【故广介】男16岁-帝国暗部（至高派）试验品，潜入型基因强化人（新人类）编号SZSC01，其家人父母和弟弟妹妹都是帝国安插在身边的间谍，负责监视试验品的生活情况。
自幼便与隔壁家的唐挽歌是青梅竹马，两人实力相当经常一起玩耍，之后也在唐挽歌家火灾事件时发现自己与常人不同的治愈能力和身体素质，再加上被在家被监视时的不安感，广介从此便开始暗中收集自己的真实身份，初中时结识智浩然，两人很快成为好兄弟。
后在学院与雨珍相识，两人从前后辈发展为朋友，共同经历多次危机事件后成为友情越位，恋人未满的状态，在远征前夕两人相约如果能够活着回来就互相表白，远征后雨珍被俘后“自杀”，广介也从帝国士兵口中得知星球真相，自知已经已无退路的他，选择了前往帝国抵抗军所处的星系，将与第二部男主角开始新的故事，他将开始复仇。
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【唐挽歌】女17岁-帝国暗部（至高派）试验品，寄生机械与生物胚胎的融合体（赛博格）编号RDST01，其父母与广介的父母是同事关系，都是负责假扮夫妻来日常监视实验体，不过与广介不同的是，唐挽歌的父母是真心相爱结婚，并在唐挽歌8岁的时候打算带着她一起逃离哈尔星。
可是后面事情败露唐挽歌的父母也被L所杀，在大火吞噬住所之前故广介将唐挽歌解救出来，从此唐挽歌便对广介他心生爱慕，因为失去父母，在此之后唐挽歌便住在姑姑家，一次深夜偶然在姑父姑母谈话时偷听到了哈尔星的真相，知晓远征真相的唐挽歌也是将其埋藏在心中，只希望在这最后的一年时间能一直和广介在一起享受日常生活，因为此刻的广介已经是她活下去的唯一希望，与雨珍相识之后，也是逐渐对广介放手，在远征时期独自撞击帝国舰队指挥舰后生死不明。
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【本堂雨珍】女17岁-奈卡格勒（哈尔星幕后总统）之女，自幼起便与妹妹被父亲区别对待，导致其母亲去世后性格愈发残暴。在贵族学院无恶不作多次联合起来欺压同为贵族的安妮，在故事前夕被入侵到房间的L所控制，由此产生了一个想要参加远征，心地善良且聪慧与坚韧并存的新人格。也是因为性格的突然转换，雨珍擅自离开了贵族学院转入了哈尔第三学院，之后在L的诱导下与广介相遇并与其成为朋友。之后被雨珍心中执念所感染广介也是决定帮助雨珍，两人参加军部选拔成为搭档，后面也是在舰队总部选拔时击败自己的妹妹，而和广介获得了正式的远征特殊机密任务的资格，之后与广介的朝夕相处中也产生爱意，后在远征中被俘审问时，被L控制吞下毒胶囊后咬舌自尽，濒死之时也回忆起来了自己的曾经，知晓了自己只是被制作出的一个人格。
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【智浩然】男17岁-帝国境内莱恩集团所制造的合成人，因为莱恩集团与隐藏在帝国内部的（至高派）是敌对状态，所以当莱恩集团得知（至高派）在哈尔星进行秘密研究时便派出了新研发的合成人（编号0092），独自一人生活一直到在初中时结识广介，后面因为与唐挽歌和雨珍以及故广介的朝夕相处中逐渐觉醒了情感与自我，并在此期间多次用自己的力量暗中帮助众人化险为夷，知晓L的存在。
在远征前夕邀请广介出来打棒球实际是想向广介坦白，只是在刚开口的时候，被L所控制的卡车司机撞下悬崖，之后在无法动弹之时也是将自己所收集的颗解开一切真相的硬盘交了广介，就在浩然嘱咐广介不要参加远征之时，L赶到偷袭了广介将其打晕，身负重伤的智浩然紧接着被L补刀所杀。
而苏醒广介已早已被L清除了与智浩然相关的的记忆，同样的智浩然在学院的存在也被完全抹消了，至于那个硬盘则是被广介的弟弟妹妹所销毁。
