“妈妈？”碇真嗣目瞪口呆地看着面前出现的女人。眼前的不是别人，正是他那已经十年没有见面的母亲——碇唯。
碇唯慢慢地从下方漂上来，用手捧住真嗣呆滞的脸庞，颇有感慨地说：“小真，好久不见，你长大了呢。”
这时真嗣才从与母亲的久别重逢的惊讶中反应过来，他慢慢地抬起双手，握住碇唯捧着他脸颊的手。直到手上传来了真实的触感，他才真的确定眼前的女人是自己的母亲。
他向前用力抱住碇唯，眼睛里的泪水止不住地往外流。他哭着说：“妈妈，我好想你！你知不知道你不在之后，父亲他就不管我了，留下我一个人生活。他还让我驾驶初号机与使徒作战，真的很可怕！现在又变成这样子，大家都消失不见……”
碇真嗣抱着碇唯一边哭，一边诉说着这么多年来受到的委屈。而碇唯则是一边听着真嗣的哭诉，一边用手轻拍他的背来安慰他。嘴里时不时说着“嗯”“知道了”“没事了”等话来回答他。
过了一会，真嗣的情绪平复了下来。思维也重新变得清晰，这时他的心里涌现出许多问题，他这么想着也这么问了。
“妈妈，你为什么会在这里？父亲不是说你已经去世了吗。还有这一切都是怎么回事？为什么初号机会变成这样子……”真嗣的问题如同机关枪似的向碇唯扫去。
“小真，你的问题太多了，你慢慢说，妈妈一个一个的向你解释。”碇唯宠溺地摸了摸真嗣的头。
然后碇唯就将这一切事情的起因经过向真嗣细细道来。
“在2000年，人类在南极发现了……”
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“所以说这一切都是计划好的？都是为了那个人类补完计划？就是因为这种原因把大家变成LCL？太过分了！”真嗣在了解一切之后，表示不能理解。
“是的，一切都是Seele计划好的。我发现我无法阻止这一切，所以我主动与初号机融合，成为初号机的灵魂。只有这样做，我才能保护你。”碇唯碇唯微笑着看着真嗣。
“妈妈……”真嗣张了张嘴，不知道说什么。因为碇唯为他的付出代价实在是太大了。
“小真，不要在意这个，这是我身为母亲应该做的。如果我不这样做，我们现在也不能再见面，不是吗？”仿佛看出了真嗣的心中所想，碇唯安慰道。
碇真嗣低着头，心里不知道在想什么。
“所以说小真你现在想回到原来的世界里去，是吗？”碇唯问道。
“是的，这里什么人都没有，这个不是我想要的世界，我想和大家在一起。”
“是嘛，那小真你现在就准备回去吧。妈妈送你回去。”碇唯笑了笑说。
“怎么回去，现在大家都……”碇真嗣话还没有说完就被碇唯轻轻向后推了一把。然后碇真嗣就越来越快地向后退去，同时他的周围也出现了许多他经历过的画面和场景，只不过这些画面都在飞速地后退。
看着离他越来越远的碇唯，真嗣明白了一切。这是碇唯在利用已经成神的初号机让他回到过去。
“妈妈，你……”
“不用在意，小真。我们很快就会再见面的……”碇唯微笑着向真嗣说道。
随着真嗣倒退的速度越来越快，真嗣的意识也渐渐变得模糊，随后他的眼前一黑，失去了意识。
同时，这片世界也回归了沉寂。