在下水道的最深处申次郎发现了等离子团扎营的痕迹，好几架排放建筑废料用的装置放在附近，看上去才刚切断电源没过多久，装置的外壳上还留有工作时的余温。
继续向前进，在现代化的下水道结构中一个硕大的洞口突兀的出现，一旁还堆积着没来得及处理的沙与泥，以及被撬碎的砖块。
毫无疑问这是等离子团的杰作。
“脱壳忍者，依旧拜托你了。”
脱壳忍者点了点头，进入了洞穴之中。
这是申次郎一直以来惯用的手段，脱壳忍者无声无息，难以被发现，只要通过它随身携带的摄像头就能安全又隐蔽地获取信息。这条黄沙构成的隧道并不长，经过了大约八分钟，脱壳忍者就到达了另一端的出口。
“脱壳忍者，用潜灵奇袭确认一下出口的周围。”
接到命令，脱壳忍者立马潜入了阴影之中，在这段时间里摄像头会完全失去作用，只能看到一片深沉的黑暗，但同样，处于这个状态的脱壳忍者几乎不可能被发现。过了一阵，脱壳忍者从潜灵奇袭的状态中脱离，摄像机也在同时恢复了画面，它已经钻出了刚刚的隧道，进入了一片新的区域，这里满地狼藉，周围洒落着各种残破的古代建筑。
脱壳忍者降低了悬浮的高度，在地上划出了一个小小的×字符号，接着将头顶着的摄像头对准了地面，可以清楚的看到地上还残留着脚印与拖拽的痕迹。
“是等离子团留下的痕迹，这是要去哪里，前面还有值得探索的地方吗？脱壳忍者先别再往前了，等我们汇合。”
申次郎带着宝可梦穿过隧道，与脱壳忍者成功汇合。他地打量起周围的环境，无论怎么看这里都不可能处在飞云市内，黄沙遍布，建筑腐朽，完全是一片废墟，等离子团在打通隧道就是为了来到这里？他没能弄清楚等离子团真正所求为何，但无论是什么，他都有理由阻止等离子团的计划。
“以欧路普，你感应一下这里也没有阿缇先生的痕迹。”
聪慧的甲虫摇了摇它巨大的脑袋，阿缇的气息在进入了隧道之后就完全断了，在这里它什么也感应不到。
“没有，那意味着至少阿缇先生没落在等离子团的手中。脱壳忍者，又到你表现的时候了，不过很可能等离子团已经设好了埋伏，大家做好掩护脱壳忍者的准备。”
看着申次郎严肃的眼神，宝可梦们也绷起了神经，反倒是脱壳忍者依然是静静地点了点头，然后悬浮着进入了深处，只不过预想中的战斗并没有发生，在那片废墟之中没有任何等离子团的身影，有的只是一座通往下层的阶梯。
甚至在阶梯的上方还可以听到来自下方的声音。
“怎么了？那个卫星头明显就是个骗子！也不知道他究竟了是做了什么才让魁奇思大人相信了他的研究！”
卫星头？魁奇思？这些人指的是谁申次郎并不清楚，但他能听得出声音的主人十分气愤。他看向脱壳忍者，它也在同时看向自己的训练师，一人一虫十分默契地互相点了点头，接着脱壳忍者使用出潜灵奇袭，只一瞬就潜伏到了等离子团身边的阴影处。
“报告罗德大人，斯姆拉大人，机器已经布置完成，随时可以启动。”
“很好。那么，所有人都准备好，我们前往遗迹的最深处，觐见之间。”
在脱壳忍者的注视下，等离子团向着最深处进发。
申次郎刚走下阶梯，脱壳忍者立马来到了他的身边，它竖起自己短短的手臂指向周围，顺着它指的方向看去，是一扇巨大的门。
“觐见之间....等离子团的最终目的地就是这里吗。”
门后到底有着什么样的存在，才能让等离子团付出这么多的时间与精力。脱壳忍者再次使出潜灵奇袭钻进阴影之中，穿过门，便能见到一座华贵无比但又庄严肃穆的巨型王座。
在那王座之上，一只宝可梦正在沉睡。
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“斯姆拉，让暴露球菇做好准备。启动机器。”
“遵命，罗德大人！”
