这是在几天前发生的事情：“嗯？居然有人袭击我的临时基地？”位于天空中的隐形蛋头要塞，突然遭到了袭击，蛋头机器人已经全部出动迎击袭击者，基地的防卫系统也已经以一级警戒启动···蛋头博士就在主控中心内监视情况，“嗯？怎么可能？！这个怪物的身形应该是巴比伦盗贼团和诺索尔自卫队，以及皇家特使面对的法老沙漠！为什么法老沙漠会袭击我的基地？”
“那个超古代战争兵器就在这个要塞里吗？开始寻找吧！”战斗员无视掉了蛋头要塞的防卫系统，径直来到基地深处的储藏库，并在这里翻查它要寻找之物。几分钟后，它找到了就像是出土文物一样的机器人；而这时候蛋头博士也驾驶移动仓来到这里。
“那个机器人···是爷爷特地叮嘱过绝对不能启动的超古代兵器！”蛋头博士看到战斗员找到文物机器人之后迅速开炮迎击；“你的炮火对我是没有用的！”战斗员大手一挥，蛋头博士的移动仓直接无法操作落在地上。
“终于让我找到了，超古代战争兵器基佐伊德！我将要用这个完成伟大的拉大人留给我们的任务！”战斗员说完就带着文物机器人，无视蛋头博士直接准备离开，但！
“你不能带着这个机器人离开！”蛋头博士说完的同时，移动仓也已经修复，并瞄准战斗员发射火焰弹，直接迫使战斗员被迫抵挡；紧接着蛋头博士启动了附近的激光炮，将战斗员炸飞出基地。
“谢谢你送我离开···糟了！”战斗员由于只顾着抵挡激光炮，完全没注意到基佐伊德已经脱手飞到了另一边！等到注意到的时候，已经晚了···蛋头博士这边，“基地的损失不大，但那个机器人···我必须赶紧和Precure她们取得联络才行！”蛋头博士非常畏惧那个基佐伊德，他整顿好基地之后就迅速想方设法与杰特他们和安东尼他们取得联络···
爱理家，“蛋头博士？！”杰特他们正在筹备将他们的飞空艇基地转移到人类世界的时候，接到了蛋头博士的紧急求助，“联络我们有什么事？”
警视学院附属中学秘密基地，“各位，蛋头博士传来连线！”妮可也接到了蛋头博士的联络并放到屏幕上，让大家查看。
“巴比伦盗贼团和诺索尔自卫队，请听我说，现在的事态非常不妙！”蛋头博士在联络会议中向双方进行说明，“刚才法老沙漠袭击了我的基地，盗走了超古代战争兵器基佐伊德！基佐伊德如果被唤醒，并获得了大量战斗数据的话，后果不堪设想！”
“蛋头你说什么？！基佐伊德！！”听到‘基佐伊德’这个词，杰特和安东尼都知道事态不妙，以至于异地同声；“没错，就是基佐伊德。请你们赶紧找到基佐伊德并摧毁它，或者···”蛋头博士也告诉他们找到基佐伊德之后的事项。
由于蛋头博士的紧急联络，之后的几天杰特他们和安东尼他们四处寻找基佐伊德的下落，希望能赶在法老沙漠之前找到。然后，在Babylon Precure和Police Precure以及Cure Flash合作打倒黄金的战斗员的那天：
小玲在翡翠港的近海沙滩散步，但突然间不知为何被绊倒了：“痛痛痛···刚才绊到什么了···？”她仔细一看···机器人？“机器人？看起来好像很古老啊。”
在这时候，机器人站了起来，似乎是被激活了：“展示······力量·······或······我将······服·······从·······胜········利·····一切······”
“启动成功了···但是机器人所说的力量是？”小玲仔细思考之后，“是这样吗？”在机器人面前展示了一下格斗技。下一秒，小玲看到了不得了的一幕：机器人启动了额头上的眼睛，将眼前的小玲进行记录：“契约··完····成·····我将····不·········表现·并变成······完全····”
“这下麻烦了···”小玲还以为机器人是要发生什么，“总之赶紧带回本宅，让爷爷检查一下比较好。”于是她仔细确认机器人的构造之后，就带着机器人，尽量避开群众赶紧往天羽家本宅里走。这一切刚好被不远处的战斗员看到：
“糟糕···基佐伊德被她得到了吗？！这可是我好不容易从蛋头博士那里抢来的啊！而且居然还已经签订了契约···！可恶，我必须想办法夺回基佐伊德！”
然后，视角转到小玲这边，她带着机器人就快要到达天羽家本宅的时候，“嗯？”小玲注意到了严阵以待堵在必经之路上的——“你们为何会在这里？”来者正是Constellation Precure的弓道翎梦她们。
“我们来晚了吗？那个超古代兵器···”传通院樱对小玲说道，“你该不会已经与其签订契约？”
“契约？这个像是文物一样的机器人？”小玲似乎还不明白，“还有你们来这里是打算做什么？”
“看来Jewel Precure准备利用超古代战争兵器成为Dark Precure！”松坂月玲对翎梦和其他人说道，“变身吧，必须阻止这家伙掌握超古代战争兵器的秘密！”
“天羽玲，我真是看错你了！”翎梦说完之后，“Precure Constellation Awaken！”全员立即变身！
“不是···你们到底把我当成了什么？”小玲知道已经没法讲理了，“超音鼠！快过来！！”于是也拿出勇气宝石呼叫超音鼠过来，并在超音鼠赶到的时刻：
