“安静点，别趁老师转过去写字讲话！”
恭介向一郎抱怨道：“新来的老师真让人头疼，不仅严厉，而且作业特别多。”
正当他们交谈时，老师发现了他们的注意力分散，质问道：“剑崎，这道题该怎么做？”
面对老师的提问，他有些迟疑。此时，建太忍不住发出轻笑声。
老师愤怒地指向城户，吼道：“城户，站起来！”接着，老师严厉地训斥道：“你们几个要是都像伢子那样不遵守纪律，就别指望顺利毕业。就连最近转来的风间都比你们听话。海城，你们三个人给我到走廊去罚站！”
三人只得服从老师的命令，走到走廊去罚站。他们不敢违抗老师的命令。
恭介感慨道：“唉，为什么人一定要读书呢？我宁愿成为一只自由翱翔的小鸟。” 一郎和建太也表示赞同。
放学后，一郎、恭介、建太三人因某种原因被老师叫到办公室进行训诫，并需提交检讨书后方可离开。此时，叶与小爱悄然来到了电脑教室。叶轻轻推开电脑教室的门，探询道：“你们在吗？！”“叶！”“小爱！”突然，小火焰兽、日光兽和叽叽兽从暗处跃出。叶看到他们状态不错，便笑着说：“你们看起来都挺好的！”日光兽不禁好奇地问：“你们注意到一郎了吗？他不在这里。”小爱回应道：“我们也不太清楚，毕竟我们不是同一个班级的同学。”
此刻，从办公室走出的三人中，恭介提议：“我们一起回家吧！”
一郎回应道：“我还有事情需要处理，你们先走吧。”随后，他迅速离去。
建太观察后指出：“他前往的方向是电脑教室。”
恭介感到疑惑：“都放学了，他去电脑教室做什么？难道有什么特别的原因？”
建太肯定地说：“这里肯定有古怪。”
恭介决定一探究竟：“我们跟上去看看吧！”
此刻，一郎步入了电脑教室，带着些许歉意道：“抱歉，我来迟了。”
日光兽回应道：“一郎，你又迟到了。”
一郎略带无奈的神情，回应道：“刚被老师批评了一顿，还被迫写了一份检讨。”
接着，他环顾四周，“今天只有我们三个人吗？”
叶回答道：“是的，这是我们自己的冒险之旅，我们不应该总是依赖小聪和真司的带领，进入数码宝贝世界。”
听到这里，一郎决定，“那么，我们出发吧，去数码宝贝世界探索。”
叶和小爱异口同声地回应：“好！”
随后，三人打开了通往数码宝贝世界的大门，步入了这个充满冒险的世界！
此时的恭介与建太发现了电脑教室所散发出的神秘光芒，不由自主地朝着光芒的来源跑去。当他们来到电脑教室时，发现教室里空无一人。
恭介望着四周，充满疑惑地问道：“这光芒究竟是何物？一郎究竟去了哪里？”
建太闻声，立刻呼唤道：“恭介，快过来看！”
恭介走近，只见电脑屏幕上的画面令人惊异：“这是通往数码宝贝世界的大门吗？数码宝贝与数码宝贝世界真的存在？”他大声喊道。
建太激动地说：“没错，这就是真的暴龙机！你看，我也有一个。”说着，他从口袋里拿出了银色的暴龙机。
恭介也展示出自己的暴龙机：“真巧，我也有一个黄色的。”
建太兴奋地提议：“那么，我们也去数码宝贝世界冒险吧！”
然而，恭介却有些担忧：“等等，我们不能让一郎一个人冒险进入数码宝贝世界。”
随即，两人将各自的暴龙机对准电脑屏幕，随着一道更加强烈的光芒出现，他们一同消失在了光芒之中。
