灭族之夜小樱亲历，猿飞响第一次提出宗家分家概念，两人赢下纲手的收徒仪式后，帮助辍学儿童面麻上学，结果小樱又辍学，在学习医术过程中听闻阿修罗对于查克拉是联结的力量的论述而心潮澎湃（查克拉、萤火虫群）。
在给静音打下手时，见到了凯带来的因为过度训练遍体鳞伤的小李，静音表示上次就和小李说过了，不遵医嘱的患者她们是不接待的，然而小樱还是帮了小李，听着小李说他有拼上性命也有去实现的梦想。
猿飞响一直满足父母，没有认识到自己的能力有极限，而父母的期望是无止境的，被刷掉之后，父母立刻收养新孩子。新孩子以为猿飞响和他一样是今天才被收养的，于是带着猿飞响参观他的新家，“这是我爸”“这是我妈”“这是我家”。
父母和小樱知道小樱要走了，和小樱长谈。
三代惊讶纲手居然破例收小樱，为她送去了一些礼物做为补偿，团藏表示小樱不足关注。
静音提前买甜品准备安慰小樱，遇到想搞好和佐辉子关系的红豆，两人谈论三忍弟子的事情。
村里的人惊讶两个徒弟居然都是平民
猿飞响不明白，和小樱长谈，
佐辉子因为要和小樱分别而难过，安慰佐辉子
猪鹿蝶送来通灵卷轴，表示可以通过通灵忍鸽来传
纲手所在的地方的人们惊讶纲手带回来了一个小女孩
离开木叶，师徒三人没有一个认路。
给零用钱，结果是静音给纲手零用钱。
纲手教小樱认毒，寻宝貂立功。
猿飞响去找哥哥，哥哥重病，两人找到纲手。纲手拒绝救治，因为猿飞响的父母曾经在猿飞响小时带着她来求医并且医闹。小樱最终还是救了猿飞响的哥哥，认为亲代的行为不该由子代承担。
转眼间六年过去，毕业考试来临，教三身术（变身术、替身术、分身术），纲手教成了上忍三身术（定身术、瞬身术、隐身术），考试的时候用瞬身术伪装成替身术。
等到忍者学员时期结束，第七班结成。第一忍法帖结束。
结成班级之后，牙跑来找小樱学习作为队长的心得，小樱认识到牙的感情也许比自己想象的要细腻。
波之国遇到白，得知“再度养育自己”的概念，开始思考谁才是自己真正珍惜的人。遇到蛞蝓仙人的分身，一开始不喜欢这种黏糊糊湿漉漉的通灵兽。
小三忍激战白，小樱率先攻击，被击落桥下，佐辉子使用大范围的操手里剑术，被魔镜冰晶躲避，面麻使用螺旋丸突破，正面钳制住白，此时桥下的小樱破桥而出，将白击落，原来小樱是故意被击落，随后就用佐辉子抛出的手里剑带的钢丝停留在桥下，细节秒写佐辉子曾经用钢丝传导火焰，在桥下的小樱用了水遁保护自己，也正是这个细节让白忽略了小樱可能藏在桥下的可能而落败。卡卡西和再不斩对战，使用水龙弹结印时，被小三忍协同结印先一步放出“水遁·破龙猛虎”而击飞，然而反应过来但他立刻就着水流的掩护让释放出水牢控制住卡卡西，然后让水分身拿着斩首大刀去收拾三小只。小樱在面麻和佐辉子双双被击倒后，小樱佯装失去理智去夺刀，两次失败后，第三次直接用身体卡住刀刃，反手和再不斩以伤换伤。
佐辉子三勾。借卡卡西之口表明写轮眼只用强烈的情感刺激，只要足够纯粹，爱比恨更有效。
再不斩被击败后，卡多带着恶势力登场，侮辱白，白雪落下之时
再不斩看小樱三次空手夺刀，有豪杰之风，于是托付与斩首大刀。
波之国，听说人们对宇智波斑的崇拜。知道宇智波斑曾经来过这里，也是他支持了这里的民众，让他们斗争（为了隐瞒这里的求道玉残骸）。开启第二忍法帖。
事后小樱根据先前卡卡西教导自己的时候使用的术威力大于自己的情报识破了卡卡西故意放水在磨练他们。卡卡西感慨，自己还有很多需要向水门老师学习。
回程路上遇到大蛇丸，大蛇丸查询面麻的身体状况，并直言自己不喜欢静止的东西。
蛞蝓仙人的性子慢悠悠的，喜欢观察小樱，并且会感叹，今天的小樱又有不同。