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【如月幸子】女39岁-（狼兽人）帝国反抗军势力（曾隶属于嗜骨兽人联合高级特工），后面因为其父母在支持组织内高层的权利斗争中落败，而后为了躲避新上任的首领的报复，选择来到哈尔星与大量同样遭遇的兽人隐居。如月幸子在校园结识了后面的平泰校长，与温泉旅馆老板陆田，3人成为朋友会坚持教训周围的不良团体，很快就打出了名声，之后的一天（哈尔星大筛查事件）后如月幸子的父母以及剩余的同胞都被哈尔星帝国总督府所杀。拼死抵抗后，幸子也是与前来帮助兽人们的奈卡格勒相遇，在一番交流后，幸子也是答应了格勒的要求，接受他的保护，为了避人耳目也是成为格勒家的女仆，后为了不连累格勒家与被嗜骨组织派来的两名杀手同归于尽。
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【奈卡格勒】男54岁-哈尔星贵族，（哈尔星幕后总统），从小立志将哈尔星再次独立，摆脱帝国总督府的控制，为此创立了奈阳课作为自己的秘密组织暗中为下一次反抗积蓄力量，其妻子是哈尔星远起义领导人家族的旁系末裔，两人孕育出本堂雨珍和奈卡优子后，格勒议员也感染了基因病毒时日无多，但是他无怨无悔，只为替自己的祖先赎罪。主导建立了哈尔星的地下海底避难所，并且吸纳了大量哈尔星议会内的官员，成立了哈尔星独立委员会，并逐渐削弱身为宗主的帝国总督府控制力。
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【奈卡优子】女，17岁，雨珍的双胞胎妹妹，奈卡格勒的指定接班人，从小便接受格勒的教育要光复哈尔星。知晓帝国与银河的政治局势，在母亲去世后也逐渐开始学习姐姐的残暴傲慢的性格，后与格勒议员培养的少年保镖经历许多事情，逐渐回归正道，知道雨珍被改变性格的真相。后子父亲去世后接手其秘密总统职务。在此之前优子也在其父亲格勒的授意下，独立创建了一个名为绿萤的组织，与许多的民间人士和远征老兵都有所往来，主要是从中协调以防止这些人做出过激的行为，避免加剧帝国对哈尔星的警惕。
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老兵协会，与女主角妹妹优子是合作关系，温泉老板也是校长和幸子的同学，按照以往的时间线，他应该是继续潜伏，直到因病去世。但是在本作的故事线，他临时起意，策划了度假岛酒店劫持事件。在被重重包围，感觉独立无望后，为全体学生谢罪自杀。
嗜骨兽人联合为什么敌视哈尔星，因为哈尔星要独立当初，嗜骨也是派了一批精锐部队的，但刚到就被哈尔星叛徒出卖，几乎全军覆没。被坑了的嗜骨对后面的他们自然是没有好脸色。
以下按照权利排行
L》帝国总督府（荣光救赎派）》IOY机构》格勒秘密总统》圆桌贵族议会》哈尔星舰队总部》哈尔星百人议会》哈尔星各高校领导》哈尔星各地贵族》哈尔星平民
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莱恩联合实业，是帝国最大的、航空舰船、路战武器、各类军需品制造商，同时控制着帝国多个星系以及地区的稀有矿物。
该公司研发的合成人，拥有帝国境内最先进的技术，各个类型的合成人可以执行任何任务，但同时该公司暗中为了节省制造成本，其中大部分合成人的中央处理器，实际上都是用人类的大脑来代替的。
莱恩联合实业手段十分黑暗，它们在帝国各星都建立有母公司，其中又成立了许多借贷公司，其目标人群都是刚刚毕业的年轻人。
通过对借贷人的生活的强势干预，来导致其丧失还款能力，在通过因对方违约无法还款，而将事态扩向其身边的人，利用舆论来将借贷人逼入绝路，然后在伸出橄榄枝和对方签订双方“自愿”身体捐献协议。
在对生活丧失信心后的借贷人通过各种手段的自杀后，莱恩联合实业将会立刻回收其遗体，取出大脑来进行合成人的生产。
当下的局势莱恩联合实业已经从科技公司开始向割据势力方面转换，他们已经通过收买，威胁，暗杀，培养，等方式控制了许多帝国星球政府机构，并且暗中发展出了听命于自己的武装部队。
