支线说明：进化线是从主线第6话延伸出来的if支线之一，与其他支线相互独立，都是延续主线第6话的剧情，与介入线、主线，一并作为本文的3个最终结局线之一。
《某最强的克隆计划》进化线章节目录：
主线第1话
主线第2话
主线第3话
主线第4话
主线第5话
主线第6话
进化线第1话（当前话）
进化线第2话
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伴随着日谷昌英与上条等人的战斗开始，学园都市已经陷入了空前未有的混乱。
刚才，目睹了黑球从空中推着一方通行砸进地底的那些人，基本上已经全都死于非命。
由于三公里范围的地面下沉，整个城市的交通线路网，已经出现了崩溃。
此时在下沉地段附近，担当这座城市治安重任的人们，还在奋不顾身坚守岗位。警备员队长黄泉川爱穗，还在下沉区边沿带队救人。
“喂，那个女孩，不要再往前去了，前面的危险程度，已经超出学园都市预警的最高等级了。”
冲到危险地段救人的这个双马尾少女，不是一般市民，而是同样负有治安责任的风纪委员。只是这种程度的灾害，风纪委员前往现场也是违规的，只有警备员允许。但只要为了救人，大不了过后写份检讨。
第七学区中央医院，也在下沉区的边缘，病人们只要探出窗外，就能够看到一眼望不到边的巨大坑洞，简直触目惊心。
在决战的现场，上条勇敢的握紧了右拳，面对着怎么看都不存在打败的可能性的对手。
“真是有够麻烦，到头来，还得我亲自动手。”
日谷昌英两根手指一碰，一个直径200米的巨大火球，从天而落。
上条原本具备凭借前兆感知躲避的独特优势，可是，攻击范围大到这种地步，根本不是他想躲就能够躲开的。
况且，有一点日谷昌英很清楚，上条并不难想到，要是这个火球径直落到学园都市的市区，造成的灾难会有多大，所以他只有一个选择，硬接下来。
火球的温度，让上条还没有接触到火球，已经全身烫到冒烟，他硬着头皮，伸出右手去挡。
“啊啊啊啊！！！！”
经过了足足十秒，这个巨大的火球才被消除。而他的右臂，在这十秒钟之内，已经被烧伤了。
而对手根本不给他继续喊疼的时间，日谷昌英用空间系能力移动到他面前，接着用肉体强化系能力的效用，一脚踢中上条的肚子。
上条的身体在空中翻滚了不知多少个360度，摔在地面上，痛到根本爬不起来。
“看来这种用宏观引发更大宏观的能力也不是那么好用，稍微多用点力，毁一座城市太容易了，过后我接手了这座城市之后，这还真是个问题。”
倒地的上条，看到日谷昌英左脚抬起，就要朝自己踩下来，站不起来的他，在地上拼命打滚逃出对手的攻击。
事实证明这相当明智，因为这一脚不是普通的一脚，日谷昌英用了溶解能力，他踩到的地面，50米之内飞速溶解成了液体，上条差点就淹没在了这堆液体中。
要是这一脚踩在上条的脑袋上，后果敢想吗？
同时在远处，警备员队长黄泉川，看到一个白色头发白色皮肤的少年，双手带着血走来。
“你怎么也···”
在一边的双马尾风纪委员小姑娘，一时没有理解黄泉川这么痛心的表情。实际上，黄泉川是认错人了。
现在虽然整座城市都已经混乱了，可是执行任务的克隆体们，还在继续履行职责。
只要有靠近相关研究设施的人，一律进行击杀。虽然这并不怪那些行人们，谁让他们有一个研究所刚好建在了城市道路系统崩溃后，直线逃离的必经之地上。不过克隆人们不管这个，只要接近，无论什么目的一概格杀。
对于这个随时可能危及市民安全的危险人物，警备员总部已经下了命令：击杀！
目睹了这个白发少年杀人的经过，市民们正在四散逃跑。
“发射火焰弹！”
伴随着总部的命令，火焰弹从天而降，砸向这个白发少年。
“等等，你们先不要···”将这个白发少年当成了另一个人的黄泉川，还在苦苦劝告。
不过已经晚了，火焰弹在少年最近的距离炸开，少年的身体被喷涌的火焰包围。
正在黄泉川痛心的锤击地面的时候，火焰竟然四散开。
不是朝着某一个方向，而是转着圈，半径逐渐变大离心，由内至外，朝着四面八方散开。
这名克隆人少年，通行1390号，是LEVEL4的[螺旋散射]能力者，数值为175点。因为没有原版那么强大的计算力，所以他的能力开发，简化为只有一种操纵方式，就是用离心螺旋的算式向外扩散反击。之所以不是朝四面八方的直线，一是因为螺旋状外扩，可以用能够操控有限的矢量造成更密集的杀伤，而是专门避免原版的反射，由于攻击距离不是直线，撞上了反射屏障，也不会原路返回，而是沿着离心螺旋的切线直线弹回。不过对于有限数量的固体攻击，比如子弹，用处就没有那么大了。
眼看着火焰就要朝着这边来，双马尾少女直接抓住黄泉川，准备用能力进行转移。可是，其他四散逃跑的市民，已经逃不过被烧死的厄运了。
黄泉川的眼神中，充满束手无策的不甘心和那些人擅自攻击导致无可挽回的后果的愤怒。
可是，在黄泉川前面两米的地方，火焰的扩散停止了。