此时的暴君凯撒，感受到了叶他们三人的到来，内心感到一阵不快：“哼，又是那些烦人的家伙来惹麻烦！”于是，他借助立体影像技术出现在叶三人面前：“你们想干什么？！”
叶愤怒地回应：“可恶，上次你害得我好惨！”随即一拳挥去，然而对方只是影像，叶的攻击只能无奈地穿过。
小爱在一旁提醒道：“这是立体影像，不是实体。”
暴君凯撒嘲讽道：“我看你们这种平凡的近乎愚蠢的人也能进入这个世界真是出乎预料。”
听到此，一郎疑惑地问：“什么为什么？”
凯撒回答：“这个世界应该只有被选中的孩子才能进入。”
叶反问：“那你自己为什么会在这里？难道你也是被选中的孩子？”
凯撒傲慢地回答：“当然，我是被选中的孩子。”听到这个消息的一郎和小爱都感到非常惊讶。
叶继续质问：“那你有什么资格认为只有你才够资格成为被选中的孩子？”对此凯撒的立体影像开始显得不耐烦。此时，巨龙兽突然出现在他们面前，凯撒站在其肩上说：“只有像我这样的完美者才能成为被选中的孩子。”他补充道，“你们三个还不明白吗？数码宝贝世界是我的领地，你们最好赶紧离开！”叶回应道：“你说你是完美的人？”然后向凯撒问道：“你到底想干什么？”而凯撒再次强调：“如果你们再打扰我的游戏，就别怪我不客气！”说完后，他命令巨龙兽发动攻击。
“战斗吧，叶！”蜡烛兽说。
“好！”叶回应道。
“火灵珠，Mega进化！”
“蜡烛兽Mega进化——焱魔兽！”
“这一次我不会在输了！”暴君凯撒说着就拿出暗灵珠：“暗灵珠，将力量赐予巨龙兽吧！”随后巨龙兽变成了一只幻兽型的数码宝贝。暴君凯撒看着说：“巨龙兽Mega进化——蝠龙兽！”（蝠龙兽，巨龙兽借助暗灵珠力量Mega进化而成的混合体幻兽型的数码宝贝，绝招是利用翅膀斩过敌人蝠龙斩）。
叶言简意赅地评论道：“真是个令人不悦的角色。”接着，暴君凯撒下令：“蝠龙兽，出击！”只见蝠龙兽迅速飞至，将焱魔兽轻易地击飞。焱魔兽见状，愤怒地回应：“可憎至极，让我展示炎石冲击的威力！”它召唤出炽热的炎石进行猛烈的轰击，然而，蝠龙兽灵活机敏地避开了所有的攻击。与此同时，焰彩兽高声呼喊：“小爱！”小爱果断地答应：“好！”
“风灵珠Mega进化！”
“焰彩兽Mega进化——天使翼翎兽！”
天使翼翎兽双翼轻展，瞬间凝聚出数道璀璨的弧刃——“风刃”刚好命中蝠龙兽。
“你们不要以为人多就能赢！”暴君凯撒说着就喊道：“出来吧，我的手下们！”随后加支兽、风灾兽、沙鲁比兽、黄蜂兽。
“暗灵珠Mega进化！”
“加支兽Mega进化——黑翼红莲骑士兽！”
“暗灵珠，将力量赐予风灾兽吧！”随后风灾兽变成了一只兽人型的数码宝贝。暴君凯撒看着说：“风灾兽Mega进化——风狼兽！”（风狼兽，风灾兽借助暗灵珠力量Mega进化而成的混合体兽人型的数码宝贝，绝招是双手展开，周围的风积聚在臂膀上，然后用力甩出去，攻击敌人的死亡之风。）
“暗灵珠，将力量赐予沙路比兽吧！”随后沙路比兽变成了一只兽型的数码宝贝。暴君凯撒看着说：“沙路比兽Mega进化——冥狼兽！”（冥狼兽，沙路比兽借助暗灵珠力量Mega进化而成的混合体兽型的数码宝贝，绝招是利用引力引起漩涡的漩涡引力。）
