那个诡异的传送装置能量不足够,而A2又不懂得如何为其充电。只能暂时作罢,他们这次来到的,是五万年前的崩坏世界。
A2凭借强大的战斗力很快成为了“逐火之蛾”的成员,并结识了芽衣的前世——MEI博士。
MEI博士知道了A2的来历,并答应会为她保守秘密,再想办法唤醒2B。她甚至一度清洗掉了2B程序中的病毒,但是却依然无法点亮她,原因不明。而此时崩坏的入侵也变得越发频繁,A2和MEI不得不忙碌于抵抗崩坏中。在劳累过度的A2疏忽之下,思念父亲心切的琳悄悄开启了传送装置,A2来不及阻止,能量匮乏的传送并没能将琳送回那个被毁灭的世界,而是将她送到了《反叛的鲁路修》世界,琳降临到不列颠帝都潘德拉贡的郊外,不完全的传送深深的伤害了她的大脑,使得她不再记得过去的事情。后来她被CC救到了教团,逐渐成长成为了一名ROUND。(详细看第一卷比惨大会琳章节)
为了对抗新到的律者,MEI博士决定效仿9S的作法,模仿2B的外貌制造了两个特殊的人造人双胞胎。它们都拥有吸收崩坏能转化的特性,希望她们能够战胜终焉律者,成为人类的救世主。但是还没等MEI博士将这两人完善,其中之一,代号为“凯莎”的妹妹却被崩坏意志发现并成功侵蚀,成为了第十三——暗之律者。A2与自己的小队拼命将其击败,“救世主”计划也宣告失败。
终焉律者不久之后降临,发觉无法挽回局面的MEI博士决定把希望的种子留给后来的人类,她除了研究出圣痕,神之键等物品外。还将被消灭的暗之律者核心植入到人造双胞胎中姐姐“2B”的身体里,放置入冬眠仓并封存到地下,希望有朝一日她能苏醒,为人类做出贡献。
虽然人类已经没有办法挽救,但A2还是拼尽自己的一切与终焉律者同归于尽,她最后将依然昏迷不醒的2B(原寄叶身体)托付给POD233,自己和POD042一起留在了这里。
233非常难过,却也感到巨大的压力,因为曾经的好友,9S和A2都已经不在,他们将2B托付给自己。可自己只是一个机器人,更加雪上加霜的是,传送装置已经彻底没有能量,233和2B被迫传送到了《反叛的鲁路修世界》,但唯有一点值得庆幸,2B受到传送空间波动的影响,竟然奇迹般的苏醒过来,但她的记忆,却只停留在《尼尔:机械纪元》世界,被A2杀死之前。