在公元1996年,也就是初代魔法少女-楪神神奈出现十年后,随着魔法少女的社会地位提高,加上各大公司都研究出各种不同的"驱动器",使得大量的"驱动器"出现在市场上,并且培养魔法少女的经纪公司也大幅增加,造成了各种不同的魔法少女如雨后春笋般出现。 史称"魔法少女的传承"
因为魔法少女的门槛十分之低,不管你变身前的性别、年龄、长相、学历如何,只要你能用"驱动器"变身,让你的意志被众人所知,就可以自称是魔法少女。 并且魔法少女能做任何事,如果有强大的信念甚至能违反物理法则,比如曾有魔法少女想和全宇宙交朋友,而得到能在无空气的太空的能力,或是有魔法少女的强大信念,能让她起死回生之类的事层出不穷。 但是相对的,如此强大的力量自然会遭人猜疑,会不会有人拿它来毁灭世界。
也因此全球政府难得联合起来,试图修订魔法少女相关法规,根据联合政府推出的"公认魔法少女法案",这种魔法少女会被认为是"非公认魔法少女",在被政府或是经纪公司认可前,会被以危险人物看待。
当然这种法规的推出会造成魔法少女们的抵制,也因此在2008年这"公认魔法少女法案"出现时,许多不是与企业签约,或不是政府自身培养的魔法少女起身反对,因为们不希望自己莫名其妙被当成恐怖分子对待。 而另一部份政府自身培养的魔法少女,与那些不希望魔法少女的力量被滥用,认为法案是有必要的保守派挺身保护政府,甚至连初代魔法少女-楪神神奈也出面替政府说话,所以两派人士几本上可以说是保守派的老前辈,与改革激进派的年轻后辈的对决。
这场战增的惨烈度,比起之前的两次世界大战,可说是有过之而无不及,两派人士打了一年,最终以双方两败俱伤的情形下,互相认可而签订条约,保守派的老前辈知道了后辈的改革重要,而改革激进派的年轻后辈也知道了老前辈之所以会保守的原因。 虽然这次的战斗双方都两败俱伤,但是难能可贵的是双方能有互相了解的机会。
幸好这场战斗的双方主要武器不是枪炮弹药,而是魔法少女,双方战斗造成的伤亡和破坏,在双方共成千上万个魔法少女的合力下回复原状,也让条约能在比较好的气氛下签订条约。 修改后的条约大幅放宽条件,让地方政府与中小企业的魔法少女认可,也能有实际上的法律效应,让魔法少女有法可管又不会绑得太死,不让大企业垄断市场。 而这场战斗也让政府看见魔法少女的力量,在那之后士兵都被依官阶配给不同等级的"驱动器",同时这些"驱动器"都被做了手脚,让上级能做出死命令,而使用下级"驱动器"的人只能听从上级的命令,那之后的战斗也由热兵器的大炮互轰,变成一群魔法少女的施法,虽然战斗的惨烈程度增加,画面倒是变得微妙的唯美。
这场后来被称为"第一次烧酒大战"的战斗在很大程度上改变了世界，正如初代魔法少女-楪神神奈出现时一样，没有人能肯定这是好是坏，不过历史的车轮向前就没那么容易倒退了。 一切都只能在千年以后见分晓。
而现在是公元2036年，也就是初代魔法少女出现的五十年后,我们的主角南时雨,因为被魔法少女前辈救过，对这个职业产生憧憬，因次也想成为和前辈一样的魔法少女，这是属于她的故事开端，一切从这开始...