也是因为对人类平民如此出手，和作为帝国皇帝的强力支持者，莱恩联合实业已经被人类至高的（荣光救赎派）认定为头号对手，是必须毁灭的存在。
双方围绕对方都在不断的进行破坏和干扰，而听说荣光救赎派正在哈尔星上进行至高新人类研发的实验后，莱恩联合实业也派遣了一名商业合成人间谍前往哈尔星，隐秘监视荣光救赎派的研究成果。
这名莱恩联合实业的商业间谍自然就是广介的好兄弟浩然，毕竟是用人类大脑来控制，所以即便已经失去了作为人类时的记忆，但是作为人类的情感是很难磨灭的。
而在之后的时间里，这样感情与记忆觉醒的情况还会继续出现，但这就是接下来几部的剧情了。
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荣光救赎派是由帝国内一群人类，猫人青年军官，教师，财阀，以及各界社会人士组成的群体，其目的是从皇帝埃德加手中解放全人类，让人类完全独立以及消灭其他种族的异端，让人类真正的成为银河系的统治者。
原本的帝国在皇帝的统治下征服了其他异端种族，一直将其作为奴隶使用，但是突然某一天皇帝突然迎娶了作为异端精灵族的大公主，大婚后皇帝与皇后发布了许多改善异端社会地位的法律，让异端从奴隶获得了与人类的平等的权利。
这一时期帝国获得高速发展社会和谐，被后世称之为镀金20年，而随着作为皇帝的埃德加年事已高对帝国的控制开始衰弱，在到20年后身为精灵族的皇后被暗杀（荣光救赎派）以及帝国王子黎阳的失踪，这一件导火索的发生彻底动摇了皇帝的统治地位。
同时各殖民地的政府在被荣光救赎派收买后，也开始对皇后的异端平等政策阳奉阴违，进行了对定居的异端进行排挤利用舆论宣扬对异端的仇恨，剥夺其身份和财产等方式驱逐异端。
这直接再次激化了人与异端的矛盾，第二次异端独立战争开始了，各族异端分别各自建立了抵抗军开始反抗帝国。
与此同时潜伏在暗中的荣光救赎派借此机会也开始了急速扩张，经过多年的潜伏，现在的荣光派已经控制了帝国四分之一的疆域版图以及大量舰队，荣光派宛若寄生在帝国内部的蠕虫一般在不断的强化着自己，相信在不久的未来，当其破茧而出之时也将与皇帝的势力展开生死对决吧。
这里要说明白一点荣光救赎派虽然是为了人类种族而奋斗，但是他们对于人类的定义有些不一样，他们口中的人类是指精英阶级与平民，例如天生残疾的儿童和更加低贱的劣质人类并不在他们的保护之下。
而且哈尔星也是荣光救赎派用来测试新研发生化武器的实验场地之一，因为哈尔星一开始独立反抗帝国皇帝的时候并不是为了人类的独立而战，而是为了包庇被排挤的异端们，也就是说他们实际上是异端的支持者。
更加令荣光救赎派感到失望的，就是对皇帝埃德加俯首称臣的哈尔星傀儡政府，和那些明知道一切却仍然将孩子送上战场，为帝国壮威的哈尔星居民，在救赎派的眼中已经不能称之为人类了。
因此荣光救赎派高层已经将哈尔星定义为人类的敌人，也是必须要一起跟皇帝毁灭的存在。
IOY机构原本是由帝国命令在哈尔星研发各种病毒的实验机构，为了在未来的生化战当中发挥作用，所以帝国赋予了他们很多特殊权限，其中就包括可以使用平民来实验的权利。
而随着荣光救赎派不断对帝国势力的渗透，此刻的IOY机构内大部分的研究院和管理都已经暗中加入了荣光派，为该派提供各种强力生物武器，其中也包括通过胚胎基因强化技术培育出来的强化人类，也就是至高新人类计划。
将人类全体从肉体方面来升格为可以匹敌异端的新种族，也是荣光救赎派的目标之一。
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神秘人罗生，也是称呼为L，在帝国和荣光救赎派双方都拥有极高的的权限，是一人之下万人之上的人物，他与皇帝的关系是互相利用的关系，而且他也在暗中为荣光救赎派提供帮助，所以荣光救赎派也很乐意为L提供帮助，另外其实皇帝和荣光救赎派都不起不清楚L的真面目。
当下根据目前的故事只知道，L是来自于未来，他所做的一切都是为了让这个世界的结局走向他所属未来的世界。