“发生什么事了？”“快变身吧，我被人无故怀疑是Dark Precure！她们根本不讲理！”“虽然不知道怎么回事，总之我们上！”
“Precure Jewel Change！”小玲也念出变身咒语和超音鼠融合，在她变身完毕的同时，Taurus、Aries、Virgo迅速冲上来，迫使Sonic迅速后退；“无故怀疑他人的你们才是Dark Precure吧！”说完，Sonic迅速聚集力量，“Tornado Blow（龙卷风阵）！”一拳砸地制造风阵将她和机器人保护起来并驱逐试图入侵的Constellation Precure。
“铁格鲁！”Gemini拿出武器瞄准Sonic，“现在就将你解决！Precure Ultimate Trial（最终审判）！”发动必杀攻击Sonic！
“糟了！”Sonic来不及收手避开攻击！就在这时候，“学习···完·成···”机器人跑到Sonic前面，量子召唤和铁格鲁相似的武器，“Precure Ultimate Trial（最终审判）！”发动同样的招式抵消了Gemini的攻击！
“纳尼？！”不只是Sonic，就连Constellation Precure看到之后都震惊了。“机会！”Sonic迅速抓住这个机会，“Sonic Boom（音速爆发）！”发射风刃攻击周围的地面阻碍Constellation Precure的视线，然后音速穿梭将她们全部打倒在地。在这时候，机器人似乎也进行了识别：“学··习···完·成···”
“果然不愧是速度最快的Cure Sonic吗···”Sagittarius愤恨的说道，“你想要用这个机器人做什么？”
“这应该是我要问你们的，为何蛮不讲理就直接攻击！”Sonic反问她们，“就因为这个机器人吗？这个机器人到底有什么力量能让你们把我当成Dark Precure？”
“你不会知道的···”Taurus回应道；在这时候，Flash赶到这里并站在Sonic前面。
“Flash？”“果然是你和那个机器人签订契约了吗？到底发生了什么事？”Flash询问到底发生了什么；“Constellation Precure刚才无故把我认定为Dark Precure，好像就因为这个机器人···”Sonic说明了情况。
“我知道了，幸好签订契约的是你。”Flash表示终于放心之后，“这里就交给我吧，你带这个机器人赶紧离开，并记得把机器人藏到法老沙漠找不到的地方！之后我会和你会合的！”
“好！我们在我家本宅会合！”Sonic说完就带着机器人赶紧离开了；“别想跑！”Aquarius试图阻拦，但被Flash拦截。
“和我说说你们为何也盯上那个基佐伊德了吧？”Flash非常生气，“只凭Sonic意外与其签订契约就认为她是Dark Precure，不觉得太武断了吗！她都不知道到底是怎么回事！”
Sonic这边，她带着机器人顺利来到了天羽家本宅，然后她来到了位于本宅右侧的科研仓库并解除变身。“逃到这里的话就没问题了吧···？话说···”小玲带着机器人进入仓库之后，一位老人似乎正在研究什么，台上的是没有轮子的滑板···
“嗯······要怎么做才能完美启动反重力粒子呢···？”老人并未注意到小玲进来；“爷爷！”若不是小玲出声，这位老人估计也看不到她···
“小玲？为何会来这里···那个机器人是？”“爷爷，你赶紧检查一下这个机器人，好像有什么损坏。”
老人立即带着机器人来到内室，并对机器人开始检查；“小玲！”沙夜也在这时候来到这里，“幸好有超音鼠帮忙指路···机器人呢？”两人一同来到内室，目睹了不得了的一幕···
“神奇！太神奇了！这个机器人简直就是天造之物啊！”老人看到小玲和沙夜进来之后非常兴奋的说道，“小玲，你从哪里找到的这个机器人？”
“就在海边。”“这个机器人啊，”老人对小玲和沙夜说道，“看样子已经搭载了远远超出我们想象的高度发达的人工智能，而且这个机器人还具有最高深度的学习能力和量子操纵技术，是个相当具有科研价值的机器人！”
“这么厉害啊···？”小玲对此感到非常意外；“小玲，这位老人是···？”沙夜这时候才想起来问这位老人的名字。
“你是小玲的朋友吧？我叫恰克·卡米耶·天羽，”老人做了一下自我介绍，“是天羽家的退休科研员和财阀总管。”
“天羽财阀的掌控人？”沙夜似乎有些惊讶；“以前确实是，但现在已经交给儿子了。”老人继续回答道；“而且···恰克·卡米耶？”沙夜继续思考之后，又发现了什么，“你是从英国来的吗？听说你年轻的时候是一名有相当多高科技成果的发明家···”
“我就是本人。”老人承认那就是当初的自己之后，沙夜的脸已经非常夸张的展露出惊讶的表情。
“沙夜，Constellation Precure为何会盯上这个机器人？”在这时候，小玲还是很严肃的向沙夜询问刚才的战斗，“还有你是怎么摆脱她们的··？”