“暗灵珠，将力量赐予黄蜂兽吧！”随后黄蜂兽变成了一只昆虫型的数码宝贝。暴君凯撒看着说：“黄蜂兽Mega进化——天蝶兽！”（天蝶兽，黄蜂兽借助暗灵珠力量Mega进化而成的混合体昆虫型的数码宝贝，绝招是召唤风和雨，风会形成龙卷风，雨则会在龙卷风里面变成利剑砍杀别人的风雨交集。）
“什么！？一共有五只！”小爱看着说。
“一郎！”
“好！”
“日灵珠Mega进化！”
“日冕兽Mega进化——阴阳龙兽！”
当叶三人遭遇暴君凯撒的立体影像之际，在数码宝贝世界中，恭介与建太正漫无目的地行走。此刻，他们的暴龙机产生了反应。按照暴龙机的引导，他们来到了一座山洞内，目光所及，两颗珠子映入眼帘，一颗是黄色，另一颗则是银色。
恭介观察后道：“原来是对这颗黄色珠子有感应！”
建太回应：“我的是银色这颗。”
恭介提议：“让我们模仿大冒险第二部中的情节，拿起这些珠子，看看能否触发什么。”
建太同意：“那我们试试看！”
两人分别拿起各自的珠子，随着恭介的口令：“一、二、三！”他们成功拿起了珠子。随即，两道光芒闪烁，分别召唤出了哺乳类型和爬虫类型的数码宝贝。
恭介惊讶道：“我的数码宝贝是艾力兽吗？”
建太回答：“我的是亚古兽！”
此时，艾力兽开口道：“恭介，我一直在等你，今天终于见面了！”
亚古兽则说：“建太，我等你前来已经很久了！”随后，他们听到了某些声音。恭介判断：“那是叶他们遇到敌人的信号！”
艾力兽提议：“恭介，只要你下令雷灵珠Mega进化，我就能实现进化！”
恭介回应：“知道了！”同时，建太也听到了亚古兽关于“钢灵珠”的提示。
“雷灵珠Mega进化！”
“艾力兽Mega进化——爆电兽！”（爆电兽，艾力兽借助雷灵珠力量Mega进化而成的混合体改造型的数码宝贝，绝招是释放出雷电形状齿轮的闪电·狼牙轮！）
“钢灵珠Mega进化！”
“亚古兽Mega进化——冷龙兽！”（冷龙兽，亚古兽借助钢灵珠力量Mega进化而成的混合体恐龙型的数码宝贝，绝招是从口中射出巨大的能量光束的冰冷光束！）
“我们刚快去支援我们同伴！”爆电兽说。
在那战场之隅，蝠龙兽怒声咆哮：“魔龙啸！”间之风狼兽亦伴随其吼：“狼之怒吼！”当焱魔兽与其麾下三只数码宝贝被定住无法动弹之际，冥狼兽双手深插入地：“地面漩涡！”在焱魔兽和阴阳龙兽脚下，巨大的漩涡涌现，瞬间将焱魔兽与阴阳龙兽卷入其中。天使翼翎兽展翅飞翔，试图躲避这漩涡。然而，天蝶兽振翅释放：“神圣火焰！”准确击中天使翼翎兽。同时，黑翼红莲骑士兽被雷电环绕，发动攻击：“暗·雷霆冲击！”将天使翼翎兽撞击飞出。
“投降吧，你们已无法抵抗！”暴君凯撒嘲讽道。
“怎可能！”叶愤怒地看着这一切。
突然，一颗雷电球疾驰而来：“闪电·爆裂！”直击黑翼红莲骑士兽等五只数码宝贝。紧随其后的是一声震天的吼叫：“龙之怒吼！”使得黑翼红莲骑士兽等五只数码宝贝感受到强烈的压迫。
“一郎！”此时，恭介与建太飞奔而来。
“恭介、建太，你们怎么在此？！”一郎惊讶地问道。