回木叶后，带着斩首大刀去找天天，认为不是特别顺手，想让天天改造。天天答应后，向小樱询问有关纲手的事情，写天天向纲手学习的日常。向猪鹿蝶表明心迹，表示不再会躲在三人身后，会开创属于自己的未来与忍道。
询问佐辉子，得知宇智波也有宗家分家。在讨论过程中遇见雏田，小樱惊讶于自己之前只是简单一说佐辉子要有更多朋友，而佐辉子居然真的会主动去结识雏田，。雏田表示她也在为宗家分家的事情苦恼，讲述了自己与宁次初见的情况。
中忍考试前，小樱带着小李、宁次等人来天天家，大家一起帮天天用钢丝连接忍具。天天最后还是输给手鞠。
中忍考试。凭借第二忍法帖大显神威。十二小强的塑造，凯班为求效率分头行动
大蛇丸告诉面麻，面麻的身份与秘密，只要去问三代火影就可得知。面麻和小樱与佐辉子商量，三人从三代那里得到安慰的谎言。三人遇到我爱罗。
大乱之后，还在养伤的佐辉子被团藏偷袭取眼，迫不得已之下只能叛逃。
天天的努力没有得到回报，被手鞠轻松击败，小李奋而出手。小李擅自把我爱罗归为天才的行为激怒了我爱罗，我爱罗全力出手，不敌杜门小李之后守鹤暴走将其一手一脚扭断。
大蛇丸揭露三代和团藏的关系似乎并非表面上那么简单，还不断暗示鸣门与面麻的关系非同一般。
宁次因为小李和天天被我爱罗重伤而愤怒出手，认为命运不公，在面对雏田时认为“你一个生来拥有一切的宗家，有什么资格说努力改变？”而全力出手，被上忍们阻止也疯狂地认为是宗家的优待
木叶崩溃，小三忍各自通灵出自己的通灵兽，迎战守鹤。佐辉子使用写轮眼控制守鹤，结果造成守鹤暴走，在木叶里大肆破坏，因此开始遭受村民和根组织迫害。
三忍登场，木叶村中的混战一触即发（外村的消息全部被砂隐村切断），纲手因为不想见血于是相对不够活跃，自来也无奈只能在战斗之余担当后勤。三代对决秽土出的初代、二代，被封印在四紫炎阵中。
天天使出操升龙切断砂影补给线。
为了知晓自身存在的意义，面麻决定冲入四紫炎阵。小三忍各自使用通灵兽合力打开缺口，却从三代口中得知了面麻真的是从鸣门身上剥离的负面情感的真相。
此时守鹤追来，见到面麻放出九尾对抗一尾，大蛇丸果断使用斩尸之术让面麻心态不稳，被九尾反噬。并且向面麻宣称她是被剥离的所有憎恶，出生便是错误。面麻心态崩溃叛逃。
木叶崩溃中，佐辉子因为曾经使用写轮眼试图控制守鹤但失败导致守鹤暴走，而被村子里的人诟病，此时团藏因为斩尸之术受到干扰，加上身为本体的猿飞日斩死亡而暴走，出手抢夺佐辉子的写轮眼。佐辉子叛逃，于终结谷亲手斩断一切羁绊，不完全地打开万花筒。
纲手要求小樱在小李的手术中打下手，高强度消耗后，没来得及秀下车，小樱就得知根组织决定将最后的写轮眼控制住，结果激化了佐辉子与他们的矛盾，佐辉子叛逃，觉醒万花筒。木叶崩坏结束，第三忍法帖开启。
佐辉子夺还计划，丁次vs次郎坊，宁次vc鬼童丸，牙（勘九郎）vs左近右近，害怕麻烦的鹿丸一个人留下断后（手鞠）vs多由也，小李我爱罗vs君麻吕
十二小强获得称号“十二新叶”，是对在木叶崩坏时期大规模活跃的十二位木叶新生代忍者的褒奖。
失去九尾、影、写轮眼的木叶村岌岌可危，自来也找到纲手，想让她回到村子。小樱与纲手师徒之间解开心结，小樱表示即便这一次失败，她也会不断向前，不会逃避。（她的回答从没有改变，守护珍视之物，就是她的忍道。）纲手决定回村，使用千手族地中的神树残骸教授小樱木遁忍术。接触到神树残骸的小樱第一次阿修罗的身影，也因此第一次与同样能够与神树链接的带土照面。
于此同时，带着小樱给的通信蛞蝓的佐辉子成为了大蛇丸的爹。
面麻在九尾的指引下找到了四尾人柱力老紫，居住数月后被自来也找到，自来也和面麻一起，跟随着这个顽固的老人学习僧法与尾兽控制。
