，需要与三人进行类似的行为来缓解，但本番被全体医疗部成员严格封锁了。
最终结局的场景其实才是最早被构思好的，书记拿着05式左轮，对博士说我可还没认输呢，咱俩来俄罗斯轮盘赌，输的人去死，赢的人获得这具身体，我先来。
然后转动转轮，啪一声合上，对自己的太阳穴扣动扳机，枪响，人倒在桌子上，博士默默拿起左轮，掰开一看，转轮里的子弹是满的。
这里正好对应了前面书记在第二次会议上说过的“他能确保弹仓旋转到正好不会第一次被击发的位置”，于是这一次他在没有子弹的情况下转到了“确保第一次会被击发”的位置。
这里总结一下书记的三个目的：
第一揪出真幕后。
第二教育后辈做人，同时把对抗拜多的资料交给了W传下去。
第三，这人确实有怨气。
顺带一提意识世界死亡的人实质上都被书记强行拉回来了，这个是打算用叙述性诡计，每次角色“死亡”之后书记其实都更衰弱了，把博士扔出窗外后书记甚至直接断了一条胳膊，是因为博士属于主意识，捞回来代价很大。
剩下的其实就是
第一，书记究竟布了一个什么局？
第二，真正幕后是谁，打算干什么？
第一点其实很简单书记跟博士对话转变态度开始就在骗人，他根本没有埋什么暗雷，什么乱七八糟的意识攻击，他需要做的只是让博士认为他做了
因为这是意识世界，博士真正认为的事情就会成真，说出口的话会加强自我暗示也是这个原理，所以博士最后的吐槽书记不是死傲娇而是“老骗子”，这其实也是书记恢复记忆后的角色定位，就是“老骗子”。
同时幕后黑幕的暴露也是因为如此，书记下意识感觉这应该跟拜多有关，所以让W去给博士带话，诱导博士认为斯卡蒂深海化了，从而引拜多（哪怕是假的）入局。结果话根本没带到，斯卡蒂还是深海化了，这一点让书记在表里两层意识上确信了黑幕的存在，而意识世界里，只要被意识到了，基本就意味着无法隐藏。
真黑幕其实是被拜多扭曲化后的书记二女儿的意识，也可以说就是拜多，因为这相当于是扭曲的二女儿意志借用拜多的能量为自己创造了一个舞台。这一点是用白咕咕视角来呈现的，与所有人不一样她直面了二女儿，然后发现，二女儿的意识世界是个小房间，房间桌子上有部手机上面是“明日方舟”，一动不动的二维化自己在屏幕上静静待着。
这个世界本质就是二女儿用明日方舟的游戏资料搭建起来的二女儿的真实性格可以想象成W化的阿米娅，她在高中毕业的时候对自己老爹表了白，但实际上只是青春期的狂妄居多，被拒绝之后离家出走，篡改户籍，咬牙读了四年大学，又考了自己老爹的硕士生，在真实历史中，再次被拒绝后二女儿转到其他导师门下，专心做研究了。
拜多这个游戏BOSS的设定是相当超模的，扭曲的二女儿意志目的其实只有一个，她想让自己成为W或阿米娅，她老爹当博士，这就是为啥她要把老爹意识塞到博士脑子里，由此引发了后续一系列的事件。
讲道理，二女儿形象我是看黑化阿米娅有的灵感。扭曲后的二女儿意志就是典型的纯病娇，第一次见面她发现老爹不承认自己是她爹，欣喜若狂
“也就是说我终于可以当你的爱人了吗？”
她一直期盼着老爹会战胜博士，哪怕最后会变成敌人也无所谓，而书记跟她的对话里，也一直在向她暗示
“我收拾完博士就收拾你”
恋父情结和恋母情结是广泛存在于孩童成长时期的特殊感情阶段，所以她看到书记博士对峙的时候本来很开心的，结果书记一枪把自己毙了，然后她就碰上白咕咕了，然后本来想泄愤的她迎上了拿着那把05左轮闯进来的博士。
羞愤退场
“我一定会让他回来的！”
不过千万记得，这个是被拜多扭曲后的二女儿意志，也是某种历史记录，然后被错误复现的情况，真正的书记在西安亲手爆了氢弹而真正的二女儿在老爹死后继续攻关冲击加农炮了。
这个书记的意识幽灵在博士识破了自己的骗局，被追上门对峙之后欣慰地毙了自己。
而泰拉是人棍战机世界后的演化世界，并不依存于拜多，只不过拜多让世界演化成了明日方舟的样子，源石其实是就是拜多“遗骸”，而书记和他女儿都是沉淀在源石中的残响。泰拉世界的各种神明本质就是拜多的“退化”，源石和海嗣分别是残骸和退化后的分支，其实我原本想写的是从源石中“苏醒”的若干人类，为了彻底消灭拜多——即源石和他们自己
而战斗，同时与罗德岛发生纠葛的故事。那篇搞了很多莫名其妙的设定，结果最后写了一点就不写了，然后看舟游后宫文看爽，决定自己也来写，现成的设定好的世界观干脆直接拿来用了。
我一开始也没想揉这个世界观，这篇文最初的写法就是单纯的博士大黑幕，换了身份耍后宫玩，把自己都骗了。然后，然后上头了，所以书记一开始还真是博士吃瓜，看女人为了抢自己各种互撕。
所以一开始定了三个结局，其中一种就是博士吃瓜，原计划博士是混邪乐子人，可能自己被分了还在狂笑，表示分的好，然后用各种手段逃离了制裁。
书记设这个骗局本身也是想告诫博士，跟拜多干仗不能被对方牵着鼻子走，如果博士连这个局都没看出来，他确实是会认真考虑取博士而代之的，原本预定里这里会有个恶趣味的罗德岛全员恶堕结局（不）。
然后博士识破骗局是在阿米娅集齐了四个人之后站在博士面前，把枪塞在他手里，握住他的手用枪顶在自己额头上，平静地请他杀了自己，这场景刺激到了博士，让他从头捋了一遍事情的经过，然后发现了两点。第一是他的情报几乎全都单方面来自于书记，第二是对峙斯卡蒂时书记跟W对话的不对劲，从而推导出了真正的情况，书记让w传话给博士说斯卡蒂炸了，但是w没传到，轰了斯卡蒂之后书记开嘲讽跟W吵架，说多亏W你帮忙传话，要不然自己也见不到老对手的这幅寒酸样，然后W反驳说被你追的我根本没跟博士说什么话，然后在W这边的视角就是书记疑惑地哼了一声，然后消息突然断了。