烈空坐幼体把林空吊在树上。
后面山梨博士到来，本来想着送去警察局，后面一通电话过来，林空在研究所当了个助手，并成功拿到了神奥的身份证。
之后从神奥开始，以体验道馆对战为前提开始神奥地区之旅。从一次偶然机会获得了阿尔宙斯没有出现的妖精系石板，妖精系石板莫名融入林空体内......
之后秉着要把毒贝比送回究极异世界的想法，来到阿罗拉地区，在阿罗拉展开了新的旅行.....并见到了一个意想不到的人——廖回。机缘巧合下，进入到究极异洞来到一个新的世界，收获到了超能系的石板，同样融入林空的体内......
从究极异洞出来后，偶然看到关都地区的新闻，一名名为封语的人成为了关都地区的幽灵系天王，对于这种没有出现过的人，林空秉着好奇心来到关都地区。偶遇雪拉比，进行了一番时空之旅，在历史上留下深刻印记......同时，获得新的两块石板......
从过去的时空回来后，山梨博士说有一个人在芳源地区等他，林空无奈只能到达芳源地区，在上演了还有谁不会飞的名场面后，林空见到了另一个意想不到的人.....
从芳源地区再次获得几块创世石板，林空来到合众地区，与合众地区的人们进行一番亲切友好的交流......
觉得自己实力不错了之后，林空来到卡洛斯地区，经过一番努力终于找到了这个世界的哲尔尼亚斯，询问回去的方法。哲尔尼亚斯并没有告诉回去的方法，反而叫林空在卡洛斯好好进行一番旅行。
从卡洛斯地区旅行完成的林空，顺手覆灭了卡洛斯地区的黑暗组织。从那里又获得了新的石板......
总算达到能够回去的地步，林空顺利回到那方世界。
等到回来时，那里已经陷入了战火之中。人类世界和宝可梦世界已经全面开战。以火箭队为代表的人类世界，派出了钢铁超梦应对宝可梦世界的超梦......
林空强势阻止双方战斗，在此情况下，阿尔宙斯降临了，其上，一个人类坐在上面......