“恰克爷爷，小玲，你们听好了——”沙夜向她们说明了这个机器人的真相——“这个机器人是超古代遗产，以前据说曾被蛋头博士的爷爷发掘过，并且也激活过一次···然后这个机器人就一直被关机到现在。实际上除了Constellation Precure，还有不少Precure队伍都在找这个机器人，要求寻找这个机器人的正是蛋头博士。”
“蛋头博士？！”老人听到‘蛋头博士’之后严肃起来，“小玲，你该不会又成为Precure了吧？”
“嗯，不过不是因为他，而是别的邪恶势力。”小玲承认了自己确实是Precure，“蛋头博士自称已经放弃了对人类世界的侵略，而且我也一直在监视他。既然提到蛋头博士，那他应该知道这个机器人更多的资料。”
“那我们给这个机器人取个名字···吧？”老人刚说到这里，就发现机器人已经开始进化了，很快机器人总算可以清晰吐字，流畅说话了。紧接着，小玲看到机器人额头上的眼睛很像翡翠，就决定了它的名字：“叫艾美尔吧。”
在接下来的这几天里，老人继续对艾美尔进行研究，而小玲也和沙夜一起在周围调查盯上艾美尔的可疑人员。一晃几天过去了···
“调查出现瓶颈了···这个机器人的容量好像已经无法用PB来计算了！”天羽家本宅科研仓库，老人向小玲和沙夜非常悲观的说道，“这样下去别说研究了，哪怕是照葫芦画瓢都是天方夜谭啊···”
“有调查到更详细的信息吗，恰克爷爷？”沙夜表示理解之后继续询问；“这个啊···我在这个机器人的内存脑里找到了很奇怪的加密信息。”老人说到这里，就噼噼啪啪打字，打开了那个加密信息文档，“这个文档的标题很奇怪，写着《基佐伊德的研究日记》···但是除了标题之外详细的内容还没能破译，我想很可能这个机器人已经有研究人员研究过了。接下来我会继续破译这个文档，看看前任的研究人员都留下了什么信息。”
“这样的话可算帮大忙了。话说艾美尔呢？”“艾美尔啊···看窗外。”
庭院，艾美尔似乎在和小叶比拳，“还真是相当出色的陪练机器人啊！”小叶对艾美尔非常满意——艾美尔已经学习了小叶所掌握的志叶流家传空手道，然后用空手道与她进行陪练，小叶在漫长的陪练过程中逐步改掉了她的缺陷并完善自身所学。
“小叶还真是个只会练身体的笨蛋···”瑛很罕见的说道，“艾美尔的用途应该不止如此吧···”
“不要介意这些，”愿则是这样说道，“艾美尔看起来确实是十项全能的机器人，可能只有我们想不到的，没有它做不到的吧。”
也是在这时候，“发现蛋头博士的目标，歼灭！”突然出现在本宅顶的红色战斗机器人瞄准艾美尔连续不断的发射导弹！艾美尔注意到导弹之后迅速冲向导弹，“Sonic Boom（音速爆发）！”挥出量子风刃将这些导弹全部抵消；下一秒，“欧米茄？！”夏特和罗姬认出了机器人，“停止战斗！它不是蛋头博士的机器人！”并及时出面阻止。刚好这时候，小玲和沙夜也跑了出来···
几分钟后，“蛋头博士制造的机器人？”夏特和罗姬向大家说明了欧米茄的来历，简单地说就是欧米茄是五年前由蛋头博士制造的战斗型机器人，但当时欧米茄并未投入使用，所以欧米茄对蛋头博士心生怨恨，并在翡翠岛终于开始对蛋头博士的大反攻的时刻背叛蛋头博士，倒向了精灵一方，极大加强了精灵们的战斗力。翡翠岛顺利解放之后，欧米茄就开始作为翡翠岛王室的禁卫守护着翡翠岛王族。而它这次过来，预定是来找莎莉公主的···
“非常抱歉给各位添了麻烦。”欧米茄向大家抱歉之后，“若有公主的下落请及时和我联络。”留下自己的联络方法就离开了。在欧米茄离开之后，爱理她们乘着极限滑板来到了这里···
“原来沙夜说的是真的。”爱理她们仔细打量艾美尔之后如此说道，“小玲，我们这边也在调查到底是哪个法老沙漠盯上了基佐伊德，请一定要保护好基佐伊德，千万不要让法老沙漠发现它！”
“我知道了。有什么新情报的时候我这边也会和你们联络的。”
与此同时，“按照妮可提供的方位，应该就是这里了···”光华她们就在翡翠港周围像是在寻找什么的样子，她们来到了附近的废弃仓库，“那个偷袭蛋头博士的法老沙漠···”
光华她们打开仓库大门之后，“嗯？被发现了吗？”战斗员看到来者是光华她们之后，“算了，就拿你们试试我制作的成果！上吧，阿飞兵！”迅速召唤法老卫兵和外表与艾美尔几乎雷同但却是灰色的机械杂兵攻击光华她们，在安东尼他们现身之后，“Precure Emergency Dress！”光华她们立即变身迎击法老卫兵和阿飞兵，“以你犯下罪行作为宣告，我们将使用武力进行追捕！”
在激战中，“怎么可能？！”其中一个阿飞兵居然使出了Kaitou Shadow的“Shadow Energy Ball（影子能量球）”攻击Duty，让Quick以及罗特非常惊讶，“那是Kaitou Shadow的招式！难道这些新的杂兵应用了其他的Precure的力量吗？”