“先别说这些，有话稍后再说！”恭介神色紧张地回应。
“你们居然仍有同伴助阵！”黑翼红莲骑士兽眼神中带着一丝惊讶。
焱魔兽冷冷一笑，挥动焱魔剑发起攻击。黑翼红莲骑士兽毫不畏惧，与之展开激战。
此时，蝠龙兽如闪电般飞向天使翼翎兽，大喝一声：“蝠龙斩！”天使翼翎兽临危不乱，迅速挥出风之剑，成功抵挡了这次猛攻。紧接着，他利用近距离优势，释放了强大的技能：“天使之光！”
在“天使之光”的照耀下，蝠龙兽发出阵阵哀嚎，身形逐渐缩小，最终退化回了原本的形态——一只普通的巨龙兽。更为奇异的是，随着蝠龙兽的退化，其身上原本醒目的暴君凯撒记号也悄然消失，仿佛从未存在过一般。巨龙兽恢复了它应有的模样，静静地躺在那里，一切归于平静。
风狼兽的双眼闪烁着深邃的蓝光，犹如狂风中的锐利之眸，它低吼着：“风之眼！”试图冻结阴阳龙兽的行动。然而，阴阳龙兽迅速反应，其背上的盾牌如风驰电掣般旋转起来，一个响亮的口号响起：“阴阳逆转！”成功抵挡了风狼兽的攻击。
紧接着，阴阳龙兽发射出两枚恐龙克星，一黑一白，它们犹如夜空中的流星划破天际：“阴阳两隔！”与此同时，风狼兽展开双臂，周围的风元素仿佛感应到了它的呼唤，纷纷聚集在臂膀之上。风狼兽借势猛甩手臂，一股强大的风暴之力形成：“死亡之风！”竟将那两个恐龙克星瞬间反弹回去。
与此同时，阴阳龙兽同时发动攻击，它掷出了四种装备，黑与白各半，宛如奏响一首镇魂的交响乐：“黑与白的镇魂歌！”
将其瞬间击溃并退化回原形——风灾兽。更令人瞩目的是，风灾兽身上原本属于暴君凯撒的邪恶印记在光芒中消散，它恢复了原本的纯净与自由。
冥狼兽向爆电兽发射出冰块：“沉滞之冰！”而爆电兽发射出雷电：“电光•闪击！”抵消了飞来冰块。此时的冥狼兽利用引力引起漩涡：“漩涡引力！”企图将爆电兽吸过来给予致命一击。但是爆电兽稳稳的站住了，同时释放出雷电形状齿轮：“闪电·狼牙轮！”随着雷电形状齿轮命中冥狼兽，冥狼兽退化回沙古牙兽，同时沙古牙兽身上的暴君凯撒记号消失了。
天蝶兽向冷龙兽发射出能量标枪：“终极标枪！”冷龙兽一声怒吼：“龙之怒吼！”将能量标枪弹飞。此时的天蝶兽召唤风和雨，风会形成龙卷风，雨则会在龙卷风里面变成利剑向冷龙兽飞来，而冷龙兽在剑命中之际从口中射出巨大的能量光束：“冰冷光束！”刚好命中天蝶兽，天蝶兽退化回黄蜂兽，黄蜂兽身上的暴君凯撒记号消失了。
经过一次不成功的尝试，黑翼红莲骑士兽败下阵来，随后，暴君凯撒果断地作出了撤退的命令。之后，他们与数码宝贝一同返回了现实世界。
走在回家的路上，南原聪和伊达真司及其数码伙伴——经历被叶向恭介和建太娓娓道来。恭介揭示：“原来在我们学校就早已有人被选中成为数码世界的守护者。”
一郎紧接着说道：“是的，南原聪三人成为了三大天使的继承人，而伊达真司等人则是十二星座守护神。”随后，小爱分享道：“小聪他们经历了千辛万苦，成功打败了魔姬兽；真司他们也经历了重重困难，成功击败了黑魔星兽。”
建太坚定地说：“既然我们也有这样的冒险经历，那就更应该齐心协力，共同挑战暴君凯撒！”对此，叶表示赞同：“那是当然了，我们一起打倒暴君凯撒！”