不仅是黄泉川面前，那个白发少年周围的所有方向，火焰都停止了扩散，然后在环状边缘慢慢熄灭。
“这是···”
黄泉川记得，这种现象，就是某个人的能力。
在地底，一方通行还处在昏迷之中，但是左手无意识的想要抬起。
但是就在刚才无意识之中，他还在继续用着能力，地面上的火焰弹被散射操纵后没有造成严重的后果，也是因为这个原因。
可是通行2271号准备的备用电池，不仅仅是一次性的，并且时间，也比原装电池短的多。
随着[哔]的一声，因为一直处于能力开启的状态，电池终于耗尽。一方通行，已经没有了继续保护任何人的力量。
昏迷之中的一方通行，在意识深处···
“可···可恶···起不来···”一方通行能够感知到自己现在的身体，根本无法行动。
在一片漆黑之中，睁开了眼睛的一方通行，看到的，只有一望无际，不知道是哪里的地方。这是在他的体内，准确点说，是在意识深处，他惊讶于自己的手能够自如的动，可是，日谷昌英在哪里？
“电池确实已经消耗完了···算了，就算还有电量又能怎么样？那种家伙，根本就不是人类能赢得了的。”
这话显得很丧气，不过确实是不得不承认的事实，一方通行作为学园都市最强的能力者，在日谷昌英面前，都和一只蚂蚁没有什么区别，就更不可能想象，还能让谁来对付他。
就这么放弃了？好像放不放弃都一样，没有了电极的辅助，他除了待在地底，等着城市毁灭的来临，也做不了别的事情了。
“真是的···嘴上总说恶党恶党，结果昏过去还在继续保护路人，真是让人受不了啊。”
躺在一片黑色之中的一方通行，看到了从深处走来的一个少年。
白色的头发、白色的皮肤、红色的瞳孔，这孩子跟自己长得一模一样，但是，明显有一种高深莫测的神秘感。
“你是谁？我要是没猜错，这是在我的意识之内吧，你从哪里来的？”
同时，在外面的世界，黄泉川和警备队员们，还有风纪委员少女，看到刚才散射攻击的那个白发克隆人少年，毫无征兆的倒在路上。
不仅仅是这里，其他各处，正在护卫12个相关研究所的通行克隆体，几乎是同时倒下。
通行2271号已经昏迷了半天了，还未醒来。
回到一方通行的意识深处，那个少年报上了自己的身份：
“我其实说不上是什么人。简单点说，就是以一方通行哥哥你的5000具克隆个体的扩散力场集合而成的一个整体。”
一方通行回想了一下，确实好像有这种可能，比如御坂妹妹们通过网络全都连接在了一起，那么自然有形成一个整体意识的可能。可是，自己的克隆人并不能连接成网，会形成整体根本行不通啊。
直接从一方通行的意识中读取想法的少年，问都没有问，就直接解答了一方通行的疑惑：
“我并不是自然出现的，而是人为的结果。形成整体的原理，也不是意识的连通，而是AIM扩散力场的聚合。准确点说，是那些制造了通行克隆体们进行实验的家伙，人为诱导聚合而成的东西。”
一方通行眉头一紧：
“这么说，你是他们为了计划而造出来的东西咯？”
“这么说也不太准。”白发少年摇了摇手指“他们想要操控5000具个体的AIM扩散力场聚合而成的东西，并不是我。我只是他们不想要的，却意外产生的一个副产品。严格来说，是两个整体之一。”
“什么？你是说这些家伙们的整体，有两个？”意识深处的一方通行听着这个和自己一模一样的少年的叙述。
“是的，那些人想要的整体，是一个能够集中夺取所有克隆个体的能力，残酷不仁的使用强大的力量进行屠戮的怪物。因为这是以防计划尚未完成就被发现时，为了应对紧急事态的毁灭大杀器。所以，木原千剩诱导克隆体们的AIM扩散力场，不让其成为全学园都市的AIM聚合体风斩冰华的一部分，而是单独抽取了意识的部分碎片形成一个聚合体。只是2271号和5000号这两个孩子的扩散力场没有被用进去，这两个由于注入错误或者没有注入杀手情感，对于整体而言，反而是一个干扰。”
大概听明白的一方通行反问通行整体：
“不过你看起来不像是那个凶残的整体吧。”
“没错，在那个凶残的整体形成的过程中，由于要求必须纯恶，所以剔除了一部分东西。毕竟就算被灌输了邪恶残暴的杀手情感，但是那些孩子其自身原本的善意并不是完全没有了，只是被更强的恶意给完全压制了。对每个个体而言，都只剩下意识的很小一部分才是善意，这些被当做碎片丢弃了。不过，虽然每个人的善意都只是很小的碎片，十分的微小，不过5000个极其细小的善意碎片因为本质相同而意外的合在一起的时候，就能形成一个可以存在的完整意识了。”
“也就是你，对吧？不过另外一个整体呢？”
“这也是那个家伙的缺陷，为了保持纯粹的恶，防止被善念反噬，借助每具个体的AIM扩散力场收集意识碎片时，丢弃了一部分，由此导致其本身不完整，有时会无法稳定存在。本来，由于那个本身和我一样由AIM扩散力场构成的家伙的压制，我只能一直附身藏在具备善念的2271号那孩子的身体之内。不过现在，那家伙刚好处在不稳定的时间段，所以我才能冲破AIM扩散力场的封锁到一方通行哥哥的身体中来。”