三年的时光一晃而过。三年修行结束，第四忍法帖开启、结束。
木叶，掌握了进阶程度的木遁，并且可以短暂使用仙人模式的小樱开始筹备救出佐辉子的工作。出关时发现小李因为被救了一条命，和凯老师商议后决定还小樱一条命，于是三年期间都在神树门口苦修。老紫感知到危险将至（晓组织将要到来）于是赶走了自来也和面麻，面麻表示三年之期已到，自己要去救佐辉子。面麻和小樱都认为奇袭更加有胜算。
另一方面，没有借助虚弱期单枪匹马正面解决了大蛇丸的佐辉子决定独自向宇智波鼬寻仇（她也奇袭了大蛇丸，凭借万花筒的幻术和大蛇丸对幻术的低抗性胜利），用蛞蝓联系小樱说自己在解决宇智波鼬后就会返回村子与她共度余生（将蛞蝓留在了大蛇丸的基地）。小樱、面麻、自来也赶到后只收到信息，无奈之下只能返回木叶。在大蛇丸的基地里找到了来自宇智波斑（实际上是带土，后直到其秽土复活前均指带土）的信件，原来木叶崩溃计划时没有外村的联系是因为宇智波斑短暂切断了木叶与外界的联系。
查到宇智波斑与大蛇丸第一次会面的地方，携带着神树碎片的小樱通过居民的描述共鸣到了带土的记忆。原创一个忍村的故事，由小樱等人去发现隐藏在其下的黑暗，故事中的斑做出了正确的选择，但人们没有接受，最终忍村覆灭。插入柱间传授木遁与忍术，结果拥有了力量的人却开始争斗，最终柱间亲手结束木遁遁历史的故事。
从老紫获得血继限界和大蛇丸的研究资料中获得开发血继的可能，血继的诞生和尾兽的诞生有异曲同工之妙，都是自没有性质的查克拉中诞生的特殊能力。第五忍法帖开启。
想要找到佐辉子，必须找到宇智波鼬的动向，宇智波鼬隶属于晓组织，纲手告知小樱在砂隐村出现了晓组织的成员，动用火影关系，让小樱与面麻、佐井一起，跟随卡卡西前往砂隐村。
赶到时遇到中毒的勘九郎，千代直言除了纲手无人能解此毒，小樱解毒并制造出了解毒剂。追击过程中遇见赤砂之蝎阻挠，与千代一起对战，让面麻和卡卡西率先离开。后来使用蛞蝓追上面麻，合力击伤迪达拉，让迪达拉自爆逃走后。追踪着迪达拉，与同样追踪迪达拉想要知道鼬情报的佐辉子相遇。佐辉子击杀迪达拉后没有回答小樱的问题便离开。
因为我爱罗的“死亡”，小樱开发出封印并让渡部分阴阳查克拉的术，用以在必要时刻救助尾兽（主要是面麻）。
回到木叶的小樱得到猪鹿蝶正在与晓组织成员战斗的情报，留下正在修行的卡卡西和面麻，独自前往支援。首战因为对方对木遁过于了解而吃瘪，但还是强开仙术救下了阿斯玛。救下了二尾和由木人。研究二尾的作战方式后，意识到查克拉即便是对立的性质（冰冷和炽热）都能联结在一起，开始思考是不是将对立的性质结合起来就能更容易创造性质，创造出将两种对立性质结合，瞬间爆发出强大力量的战法。第六忍法帖开启。听说二尾曾经见过自称宇智波斑的男人，但只是听说。根据二尾的线索去往小忍村，发现宇智波斑曾经来过这里，他用武力解决了这里的问题，但没过多久，问题再度出现，忍村覆灭。
此时晓组织抓捕尾兽的图谋已然暴露，为了更好的保护面麻，自来也决定让鸣门带面麻去妙木山修行，自己则去雨隐打探晓组织情报。小樱认为晓组织追寻尾兽，佐辉子追寻晓组织，那么自己追寻尾兽就能见到佐辉子，于是按照面麻的描述前往寻找四尾老紫。见证了四尾大战三尾，与控制三尾的宇智波斑（带土）第一次交手。带土见势不妙，让鬼鲛带着四尾，自己带着三尾从不同方向离开，结果鬼鲛被小樱、卡卡西以及后来赶来的凯击败，只能带着老紫缠绕着查克拉的右手离开。
老紫被接到小樱的花店疗养，提供给了小樱六尾的情报。根据老紫的能力创造出用查克拉包覆身体的战法。第七忍法帖开启。
在连续受挫后，佩恩决定主动出击。