等离子团的成员立马运作起一系列复杂的操作，由各色缆线与零件组成的机器也随着操作的进行开始有了动静，先是发出一阵巨大的噪音，然后逐渐转小，最终变为了无法被听见的低频率声波。
“报告罗德大人，机器已经开始工作。”
“正常运作？”
“是的。”
“啧。那还要多久才能见到效果？”
“额，这个，阿克罗玛博士也没有说。他只说了成功启动后会发出由高到低的电波，然后通过电波将宝可梦的思想逐渐抹去，最终达到操作的效果。”
“我就知道！斯姆拉，直接让暴露球菇上吧！”
“不用那么着急，先运行一段时间再说。”
“有什么等的必要？你直接蘑菇孢子催眠完了我们抓走就是了？你真信那卫星头说的什么狗屁不通的理论？”
“罗德，这可是在古代被称作神明的宝可梦！如果它不会被蘑菇孢子影响怎么办？如果它一醒来就无差别攻击所有人怎么办？试想因为你对阿克罗玛抱有不满而导致整个计划流产，到时候你能付得起那个责任？”
“那你就尽管等，我他妈可不会信那个卫星头一句话！”
罗德暴怒不已，他没想到自己的同事居然也已经被那个卫星头给蒙骗，用电波抹去思想？这样莫名其妙的事情居然也会有人相信？罗德现在就想立刻让心蝙蝠拆了这个害他烦躁不已的破烂机器，但他又确实无法担起失败的责任，干脆扭头直接离开觐见之间。
“大宇怪，我们走！别管这群疯子！”
他放出了自己的大宇怪，打算使用瞬间移动，但就在他喊出指令的前一秒。
“赫拉克罗斯，超级角击！”
一只赫拉克罗斯从角落中突然出现，毫不拖泥带水的一发超级角击就将大宇怪打倒在地。
“不要乱动，否则我不保证你的性命。”
伴随着声音从他身后响起，罗德感觉到身体被一股极强的力量控制，他张开嘴想要呼喊同事和手下却发不出任何声音，这是来自宝可梦的精神强念，身为超能力系专精的他几乎是一瞬间就反应了过来。
“除了点头和摇头以外，不要做任何其他动作。”
点头。
“你们的目的，就是这只沉睡中的宝可梦吗。能值得你们这么做，这只宝可梦的力量很强？”
点头。
“这个装置就是你们准备的手段？”
点头。
“如果毁掉了这个装置.....等等，你在做什么！？”
伴随着红光出现，一股不输给以欧路普的强大念力被释放了出来，趁着这一瞬的放松，代表着精灵球打开的红光再次闪烁，又一股精神强念被释放，这两股力量相加完全胜过了以欧路普，罗德成功从念力的控制中挣脱。
“图腾鸟，人造细胞卵反击！还有哥德小姐和梦梦蚀！你们也给我上！”
申次郎不知道罗德到底是怎么在念力的控制下释放出的宝可梦，但事已至此他也只有战斗。
“以欧路普带队虫鸣！赫拉克罗斯再次超级角击！脱壳忍者暗影爪！”
虫系宝可梦对超能力系宝可梦的克制显而易见，在以欧路普的领唱下，甜甜萤，电萤虫和锹农炮虫四只虫宝可梦一起奏响了虫鸣的四重乐章，瞬间就将罗德反击的势头扑灭还给予了回击。
赫拉克罗斯瞄准飞在空中的图腾鸟一跃而起，超级角击带着无可匹敌的气势狠狠撞在了它的身上，硬是将图腾鸟直接从空中打落，即便是有着飞行系与超能力的复合属性它的体力也在这一击下几乎见底，图腾鸟立马想要使用羽栖来恢复体力，却被身后的脱壳忍者一记暗影爪命中，彻底失去了战斗力。
“斯姆拉！！！！”
“蘑菇孢子！”
拯救了已经完全溃败的罗德的正是在心蝙蝠带领下来到的斯姆拉，两道红光横插在刚想追击的申次郎与罗德中间，申次郎还没来得及看清红光中宝可梦的模样就看到一片蘑菇孢子劈头盖脸地撒出。
“不好，快回来！甜甜萤芳香治疗，电萤虫守护！锹农炮虫和以欧路普继续虫鸣，不要让人造细胞卵撤回去！”
刚击败图腾鸟的赫拉克罗斯与脱壳忍者来不及撤出范围立马陷入了沉睡，同时间锹农炮虫和以欧路普的双重虫鸣也命中了人造细胞卵，让它体力不支地倒了下去。