紧接着，阿飞兵乙瞄准Quick发动了Cure Search的“Precure Ultimate Fire（终极火焰）”攻击，迫使Quick迅速躲闪；然后阿飞兵丙冲向Patrol，使出了Cure Sagittarius的“Precure X Attacker（X攻击者）”攻击，Patrol迅速召唤炮手火箭发动“Precure Rocket Drill（圆锥火箭）”当场将阿飞兵丙消灭；紧接着Duty和Quick也分别发动“Precure Fang Boost（战牙加速）”“Precure Walrus Meteor（海象流星）”将阿飞兵甲和阿飞兵乙消灭。三个阿飞兵全部消灭之后，法老卫兵全部都消失了。
“实验数据还不错，”战斗员逃跑了，“这样的话也许就算找不到基佐伊德也可以用基佐伊德的复制品完成拉大人的目的！”Duty试图追上去但被Quick拽住：“Duty！你现在就算追上去也来不及了！而且这些机器人···不正是仿造之前蛋头博士所说的基佐伊德制作的吗？我们还是把这个调查清楚比较好！”
“你说的也对。”Duty承认自己的不足之后，她们收集了这些阿飞兵的残骸之后返回基地，让妮可进行仔细检查。在妮可进行检查的时候···
“听沙夜说，她找到了基佐伊德但带不回来···详细的情况到底是？”小柔在这时候说道，“难道基佐伊德已经和谁签订契约了吗？如果是这样的话那契约者···”
“契约者就是Cure Sonic。”光华直接说出了全部，“沙夜亲自说明的。她还说幸好契约者是她···现在Cure Sonic估计也在调查和基佐伊德有关的资料，估计她应该从沙夜那里知道情况了吧。”
说到这里的时候，“找我们是发生什么大事了吗？”夏实她们过来拜访来了，“那是···”紧接着，辻本裕香一看正在进行检查的大量阿飞兵残骸直接被吓到了。
“检测完毕，”妮可向大家报告了检查结果，“初步判断其塑形有巴比伦遗产的痕迹，且和原版的基佐伊德对比还原度只有5%。”
“这就是你们所说的阿飞兵吗？”藤堂警官也进来了，仔细查看阿飞兵的残骸之后若有所思的说道；“这些阿飞兵不知道为什么居然能用你们的必杀技。”光华很严肃的对夏实她们说道，“这到底是怎么回事？这些阿飞兵能用你们的招式，只能让我想到你们已经堕落了！”说完就准备攻击夏实，但被藤堂警官阻止。
“推断的太极端了，光华！”藤堂警官证实了夏实她们的清白，“我保证她们根本没有和法老沙漠有过接触，不如说我们也在被阿飞兵困扰！”说到这里，藤堂警官很罕见的变成了精灵的模样来到控制台。光华她们看到藤堂警官变成精灵之后都惊掉了下巴···
“这才是它真正的模样。”安东尼表示没必要惊讶，“它自称是来自未来的精灵，名叫墨菲。幻化人形我想也应该是为了方便寻找Precure吧。”说服光华她们接受事实之后，安东尼来到墨菲那里，“妮可，搜索制造阿飞兵的法老沙漠的方位以及其他阿飞兵的位置！”
“明白！开始执行任务。”妮可执行任务之后；“还真是相当出色的人工智能啊。”墨菲对安东尼说道，“虽然在未来，人工智能有所普及，但绝大多数的人工智能都被掌握在犯罪集团手里···”
“不用担心。”安东尼安慰道，“你们这边的工作会顺利的。”但是话音刚落，“发现阿飞兵的踪迹！地点在翡翠港珠宝一条街！重复···”
“即刻出动！”墨菲下令之后，大家迅速出发赶往现场。
翡翠港珠宝一条街，阿飞兵和法老卫兵对周围大肆破坏并劫掠珠宝，群众们则是慌忙逃离这里。夏实她们赶到之后···
“没看见法老沙漠···？！”光华很诧异现场居然没发现战斗员；“现在是找法老沙漠的时候吗！快变身迎击！”夏实说完之后，安东尼他们也迅速做好准备，“Precure Emergency Transfiguration！”“Precure Emergency Dress！”七人迅速变身迎击法老卫兵和阿飞兵。
“Thunder Slash（雷霆切斩）！”“Thunder Circle（雷霆回旋）！”“Thunder Dash（雷霆冲刺）！”“Precure Spontoon Electromagnetic Whip（警棍电磁鞭）！”Duty她们召唤诺索尔伸缩棒，Search她们也召唤通用警棍各自发招将法老卫兵全部消灭。紧接着阿飞兵冲了上来：
“Precure Laser Light Bomb（镭射光弹）！”“Precure Bullet Blade Shoot（弹刃射击）！”“Precure Whirling Fly Blade（回旋飞刃）！”这些阿飞兵分别发动了Inquisite、Inquest、Inspect的必杀技，让正牌的Inquisite、Inquest、Inspect直接惊呆；Duty迅速召唤飞轮雷枪发动“Circle Thunder（圆形雷电）”将阿飞兵的攻击全部抵消。
“让你们见识一下正版的是啥样的！”Inquisite、Inquest、Inspect三人迅速召唤武器：“武器传送！”紧接着，“Precure Laser Light Bomb（镭射光弹）！”“Precure Bullet Blade Shoot（弹刃射击）！”“Precure Whirling Fly Blade（回旋飞刃）！”三人发动正牌的必杀技攻击各自对应的阿飞兵将这些阿飞兵全部消灭。
