在万众瞩目之中，阿莱克修斯皇帝还是认真的在世界渴望之城召开了新的大公会议。此次会议的目的虽然是弥合东西方教会的分歧，但阿莱克修斯一开始就没想过要放过任何一个宗教上的敌人。
为了彻底粉碎拉丁教会在西方的势力，将教会重置于帝国政府的管理之下，阿莱克修斯还准备了另一份武器，那便是君士坦丁堡文献库中关于君士坦丁大帝受洗的记录。罗马教廷一直宣称君士坦丁大帝是在罗马受洗，以便于维持自己的特殊地位，但经过古代文献的考察，阿莱克修斯有足够的证据证明君士坦丁皇帝受洗的地方是比提尼亚地区的尼科米底亚，是东方教会给大帝完成了洗礼仪式，而非西方。
“西方为何会长期沦落于野蛮的异教徒之手？为何撒拉逊海盗能在西西里和意大利横行无阻？为何西方的秩序会如此快速的崩溃！”尼古拉斯一张嘴，便给罗马教廷扣上了大帽子。“因为你们从根源上窃取了不属于你们的权力，是皇帝与元老以及各级官员们掌握着这个国家，而非教士们来治理国家。伟大的耶稣早就说过，‘上帝的归上帝，凯撒的归凯撒’。你们窃取了本不属于你们的权柄，因而导致了西方基督世界的沦陷与异教徒入侵的惨祸。如果不是伟大的皇帝阿莱克修斯率领大军在伊比利亚奋勇作战，恐怕整个伊比利亚都要再度沦陷到异教徒的手中。”
这话倒是不假，如果不是历史上著名的骑士熙德打出了接连几个令人匪夷所思的大胜仗，恐怕优素福真有能耐一路杀到巴塞罗那去。尼古拉斯一张嘴就将西部的沦陷按在了罗马教宗的虚伪之上，这便让西部各地的主教们喧哗起来。有的人仍然支持着教会的权柄，而有的早就成为了罗马皇帝的仆从，他们在煽风点火要求将教会的权柄彻底归还给帝国政府。而有的人则出于学术的正义性认可了这份辨伪的学术价值，因而也站到了皇帝这边。总而言之，在阿莱克修斯战无不胜的战绩与多次上帝保佑的神迹之下，阿莱克修斯想要揭穿君士坦丁赠礼的虚假内容，还真不难。
面对这种压力，来自东方的四个牧首自然都是同意的。即使亚历山大牧首是一性论派，他也很乐于看到阿莱克修斯对西部的教会动起了刀子。
在打垮了罗马教会之后，阿莱克修斯随即宣布将迦太基与昔兰尼加独立出来，他们将与未来收复的西部一道组成阿非利加牧首区。此外，伊比利亚、法兰西、阿勒曼尼亚、潘诺尼亚、基辅罗斯、北海、不列颠尼亚七个区域也要各自组建独立的牧首区。这样一来，便可以将罗马教会的权柄彻底分裂开来。新组建的牧首区之中，伊比利亚、阿非利加、基辅罗斯三处的牧首完全由罗马人掌握。潘诺尼亚与瓦拉几亚地区的牧首驻地虽然在佩斯城，但也完全受君士坦丁堡牧首领导。
作为对阿莱克修斯行动的支持，萨利安家的凯撒也获得了对日耳曼尼亚牧首区的管理权，而腓力则获得了对法兰西牧首区的管理权，北欧的丹麦国王则获得了对北海牧首区的管辖权。当然，他们虽然有了自主的管辖权，但在名义上还会服从君士坦丁堡牧首的领导。至于不列颠尼亚牧首区，为了制衡红胡子的威廉，阿莱克修斯将不列颠尼亚牧首的驻地设置在了都柏林，而非更加繁荣的英格兰地区。
虽然威廉二世对此表示了坚决地反对，但是在法兰西、德意志、丹麦三家的联合对抗之下，他也不得不接受阿莱克修斯的决策。至于伊比利亚的卡斯蒂利亚王国，他们在优素福的猛烈进攻之下，都快从王国变成“亡国”了，又哪里抽得出精力来到大公会议上论东论西呢？阿方索还指望着能够获得阿莱克修斯的怜悯，以便于保住自己的国家呢。
在结束了第一件要务之后，君士坦丁堡大牧首尼古拉斯随后便拿出了第二个目标，那便是“援助亚历山大利亚牧首区和耶路撒冷牧首区建设”这一要务。自从阿莱克修斯开始向埃及与东方移民之后，超过两百万人在过去十年间迁徙到了东方。人口比例的迅速变化让原本在本地占优势的一性论派逐渐丧失了多数派的地位。
阿莱克修斯随即将“两大牧首区发展速度赶不上人口增长速度”为理由，要求其他各地的牧首区进行人力援助。尼古拉斯对于这种削弱一性论派的做法自然是非常满意的，他立刻将这个方案在大公会议上抛了出来。由于新增了许多牧首区，原本四比一的投票对比，一下子便成了十比二。当十个牧首区都同意在人才上“援助东方”之后，阿莱克修斯明白，利用西部的教士来拔除东部一性论派的计划已经可以正式运转了。只要西部的移民占据了埃及与耶路撒冷的主体，只要来自西方和北方的主教们占据了这两个牧首区的主体，那一性论派哪里还会有什么市场呢？