接下来是大致的大纲。
【1】卷一是启程与出发的故事。
【2】卷二是难波重工的洗白与改变。
卷二最终战是Evolto与内海的战斗，内海为这场战斗一直准备，准备了一百零三年，存储了整个日本十年的电力以及无数次模拟战斗的数据，将自身的实力以每分钟都是先前十倍的速度提升着。
战斗初始完全压制了Evolto，从进化眼镜蛇一路打到黑洞形态，最终在内海即将获胜时Evolto展现出了自己这一百零三年来吞噬了不知道多少颗星球的绝对实力。
在即将痛下杀手时，桐生清代却突然抵达了现场，误以为是内海与Evolto又发生了些许的矛盾，Evolto最终在意外之下没有选择杀死内海。
内海察觉到Evolto改变的开始，欲言又止，没有将真相告知桐生清代，确信着她的身上存在着超越战兔的可能性。
【3】卷三北都篇，在卷二之中实际开始怀疑自己并且知晓了亲生父母死亡真相的桐生清代来到了北都，以外发现自己那当网络偶像的朋友实际就是猿渡一海的后代，并且了解到她还有一个哥哥。
卷三最终boss为复活了的Killbus。
浮士德制造出了六十体幻影猛击者特性再加上白色嵌板合体而成的最终猛击者，并且将killbas的细胞以某种手段重新赋予了活性，最终令killbus重新复活，究极的毁灭者重新现世。
killbus与Evolto相遇，没有一句废话，立刻爆发战斗，但在一连串激战过后，本应占有绝对优势的Evolto却反被Killbus击败。
“超越了信念，超越了思想与觉悟，超越了不纯的欲望与梦想，现在的我存在的根本便是为了毁灭，你的纯度与我相比太低了！Evolto！”
随后便将Evolto一巴掌拍到了月球上，独自回到了浮士德，摆脱了浮士德的控制，以享受的态度慢慢破坏着浮士德于世界上的每一个基地。
桐生清代与猿渡红海再加上及时赶来的万丈弦音，三位假面骑士打算以必死的觉悟迎战最后的Killbus。
【4】决战的同时，Evotlo在月球上重新拟态了身体，但同时也发现自己已经逐渐理解了人类的情感，还吐槽自己作为生物的复杂程度都因为这样的思考而降低了。
同时Evolto还发现了，实际上躯体是由浮士德赋予的Killbus并不是纯粹的毁灭化身，其慢慢破坏浮士德而不是直接毁灭地球的举动证明了Killbus心中存有除了破坏之外的其他情绪。
“既然自己的旅途没有终点，那么不如将这最初的起点也消灭。”
带着这样的思考过后，Evolto回到了地球，变身为黑洞热流态，以假面骑士Evol的姿态将Killbus击败，并且让其一句多余废话都没有的状态彻底消失在了黑洞之中。
【6】第四卷为外传，时间点为Evolto离开的半年后，主角为冰室纯一。
浮士德的纯一为人造人，是浮士德首领采集了冰室纯一完整基因样本创造出的人造人。
作为政治家后代的冰室纯一不保管任何的骑士道具，其所保管的是一百零三年前的真相，真正的【剧本】。
冰室纯一在十岁的时候便因为意外（实际上是浮士德安排）而失去了双亲与自己的双腿，一直生活在极度压抑的个人世界之中。
但就在其一日打算了结自己生命的时刻，Evolto突然出现，并且将星云烟雾枪交给了他，并且告知了冰室纯一浮士德的真相。
其后冰室纯一变身成为了NightRouge，以百特曼一样的姿态开始对于浮士德的行动，途中也遭遇了在对浮士德展开复仇的万丈弦音，两人很快从互相无法理解转化为了并肩作战。
外传的最后，冰室纯一取出了家族传承的真相，交予了桐生清代与万丈弦音。
桐生清代真正了解到了Evolto的真面目，同时也真正的产生了迷惘。
【7】第五卷为最终卷，福音。
时间再次推动，万丈弦音准备升入大学，桐生清代也即将迎来高三。
浮士德的痕迹逐渐消失，Evolto也没有再在她的眼前出现过，所有的假面骑士道具以及真相都已集齐（不包括天才满瓶），白色嵌板，一切都应该告一段落，但是桐生清代内心却丝毫依然停留在过往的一年。
她渴望着再次见到Evolto，她想要当时没能说出来的话说清楚，无论是以怎么样的立场，无论Evolto到底是谁。
同时，浮士德的真相浮出水面。
浮士德的首领为最上魁星，在新旧世界的融合之中诡异复活了的最上魁星。
最上魁星认为自己的复活是因为世界的选择，世界是因为需要他才令他复活的，所以他窃取了战兔的遗产，所以他创造了浮士德并且蛰伏了上百年。
实力已经完全超越危险等级可以描述范畴的最上魁星轻易击败了坦坦形态的桐生清代以及岩浆龙弦音，拿走了所有道具与白色嵌板，并且以高高在上的姿态嘲笑了桐生清代居然会信任一个曾经谋杀过全人类的怪物。
【8】最终，最上魁星开启了秘密开发完全的Enigma。
在拥有了白色嵌板之后，抵达了完全的Enigma拥有着窥视世界线并且予以选择的能力，也就是将不可思议的奇迹化为平凡现象的能力，世界线在一秒钟内被最上魁星进行了上百万次的调整，森罗万象都在改变，世界朝着其理想的乌托邦驶去（大概就是天堂制造）。
【9】最终的决战终于开始，万丈弦音的危险扳机+岩浆龙瞬间便被秒杀，天才也只是靠着多种多样的能力多撑了几秒钟就倒下。
Enigma崩解，世界恢复为了原样，而Evolto这一次没有选择离开，桐生清代也没有选择逃避，但此时此刻无论是桐生清代还是Evolto都是遍体鳞伤，没有再战斗的余力，最终两人约定在明天，也就是8月26日再次相见。
【10】进入结局，再一次的相见，Evolto以真实的自己（怪人）遇见了明悟了自身的桐生清代（骑士），但桐生清代却无论如何都升不起战斗的欲望，Evolto也感觉不到破坏的兴趣。
无奈之下，两个人解除变身并再次回到了城市之中，两人就像是曾经旅行一样的闲逛着，并且沟通着。
桐生清代说出了自己想要成为科学家的梦想。
Evolto也向其说明了自己会来到地球的原因，Blood的历史，并且直接说明了……
但随后，桐生清代却也表示。
“我早就猜到了，实际上从遇到埃尔伯特先生开始，我就有了埃尔伯特先生其实就是怪物这样的设想。”
桐生清代也嘲笑Evolto是Blood之中的败类，明明是为了毁灭而诞生的种族，却在事实上保护了地球好几次。
两人最终站立在了夕阳之下，桐生清代想要试着说出自己的心意，但Evolto却直接粗暴的提前予以了拒绝。
“有什么话想要对我说，至少得要先追上（击败）我才行。”
“那我可是会不择手段的也要追上（击败）你的。”
两人最终立下了约定，于夕阳下分别。
【11】
进入后记篇章。
随后Evolto将白色潘多拉嵌板留在火星上，将其留给了终有一天能够正确使用其力量的人类们。（潘多拉之盒之中既有绝望也有希望）
………………