与此同时，“切···到底要怎样才能把基佐伊德完全还原啊？”战斗员躲在很远的地方注意着现场的一举一动，“果然我必须把原版的基佐伊德搞到手！但···对了，我记得基佐伊德有重新签订契约的模式！”
又是几天后，阿飞兵的袭击频率越来越频繁，不只是Criminal Precure和Police Precure，Constellation Precure也投入到了对抗阿飞兵的战斗之中；但此时大家还不知道，战斗员即将在翡翠港掀起前所未有的大毁灭···
翡翠港公园，这里的九个拥有Jewel Precure力量的阿飞兵正在带领法老卫兵大肆破坏，Sonic她们和Fly她们赶到这里迎击它们。在战斗途中：
“Sonic，为何基佐伊德也过来了？”Fly很诧异为何艾美尔会和她们一起战斗；“说来话长了···这段时间里艾美尔经过和我们的学习，已经完整恢复了自己的能力，并且好像激活了什么程序，非要说来帮我们的忙···”Sonic如此说道，“艾美尔莫非已经获得了大量的战斗数据？获得了大量战斗数据的艾美尔会怎样？”
“我也不知道，只是蛋头博士说基佐伊德拥有学习我们招式并模仿成招的能力，”Fly似乎也不是很清楚，“如果掌握了大量战斗数据的话，说是会将全部习得的招式进行有机计算整合，变成无敌的毁灭之神，那样的话我们根本毫无胜算···”
“说起来···Constellation Precure有找过艾美尔，并且试了一下蛋头博士交给她们的避免艾美尔堕落为邪恶的方法···”Sonic说到这里想起了一天前，那时候翎梦她们找到了小玲：
“果然已经获得大量战斗数据了吗···这样的话确实刻不容缓了。”传通院樱如此说道；“小玲，我们接下来要对基佐伊德进行特殊指令激活，希望容许。”
“艾美尔，听一下她们的话吧。”小玲表示明白之后就让艾美尔听从翎梦她们的要求；然后翎梦启动了艾美尔的额头的眼睛：
“觉醒吧，基佐伊德！”翎梦喊出口令之后，艾美尔突然开始了自我觉醒···
“这是？！”“蛋头博士所说的觉醒，”传通院樱解答了小玲的疑问，“基佐伊德觉醒之后，就会作为完全的毁灭兵器降临于世；但是蛋头博士告诉我们，我们Constellation Precure握有消除基佐伊德兵器意识的密码，并告诉我们那个密码只能在觉醒开始的时候输入。原本的基佐伊德应该是没有密码的，蛋头博士到底对基佐伊德做了什么？”
“吾欲证汝之力，若非吾不从，吾乃现万物之主纳万物之主基佐伊德！”艾美尔开始觉醒的时刻，“传说的最终兵器基佐伊德！我命令你——”翎梦喊出了消除基佐伊德兵器意识的密码：“给予所有人类希望！！！！”口令输入之后，艾美尔又开始重新自检，然后···
“嗯？刚才的口令是···”“这样一来蛋头博士所说的保险就算启动成功了。”艾美尔感觉自己的变化非常大，对此翎梦如此说道，“艾美尔，你要好好感谢蛋头博士的家族啊，蛋头博士说这是他爷爷留给你的口令。”
“我···启动了心灵意识吗···”艾美尔如此说道，“谢谢你们。”
“也不知道爷爷那边的文档破译的怎么样了···”小玲还是很担心爷爷那边的情况···但是艾美尔对小玲说道：“小玲，你是在担心我的前任主人留下的资料吗？”
“前任主人？”“是杰拉德教授，但不知道他怎么样了···蛋头博士应该是在找关于他的下落吧。”
回忆结束，“蛋头博士留下的消除兵器意识的口令吗···现在的基佐伊德已经启动了那个口令？”Fly还是有些疑问，不过看艾美尔的表现其实也能看出来：艾美尔完美结合了Jewel Precure全员的力量，使出了风火交杂的攻击将剩下的阿飞兵和法老卫兵全部消灭。
“清理完毕。”艾美尔向小玲报告情况，“各位，我感觉到了神秘的存在···那家伙应该就在市区！”
在这时候，大家看到了市区的震动和烟尘···Sonic和Fly相互示意之后，大家立即赶往现场。
现场位于横滨市中心，战斗员和最后一批次的阿飞兵以及大量的法老卫兵在市中心大肆破坏，群众们慌忙逃进人防工程避难；同时Criminal Precure和Police Precure也在迎击法老卫兵和阿飞兵，为群众们的逃难争取时间。
“基佐伊德怎么还没来？”战斗员非常狂妄的叫嚣，“就凭你们又能奈我何？！给我上，法老卫兵！阿飞！”然后命令法老卫兵和阿飞兵攻击Criminal Precure和Police Precure，这一批次的阿飞兵全部搭载了Constellation Precure全员的力量，大家都因此陷入了苦战。在这时候，“到此为止吧，法老沙漠！”Flash和Constellation Precure赶到并迅速迎击阿飞兵，Flash则是直接召唤双星十手剑攻击战斗员。
“你试图得到基佐伊德到底是为了什么目的！”Flash在和战斗员的纠缠之中喊道，“不是表面上为了法老沙漠那么简单吧！”然后，“Star Cross（双星十字）！”Flash挥出闪烁着金银色的十字剑气攻击，战斗员则是使用‘防御降临’拽来一个阿飞兵挡住这一击，然后被当做盾牌的阿飞兵就爆炸了。
