原作中的军衔的设定基本是照搬了日军的制度，这导致某些情况下很容易让人串戏到抗日剧。譬如说“佐”这种官职，原作中疾风是“二等陆佐”，换而言之她就是“八神中佐”——听起来真的非常像抗日剧里的反派。
因此，本书对于军衔的设定进行了些微的修改和精简。具体来说，本书中从高到低只有以下十三级军衔：
1.上将
2.中将
3.少将
4.上校
5.中校
6.少校
7.一等尉
8.二等尉
9.三等尉
10.一等士
11.二等士
12.三等士
13.训练生
更具体地，对于尉官和士官，根据空战魔导师和陆战魔导师的区别，在军衔上附加“空”字或“陆”字。（注：原作中的“空”、“陆”二字是来自于空军和陆军，与本书设定不同，譬如说疾风是“二等陆佐”，但显然疾风是空战魔导师）
譬如说军衔为一等尉的陆战魔导师，就称作“一等陆尉”，而军衔为一等尉的空战魔导师，则称作“一等空尉”。类似地，空战魔导师训练生称作“空士训练生”，陆战魔导师训练生称作“陆士训练生”。
对于更高的军衔，由于（在本书设定中的）一般情况下，这一级别军衔的持有人基本都是空战魔导师，所以便不再作“空”、“陆”的区分。
话说回来，为什么尉官的三个军衔不改成“上尉”、“中尉”和“少尉”呢？
因为第二卷的卷名是“一等空尉”，如果改成“上尉”的话，第二卷就要改名为“空军上尉”。显然，“空军上尉”没有“一等空尉”更有感觉。
关于军队编制的设定，由于本文不是军旅文，我也不熟悉军事细节，所以我进行了大幅度精简。具体来说，在陆军中我只保留了三级编制，从高到低分别是：
1.旅
2.大队
3.小队
譬如说原作中的“机动六课”就是一个“大队”的编制（其实应该算是空军大队，见下文），其下设有“星辰”、“雷光”、“长弓”三个小队。
而以上三级编制中，旅级军职对应将级军衔，大队级军职对应校级军衔，小队级军职对应尉级军衔——这一点基本和原作一致。譬如说“一等空尉”的奈叶是小队长，而“二等陆佐”的疾风是大队长。
为什么军队编制的层次这么少呢？
一方面，是由于魔导师能力的多样性，使得部队的合成化水平很高；另一方面，则是因为高级魔导师的单体作战能力足够强，大兵团面对小编制并不存在优势——即使是一万个C级魔导师组成的大兵团，聚在一起也未必撑得住奈叶的一发Starlight Breaker。
当然，更重要的原因是，军队编制的层次越多，需要向其中填补的指战员数量就越多。由于我写本书一个的准则是不原创角色，所以军队的编制自然越少越好，不然原作中的角色可能不够用了。
为什么最高一级是一个不伦不类的“旅”？
因为我经常在各种地方刷到“重装合成旅”这个词汇，它给我留下了很深刻的印象。
由于空战魔导师数量的稀少，所以空军只剩下两级编制，从高到低是：
1.大队
2.小队
同时，同样一级的编制，空军的人数也比陆军更少。
譬如说一个空军大队可能一共只有二三十名空战魔导师（以及差不多数量的“地勤人员”），而一个陆军大队则可能有上百人——主要原因在于空战魔导师相当于是“战斗机”而非“战斗人员”，现实中一个“空军飞行大队”也就只有十几架战斗机。
对于空军来说，大队级军职对应“校”级军衔，小队级军职对应“尉”级军衔，而如果在空军中升至“将”级军衔，则一般会直接前往统合作战本部任职。
由于空战魔导师最低也是A级魔导师，所以即使人数少得多，但实战中空军大队的战斗力是普遍强于陆军大队的。基于同样的原因，授予空军军衔需要的魔导师评级会高于陆军，譬如说A级魔导师在陆军中可以很容易地升任尉官，甚至能够成为校官，但在空军中，如果没有特殊贡献，至多只能担任士官。
关于海军，则有三级编制，从高到低是：
1.舰队
2.分舰队
3.舰船
一个舰队的主官被称作“指挥官”，譬如说吉尔·格雷姆便是第七舰队的指挥官。而分舰队的主官被称作“提督”，舰船的主官是“舰长”。
在第一卷中，琳蒂·哈洛温是第七舰队的一支巡逻分舰队的主官。由于这支分舰队中只有“阿斯拉号”一艘舰船，所以她是一个等同于“舰长”的“提督”。
除此之外，海军陆战队和海军航空兵都直接受到“舰队”一级的指挥，而这两种部队的编制都只有“大队”和“小队”两级。
对于海军来说，舰队指挥官对应“将”级军衔，提督和舰长都对应“校”级军衔，而舰船上的执行官对应“尉”级军衔。
为了防止被传送魔法跳帮，根据章程，一艘中型以上魔导战舰的舰长至少必须是S级魔导师。因此，由于魔导师数量的下降，时空管理局的海军规模受到S级魔导师数量的掣肘，导致绝大多数情况下一个分舰队里只有一艘舰船，所以“提督”和“舰长”在事实上已演变为一个军职。
最后，关于统合作战本部的设定，我希望把对这些设定的讲解放到小说正文中，便不在这里细说了。
唯一值得注意的是，由于时空管理局本质上是军政府（根据时空管理局的标识推断，原作里应该就是这样设定的），因此统合作战本部实际上具有相当高的行政权，譬如“次元航行部”实际上是统合作战本部的下级部门。