“你TM！心蝙蝠，梦梦蚀，哥德小姐给我上！精神强念！！”
“暴露球菇，灯罩夜菇，派拉斯特，斗笠菇，蘑菇孢子最大出力！”
蘑菇孢子扑面而来，站在前方的锹农炮虫和以欧路普当即昏昏欲睡，但提前使用了保护的电萤虫与躲在它身后的甜甜萤并没有受到影响，接着甜甜萤发散出嫩绿色的光芒，以它为中心芳草的清香开始弥漫，无论是已经陷入沉睡的赫拉克罗斯和脱壳忍者还是正将安眠的锹农炮虫与以欧路普，在芳香治愈的效果影响下都从短暂的昏睡中恢复了战意。
以欧路普瞬间就在同伴的面前构筑起了一道光墙，虽然它做不到将敌人的伤害尽数隔断，但也切实削弱了精神强念对锹农炮虫的影响，让它能够专心聚集电流，硕大的电浆球在锹农炮虫身前逐渐膨胀，但它却不着急将其发射，就像一直以来申次郎所教导的那样，时机是最为重要的，而它现在就在等待着那个时机到来——从睡眠中苏醒的赫拉克罗斯原本还有些没搞清状况，但凭它与锹农炮虫多年以来的配合，在看见电磁炮聚集的第一时间它就明白了自己该做些什么——膨胀到了极限的电浆球被锹农炮虫发射，速度慢慢悠悠却蕴含着庞大的能量，罗德与斯姆拉立刻指挥他们的宝可梦四散回避，却不料岩石的封闭从天而降完美堵住了所有退路，威力恐怖的电磁炮在同一时间赶到并炸裂，哪怕是对电属性攻击有着抵抗的草系宝可梦都被伤得够呛，更遑论罗德的几只超能系宝可梦，它们完全没能做出任何抵抗的倒在了岩石的封闭之中。
在这混乱的状况里，脱壳忍者趁着所有人的注意力都从它身上转移，悄悄潜入了阴影之中。
“漂亮！甜甜萤再一次芳香治疗，以欧路普带队三重虫鸣！赫拉克罗斯燕反配合集火！”
合奏的鸣叫声又一次响彻在废墟之中，袭向刚从电磁炮的影响中恢复过来的一众草系宝可梦，反应最快的斗笠菇率先撑起白色的能量想要保护住身边的其他宝可梦，虽然三重合奏的力量远超过了它能承受的极限，但它也成功为同伴争取到了恢复的时机，灯罩夜菇投出花粉团，暴露球菇开始光合作用，派拉斯特播出寄生种子。草系宝可梦的战斗风格便是如此，持续不断的回复与异常，如果不能一口气击倒就会被拖入它们的节奏。
但赫拉克罗斯可从来不担心这些，它对着灯罩夜菇挥动自己引以为傲的大角燕反，浑然不在意对面播撒过来在它身上生根发芽的种子，脱壳忍者更是趁机钻出阴影以极其刁钻的角度袭向灯罩夜菇伞盖下脆弱的身体，双重夹击下的灯罩夜菇连花粉团都没搓完就倒地不起。
尽管暴露球菇成功完成了光合作用，但在这地下废墟之中能够恢复的体力十分有限，没能得到灯罩夜菇恢复的斗笠菇基本已经失去了战斗力，虽然派拉斯成功播下了种子，但突然闯入的赫拉克罗斯基本一虫包揽了全部，只有极少数的几颗成功在以欧路普的身上发芽，这种情况下寄生种子所能吸收的体力根本不够斗笠菇恢复。
“斯姆拉！？”
“蘑菇孢子吸收拳击十字毒刃！吵死人了你快走开我还能撑去找手下确认目标不行就撤！”
斯姆拉从来没有像今天这样觉得过自己的这位同事是如此聒噪，他完全是怒吼着喊出了指令，希望能给罗德争取到逃离的时间，至少要撑到他能够进入觐见之间。
那里有着他们最后的希望。
“赫拉克罗斯和锹农炮虫再来一次，甜甜萤和电萤虫用帮助，以欧路普和脱壳忍者专心保护，最后一击了！”
岩石从赫拉克罗斯的手中被丢出，在空中碎裂后重组形成岩石的封闭，本就行动缓慢的几只草系宝可梦在受到限制后完全没有了任何逃脱的可能，获得了甜甜萤帮助的锹农炮虫更是毫无保留地激发出它的全力，这第二次的电磁炮直接将斯姆拉的所有宝可梦都掀翻在地，再无战斗能力。
申次郎长出一口气，他的战斗已经结束。
但他还没来得及拿出手机拨打给宝可梦联盟派遣人手，就听见一声悠长的鸣叫从觐见之间中传来。
从古代沉睡至今的宝可梦，苏醒了。