“看来你们还不知道基佐伊德真正的秘密！”战斗员终于道出了它的阴谋，“没错，我要得到基佐伊德是为了我们法老沙漠的夙愿；但还有个因素，那就是我对你们的世界没有兴趣，就算毁灭了也与我们法老沙漠没有关系，因为基佐伊德乃是超古代战争中隶属于宇宙星际联盟的歼星兵器啊！这就是超古代战争兵器基佐伊德的真相！基佐伊德是注定要完成毁灭你们人类的核心指令的！哈哈哈哈哈哈！”
“但很可惜没能如你所愿，怪物。”艾美尔和Jewel Precure、Babylon Precure赶到之后，Jewel Precure和Babylon Precure迅速迎击其余的阿飞兵和法老卫兵，艾美尔则来到了战斗员面前，“杰拉德教授已经发现了这个秘密，所以才会在我的身上留下秘密的密码。现在的我不是兵器，而是拥有心灵的机器人！”说完，艾美尔迅速攻击战斗员，战斗员也不得不多次将阿飞兵拽来当盾牌，结果一个一个都被摧毁了。
“这···这怎么可能···你已经获得了大量的数据，不是应该执行毁灭的指令吗！”战斗员非常不解；“秘密的密码已经启动了，”艾美尔回应道，“这就是秘密的密码的用处。接招吧，怪物！”说完，艾美尔一个回旋踢踢出风旋攻击战斗员，战斗员躲闪不及被风旋锁住；“就是现在！”Flash冲向战斗员并强化自己的右手，将右手伸入怪人的身体里，拿出了一个···相机？
“这是幻想相机！怪不得它能制造阿飞兵···”雷显出幻影一看巴比伦遗产，终于明白了战斗员制造阿飞兵的方法和原理，“总之夺回巴比伦遗产之后它就没法召唤阿飞兵了。”
“结束了！”艾美尔说完，就量子召唤类似双星十手剑的武器，挥出一发全元素融合的元素剑气将战斗员打飞在地。
“这是你逼我的！”战斗员终于摊牌了，“基佐伊德，现在我就告诉你，你永远都无法逃脱兵器的宿命！”它直接将附近的一栋没有人的废弃大厦一拳摧毁，让全体Precure很诧异；但下一秒——
“糟了···！”艾美尔由于目睹了大厦的毁灭，被激活了二次契约签订；“来吧，基佐伊德！与我签订契约，打倒Precure，去完成你身为兵器应得的宿命！”
“艾美尔？！这到底是···”Sonic没想到艾美尔居然会变成这样；“可恶，秘密的密码居然没法抵挡住二次契约吗？”Sagittarius也很诧异，“不应该啊···？”
紧接着，“数据···溢出······”艾美尔突然就陷入了狂暴状态，“无法··识别········无法··处理····目标···”最后，艾美尔说出了石破天惊的一句话：“发动歼星冲击摧毁地球！”
“什么？！”全体Precure知道事情不妙了；“很好！虽然有点差错，但就该这样！”战斗员狂妄的狞笑道，却未察觉到接下来艾美尔的第一步——
“第一步，歼灭！”艾美尔迅速将战斗员打飞到天上，并发射全元素光束将其凌空消灭：“这不可能！为何你攻击我！基佐伊德！！！！！！”战斗员完全没反应过来就被全元素光束贯穿，伴随着爆炸灰飞烟灭了。
“第二步，储能···”艾美尔开始蓄积力量；“我们来晚了吗？”Kaitou Precure过来之后，发现一切都为时已晚——艾美尔已经暴走！而且这些法老卫兵也在保护艾美尔，不允许Precure的靠近！
“为什么艾美尔会变成这样···”Sonic仍然想不清楚艾美尔的暴走的契机；“Sonic！基佐伊德是和你签订契约的对吧？”Shadow（K）对Sonic说道；“这些法老卫兵就交给我们，你快点过去阻止基佐伊德吧！地球和基佐伊德，那个重要？”
“我知道了，交给我吧···！”Sonic明白了意思之后，放弃了挽救艾美尔的想法，并在全体Precure的掩护下冲出法老卫兵的包围圈，亲自对阵艾美尔。
“不要阻挠我！”艾美尔已经疯狂的无法识别任何目标了，“给我消失！”说完就攻击Sonic，但Sonic也迅速回击，然后Sonic被打飞，迫使其空中调整以平稳落地。
“超音鼠，用那招吧···”“Sonic，你是认真的吗？”“没错，艾美尔对我的力量了如指掌，所以···我只能赌一把了！”“好吧···不过这招已经五年没用了，有什么不对劲的话我会强行终止的！”
“勇气融合！！！”Sonic发动了全体Precure从未见过的力量——超音鼠实体化离开了Sonic的身体，而且Sonic没有变身解除！
“没想到五年了，还会有用到这个能力的时候···”超音鼠如此说道，然后超音鼠和Sonic同时冲向艾美尔展开最后的激战。
全体Precure这边，“那是？！”Fly和Duty看到Sonic发动勇气融合之后大为震惊；“那是只有超音鼠才能做到的能力——”塔尔斯显出幻影对大家说道，“将勇气宝石留在搭档的精神异次元内供给变身的力量维持，然后真身和搭档共享力量一同战斗，这就是勇气融合。这个能力我们谁都无法做到···”
“这么想的话，搞不好Sonic应该能阻止艾美尔···”Shine一边迎击法老卫兵并说道，“我看基佐伊德好像无法学习多人合击，Sonic能用这个能力的话，搞不好···”
