深海旗舰拥有着改变气候的力量，每当深海旗舰所积攒的深海能到达一定程度后就可以通过庞大的深海能将领地周围的气候改成乌云密布甚至大雨滂沱。 因为变化的速度相当的突然，所以这种不正常的气候变化往往可以用来判断深海旗舰的大概方向，尤其是当它们靠近镇守府时，你可以看见天空如同移动般朝你袭来，这种情况也是最危险的情况。 这意味着深海旗舰已经到达了你所管辖的初级海域，不仅是城镇居民需要躲进防空洞避难