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在这里解答几个疑问，在南国小岛劫持案，那群退伍老兵为什么不告这些学生他们的真实目的。
第一，因为你们是恐怖分子，学生们不可能平白无故的相信你们的话。
第二，就算告诉这些学生，而他们也真的信了，那也未必是好事，他们也很可能会被后来的政府关押起来。
甚至灭口。至于我为什么要安排这么多的旅游情节。其实也是因为这个星球政策，但凡是要参加远征之前的毕业生，学校必须要安排三场到次以上的旅行慰问，毕竟是一帮马上要去送死的学生了，国家也有义务让他们好好享受短暂的人生。
而为什么幸子面对两位兽人化的除叛者自己一开始不选择兽化，反而要以人类的形态应战。
第一，幸子长时间不兽化所以已经生疏了很多，并不能保证兽化后会拥有优势。
第二，除叛者虽然实力很强但是大部分任务都是对内部进行的，所以他们面对兽人化的敌人拥有很大优势，反之面对体型娇小不少的人类敌人会有些麻烦。
第三，幸子不希望暴露兽人身份，如果她是以兽人的姿态死去那么很有可能和会引来帝国总督府的注意，会给格勒议员增加不必要的麻烦。
第三，尽可能的麻痹对方，好在关键时刻给予对方致命一击。
这还要说一点，为了让哈尔星彻底失去战争潜力，帝国也是将哈尔星的卫星月亮击碎，而失去月亮的调节哈尔星潮汐也变得不规律，百米高的潮汐逐渐吞没了哈尔星广阔的肥沃土地，使得其粮食再也无法自给自足，完全依靠帝国在暗中输血。
这也意味着，帝国要真的想灭了这颗星球只需要断粮就行了。
这里在说一下，其实各族异端对哈尔星并没有什么好感，因为在哈尔星宣布独立之初各异端也也给予了很大的帮助和战斗人员，结果突然就被哈尔星政府内部的叛徒出卖。
原本预定的反抗行动顿时失败，而那些前来支援的异端也被帝国消灭，所以这可以说是把各异端反抗军坑的很惨，所以此刻的异端对哈尔星现任傀儡政府的态度很微妙。
第一部的故事结尾，帝国调集大部队回防也是因为异端以及建立了一个反帝国同盟即将对帝国发起全面进攻，联盟的起因是因为帝国设下陷阱将兽人联合的大公子高调的杀害了，复仇心切的兽人联合接受了精灵王的邀请，两方即刻建立联盟，从而吸引了更多的小抵抗军成为一个超级同盟，对帝国发动进攻。
而这也是皇帝埃德加的目的，因为当时的帝国内部，荣光救赎派很快就会发动对帝国的皇帝的全面进攻，帝国即将即将陷入内战，在这个时皇帝通过高调杀害兽人联合的继承人，来让异端势力团结起来进攻帝国。
这就制造了一个强大的外部敌人，也让荣光救赎派暂时放弃了和皇帝翻脸的想法，毕竟荣光救赎派的目的是消灭皇帝解放人类，要是现在和皇帝打的你死我活，让打过来的异端捡便宜就得不偿失了，所以荣光救赎派和皇帝也是暂时和平开始抗击异端同盟。
第一部的故事主要是讲述男主角广介的故事，和间接将该宇宙的世界观揭露出来为接下来的几部故事做铺垫。
在第二部的：《银河王子伊甸梦》第一部的男主角故广介将会成为男二号，而第二部男主角也将变为人类帝国的王子黎阳，两人很快就会相遇并且成为挚友，共同反抗已经扭曲的帝国，也将在结识更多的同伴，开始新的征途，为了实现那看似不可能的目标！
第一部，用一颗星球来解释大致的星际背景，和帝国的残暴，用一年的时间塑造一个可怜的男主角出身，拥有复仇愿望，结局加入反抗军，这颗星球也即将在几年后面迎来灭顶之灾，这些都是为之后部做铺垫。
第二部，帝国王子的反叛，王子发誓要为自己被害死的母亲复仇而逃出皇宫，2男主隐姓埋名加入抵抗军然后认识第一个男主角，两个人成为搭档，在抵抗军接任务各个星球开展故事，同时暗地里1部男主也是在暗杀帝国官员复仇，在此期间两个人也是结识了其他种族的抵抗军或中立商人的伙伴，大致6-7人成为一个初步的主角团，然后脱离抵抗军，然后在神秘人的帮助下窃取了一艘帝国方舟，开始成为一支独立的银河势力。