“不，”蛋头博士在这时候出现了，并帮助全体Precure迎击法老卫兵，“应该是只有Sonic能阻止基佐伊德。”
“蛋头博士？你可算来了！”杰特显出幻影对蛋头博士喊道，“又是给我们整个麻烦出来！你要怎么解释？”
Sonic这边，“无法··学···习···？”艾美尔确实如同Shine所料，无法识别并学习Sonic和超音鼠的合击技！因此它的招式几乎全部都被报废，并且储能过程也被打断；“艾美尔！赶紧清醒过来吧！”Sonic飞到天上聚集风和光的力量，同时超音鼠也缩成球飞到天上将聚集的力量吸收，并转到Sonic前面，然后Sonic双手以发波的姿势对准艾美尔，“Precure Sonic Ringray（音速环路）！”发动音速风暴在前方幻化出大量金环同时将超音鼠沿着金环发射出去！超音鼠循着金环以音速的速度飞行冲向艾美尔将其贯穿打飞在地！在艾美尔被打飞的同时，法老卫兵也已经被全体Precure消灭。
“艾美尔！”Sonic跑到艾美尔那里；“嗯······终于···清醒了吗···”艾美尔似乎解除了暴走，“小玲，我···都做了什么··？”
“已经没事了···你因为法老沙漠的关系···”Sonic话音未落，艾美尔就对她留下遗言：“这样啊···恐怕我不能继续和你们一起生活了···我想起来了···我是宇宙星际联盟在数万年前派遣到地球的歼星机器···我必须···”说到这里，Sonic发现艾美尔的身体在读秒！
“艾美尔！你要做什么？”Sonic试图过去阻止艾美尔，但被艾美尔用Tornado Blow（龙卷风阵）锁住；然后：“再见了，Precure们，再见了，小玲···谢谢你们给我留下心灵···”艾美尔向大家道别之后飞出地球，在外太空启动自爆终结了自己。全体Precure都看到了外太空的爆炸···之后，现场在彩虹的照耀下恢复了原来的样子。
“结束了吗···”Shadow（K）、Search、Fly、Duty、Flash如此说道，但明显是开心不起来的；“宇宙星际联盟的歼星兵器···战斗员说的居然是真的？！”Sagittarius不敢相信艾美尔会承认自己是歼星兵器并自我了结；“艾美尔···”Sonic直接伤心的大哭起来···
“爷爷，这就是你留给我的遗嘱吗···？”蛋头博士也是若有所思，“但是人类还值得我去信任吗···？我想这不是你的遗嘱吧，爷爷···你应该是打算让我为你和姐姐复仇的才对···”
市区的法老沙漠暴动终于结束了，但Precure们都因为失去了艾美尔，没有人带着笑容注视着恢复正常的市中心···大家相互道别离开之后，天羽家本宅：
“艾美尔呢？”爷爷正要向回来的小玲报告喜讯，却发现小玲脸上的泪痕···“已经被法老沙漠给摧毁了···”同行的沙夜如此说道。
“果然吗···你们过来看看这个吧。我总算破译完成了。”爷爷让大家看终于破译完成的《基佐伊德的研究日记》：
19XX年2月16日
我在仓库中发现了一个很有趣的库存品，应该是相当久远的时代被制作完成的人偶。起初谁也没有注意到，但却因为一次意外让我发现了它的奥秘——那是对异世界来客夏特的调查中，这个人偶居然动了起来。于是我猜测，这可能是在数万年前的超古代文明遗留的产物，也就是超古代文明确实存在。
我在之后对这个人偶的调查时才醒悟到，这个人偶是多么的不寻常。根据调查，这个人偶可能会是超古代文明覆灭的其中一个因素。当然，我当时是不太信的。
19XX年3月1日
我经过仔细的调查之后，终于明白这个人偶是超古代文明覆灭的因素并未无稽之谈。我在一处超古代遗迹发现了证明此事的石碑。石碑上写着【从天而降的圣人，赐予它战斗意志，一切即刻重现】。虽然这一切都难以置信，但那个会动的人偶，真的能够完全模仿我的动作。
于是我扫描了一下这个人偶，结果太让人惊讶了。它已经存入了大量的数据，以现在的超算规模，根本无法对其做任何的解析，因为超算会崩溃。但更加让人惊讶的是，经过艰难的解析之后，居然是关于超古代文明的所有格斗术和兵器的资料。
再这么下去，它就会模拟出这些力量，也就是说这些武术和兵器，它都可以一五一十的模拟出来。估计也还不止这些。如果配载的技能运转正常的话，它还有可能发明新的现代兵器···神啊，为何我会唤醒战争兵器···
19XX年4月4日
我终于明白了为何这个人偶会被取名为‘基佐伊德’的原因：‘基佐伊德’在超古代的语言中寓意是‘一切’。另外，石碑上还写了基佐伊德将会服从于和它签下【契约】的人，可能是因为需要通过战斗数据的关系，它用刚刚学会的语言，和我签下了【契约】。它说：【吾欲证汝之力，若非吾不从，吾乃现万物之主纳万物之主。】它说完后，我就在基佐伊德面前拿起我那把因兴趣而收集来的模型枪打了几下。然后，它就好像一下子变了似的说【吾誓与汝同在，汝命即吾命。】
从此开始，它就只听我一个人的命令了。我知道它虽然是个可怕的兵器，但是它现在只服从我的命令的话，也就不会对人类有威胁了。但是如果有恶意的人和基佐伊德签下【契约】的话，那就是人类的不幸了。所以我必须调查清楚能让基佐伊德再次签下【契约】的条件·····