六尾人柱力羽高被佩恩击败，押送回雨隐村，小樱通过蛞蝓联系了自来也，却发现双方口中的三个佩恩并不对应，于是得到了佩恩至少存在四个的情报。自来也开启仙人模式激战佩恩六道，小樱使用木遁乱入，由羽高使用尾兽玉打开局面后，小樱使用木遁的封印捕获男畜生道，三人逃遁。六尾入驻花店。在羽高身上学会了随意转化身外查克拉的战法。第八忍法帖开启。听说了羽高所说的宇智波斑的事迹，但赶到当地时却发现当地已经被屠，发现了羽高故事背后的真相，小樱发现黑暗的忍村是被宇智波家的术屠灭的。
佐鼬会战，鼬的万花筒刚刚好被版本更新后的佐克死，佐的新万花筒设定为一只加具土命，一只布都御魂，一只操控火焰，一只操控幻术。
长门妖言蛊惑面麻只身赴死，逼得樱佐和自来也强袭雨隐村来救面麻，然后等雨隐几人鏖战正酣时，用畜生道通灵自己，与早就部署在木叶附近的晓组织残部集合。
缺了艺术组的晓组织集合打团，想先拿下只有纲手守家的木叶。
十二小强的塑造（分班迎战S级叛忍）
小樱立刻使用禁术回到木叶后率先迎击，佐辉子随后赶来，面麻最后到来，新三忍激战佩恩。
西部战场，猪鹿蝶加凯班迎战不死二人组。
南部战场，卡卡西带着红班迎战小南。
东部战场，带土由于了解到鼬先前已经跟佐接触过，于是决定亲自跟着鼬与鬼鲛。在鼬果不其然再度跳反，使用天照攻击带土后，交代鬼鲛离开并尽可能收集情报。
鼬不敌带土。在带土击败鼬后，考虑到鼬的特殊性，决定回收他的万花筒，但就是这一个停顿让鼬抓住机会释放了别天神。
原来鼬一开始就只携带了一只止水的眼睛，一开始使用的天照是早就封印在卷轴里，由远处的影分身释放的，就是为了误导带土，让他以为鼬身上有三只万花筒。插入佐在战场上使用天照登场的描写。
阿飞帮带土挡刀，但是来自阿飞的反噬还是逼得带土离开战场。
新三忍击败佩恩说服长门，长门发出“原来我不过是另一个山椒鱼半藏，而现在又要将你们称呼为新的三忍”的感叹，发动轮回天生
万物复苏，但佐辉子对着团藏发动奇袭后再度离开。
新三忍结成后，面麻还需要前往另一个大国（待定）进行中忍考试，七尾登场。带土出现抢夺七尾和九尾，宣称已经拿下八尾，要在此拿下七尾九尾，发动忍界大战。然而带土被新三忍以及赶来支援的二尾、四尾、六尾、七尾进行了正义的七打一逼退。七尾加入花店，小樱学会赋予创造物生物性质的战法。第九忍法帖开启。宇智波斑（带土）正式登场。
为了探明八尾被抓的真相，小樱决定参加五影会谈。小樱身后的火影，风影我爱罗，雷影均同意主动出击。
云影村，佐辉子与八尾相坐而谈，带走八尾的尾巴去交差。带土为了增强战力与药师兜联手，发动秽土转生与白绝结合陈兵压境。
小樱带着面麻去寻找奇拉比学习完美人柱力模式。在奇拉比和八尾身上学会赋予造物生命，彻底超出凡人的境界。第十忍法帖开启。
战场上，十二小强的塑造
猪鹿蝶+猿飞日斩vs猿飞佐助，佐辉子到来。
新三忍大战带土，在佐辉子的幻境世界里，带土看见自己留存于木叶村的归处后破防、吸收十尾变成六道模式，凯李双八门击杀六道带土，小樱佐辉子得到阿修罗因陀罗传承。黑绝控制带土使用轮回天生，宇智波斑吸收十尾变成六道模式。新三忍迎战宇智波斑，辉夜降临，四万万忍者共抗外星人，以九尾查克拉为纽带，以阿修罗因陀罗的查克拉为主体，世界上分散的查克拉终于再度联结，人们再度共享了喜怒哀乐，仇恨化解。
失去归所的人柱力们齐聚一堂。尾兽们不在被束缚，成为了神庙的守护兽。
小樱回家开花店。佐辉子成为第一任宇智波火影。面麻和鸣门带着自来也在此行走世间，做个不羁的浪子。
此外，还有一些没来得及做成细纲，也就是没来得及和细纲一起被删的备忘录。顺序自上而下