第三部，从帝国王子的远方精灵妹妹的视角开始，两个妹妹天涯相隔，大妹妹因为一些原因加入了帝国特工部门，而小妹妹因为2男主当初的一个决定被卖到大型都市富豪18禁星球当奴隶，大妹妹将作为特工接受任务潜入主角团方舟，最后与其相认，2男主在此之前也是发现了自己当初居然把妹妹卖了所以也独自杀到那颗星球把妹妹救了出来，但是回来的路上被追杀掉到沙漠星球和妹妹荒野求生，开展一段时间的冒险故事，然后还认识了1部星球的幸存者，在他口中得知了1男主的出身。
之后回到方舟的后，主角团的组织也是到处开展行动，反正这段故事剧情相当的多，在此期间1男主也是帮助正在被攻击的自己家乡，具体的剧情相当于星际版三国演义。不是一句两句可以讲清的，反正就是帝国势力和其他反抗军势力和主角团的恩怨情仇，以及各个角色的关联和番外。
第四部：帝国的黄昏开始，一个强大的势力觉醒，开始灭绝所有生物，再加上帝国皇帝的驾崩（被2男主杀，和人类独立派的反叛，帝国开始分崩离析，主角团他们和反抗军和部分帝国军组成联军去打这个天灾，但是没打过，最后只有主角团他们在付出巨大的牺牲后，才带着方舟逃离天灾区，开始横跨这个银河系前往一个传说中的伊甸和平星系。
第五部，方舟抵达目的地，但是发生不可控事件，主角团除了2男主之外全部死亡，2男主角发现方舟已经抵达目的地，但是该星球外部有压制记忆的护盾，2主角一落入星球就失忆了，然后成为一名普通的高中生，然后被召唤到异世界，同时还召唤了其他12个人，让他们成为异世界的国王，然后决出胜利者，来神之塔见自己。
最后2男主在征途之中也是慢慢的找回了自己的记忆，发现这个所谓异世界没有那么简单，最后在杀了那个神之后才发现，那个神正是1男主的克隆体。
原来当初方舟抵达目的地星系后只有两个鸟不拉屎的星球，全员失落，但是根据预言1-2男主角用来神秘药物进行了改造，然后1男主发狂杀了主角团的大部分人（内也有帝国皇帝的间谍搞鬼），方舟只剩下休眠仓的几十亿人，而2男主注了药物后就开始休眠，被人用逃生仓发射了出去。
然后1男主恢复理智后生命也所剩无几，就向方舟AI发号命令，希望它可以帮助处理这些难民，永远和平。
方舟改造了星球，然后吧休眠仓内难民全部克隆，然后用一座高塔进行意识连线，相当于没有记忆的玩游戏。
同时方舟还为了不让他们爆发大规模战争还限制了他们的科技等级。
然之后AI也克隆了当初主角团的所有主要成员，将他们包装成为神，让他们监督这颗星球。
但是时间一长和克隆体没有当场记忆的缺陷，基本都疯了，开始为非作歹，星球变成修炼场，但是1男主的克隆体开始恢复记忆，然后意识到2男主角是解放这颗星球唯一的希望，这才杀了所有的克隆体，给2男主搞了这么一场恢复记忆的异世界旅途。
现在恢复自己的2男主，也是回到了方舟，并且用自己的力量重新改造了两个星球，一颗地球一颗月球，然后2男主开始自爆，说自己终于成功了，杀了父亲，消灭了反抗军，和自己争权夺利的同伴也都死了，而方舟和这几亿人的遗产都是自己的，正当2男暴露真实目的的时候，一直陪伴在他身边的一个AI妹妹（不是精灵两妹妹）却了他一刀（神器必死伤）原来皇帝当初虽然死了诞生人家点了机械飞升，直接附体在了AI妹妹身上一直在男主身边。
并且还说，自己从近千年前就开始计划这1-5的部的所有故事了，因为他当初根据有关神器的演算只有这样他才从最后的大灾年中活下来，现在他杀了2男主，自己将可以重新开始一切。
不过后面还是被男主角反杀了，这里的剧情其实是靠第三部里埋的一个伏笔翻盘的。
第六部：基本就是算活下来，但是又不算活下来的黎阳，克隆了一个新的自己，并且帮他回到过去，去充当那个神秘人帮助皇帝进行各种准备，把刚刚主角团集齐，来维护历史的轮回。
不过这个克隆体却从无尽的轮回当中觉醒了，开始寻找真正的幕后BOSS，并且成功把这个历史开辟出了一个新的未来，一个美好的和平的星际时代，所有的角色都拥有了美好的生活，但唯独黎阳牺牲了自己，因为他本身就是诞生于皇帝的阴谋，如果没有阴谋那么他也将从一开始就不存在了。