19XX年4月24日
上层好像有些急了，白天黑夜的不停开会。难道是因为察觉到夏特是异世界来客了吗···但是，通过夏特提供的DNA所培养的究极生命体就要完成了······
我最疼爱的孙女玛莉亚的NIDS也马上就能得到治疗了，现在已经没人可以阻止我的研究了。因为这世上能够救玛莉亚的人···已经只有我了。
19XX年5月26日
现在我的研究已经处于随时都会被冻结的状态。为了延长研究时间，我不得已将基佐伊德交给了上面。虽然我一再告诫他们千万不要给它最新最危险的武器资料，但是他们却偏不听，那些研究者们给了基佐伊德有关最新兵器的许多资料。
由此我总算搞明白了基佐伊德签订新【契约】的条件——那就是当有比前任【契约者】拥有更强大力量的人出现的时候。我很清楚这样的危险性，但玛莉亚的命比什么都重要。
19XX年6月30日
突然，一直担心的事还是发生了，基佐伊德终于承受不住频繁输入数据的压力而失控，听说它一次就破坏了大半部分的【半岛】。
石碑上接下来还有这么一段话：【基佐伊德一旦拥有了一切，它就会化身成愤怒之神摧毁一切。】研究者们最终好像终于找到了方法，将基佐伊德关闭掉了。幸亏我当时只给了它极少量的战斗数据，如果当初就提供了大量战斗数据的话······也许别说地球，太阳系都怕会被基佐伊德给毁灭掉···
基佐伊德是个极度危险的遗产，我曾经尝试过打开它的外壳，但是并没有成功，它似乎被一种未知的力量保护着；无论如何都破坏不了。最后我做出了一个决定：将基佐伊德作为兵器的意识改成带有心灵的意识。
19XX年2月21日
我听闻研究设施发生了事故···一切，所有的一切都完了···在事故的牺牲者名单中，我看到了玛莉亚的名字。他们告诉我，我最疼爱的孙女玛莉亚，她在人生的最后一秒钟，留下了‘给所有人类希望’这句话。
基佐伊德和其他机器人并不一样，它拥有并非作为兵器的意识，而是带有心灵的意识，我决定就用这句话来作为启动它的密码。“给所有人类希望”······哦！玛莉亚！
19XX年3月31日
我无意之中发现的超古代遗产‘基佐伊德’；还有在夏特的帮助下培育出来的究极生命体······我给你们都装上了一颗“心”。
因为我始终相信这世上如果追求所有力量并非为了自己，而是出自于一颗时时刻刻想着别人的“心”的话，那这世界上也应该不会再有战争了。
天主啊，如果您愿意倾听我的愿望的话······那就请给所有人类带来希望吧······
日记到这里就结束了，看完日记之后小玲终于说话了：“原来最初发现艾美尔的是蛋头博士的爷爷吗···但是，战争真的有那么容易消除？五年前你的孙子可是因为你的缘由走入了歧途，即使现在走出迷途，他也依然憎恨着人类啊···”
“当初发掘并研究艾美尔的，恐怕应该是那个国家了。而且从年代推测恐怕是在冷战时期。”爷爷继续说道，“幸好这位研究者是一位善良的人啊，不然恐怕就没有现在了。但没想到蛋头博士憎恨人类的原因居然是因为他···”
爱理家，“原来这就是你五年前侵略翡翠岛并向人类世界发起侵攻的缘由？！”蛋头博士向爱理她们说明了他的家族的事情，这些都在《Jewel Precure》第三十六章外传有部分讲述，这里就不再赘述了。
“但再怎么说，你做的也还是不对啊···”杰特和爱理同时训斥蛋头博士，“光是侵略翡翠岛就足够招整个次元的憎恨了，你还利用翡翠岛作为据点对这个时空发起进攻···那不就会给人邪恶又顽固的印象吗？说真的，要不是因为有Sonic作为信任背书，我们真的会···”
“你现在到底在这个时空调查什么？”雨静提出了一个关键的问题；“我在调查五十年前参与爷爷研究的所有有关人员和相关的秘密基地的所在，”蛋头博士向爱理她们说明了他回到人类世界的目的，“以及爷爷留下的遗嘱和遗产。虽然我不会再向人类复仇，但杀害爷爷和姐姐的那群人我依然不会放过！”
“那个研究是在美国进行的吧？如果是这样的话，”一样在爱理家的奈叶她们听完蛋头博士接下来的目的之后，奈叶如此说道，“我们知道在美国活跃的地球神所属的Precure，她们会帮助你的。只不过···请不要用直接动手的方式制裁他们，可以的话你不妨用杀人诛心这样的方式。”
“杀人诛心吗···谢谢。”蛋头博士感谢奈叶之后就离开了。在蛋头博士离开之后，杰特也接到了超音鼠的联络并获得了《基佐伊德的研究日记》。
“这个日记···”大家查阅日记之后都挺震惊的。尤其是奈叶：“原来不只是有‘基佐伊德’的存在，居然还有···”
“利用夏特的DNA培育出来的究极生命体？我的天啊···”杰特和爱理也非常震惊，爱理更是直接指责那个国家：“这个冷战的产物要是苏醒的话···”
很明显，就算回收了所有的巴比伦遗产，Babylon Precure估计也没法就这样消失吧。不过，究极生命体的苏醒，已经是Babylon Precure和Police Precure以及Cure Flash联手消灭法老沙漠之后的事情了。
【完】