回到胜利队的真一，再次回到了怪兽出现→出动→变身打怪的节奏里面，偶尔也会跟真由美出去玩。
泽井总监虽然全力的展开了对丹后博士的调查，但是并没有任何的进展。
在宗方提到了那个神秘的装置之后，经过南原参谋的确认，那种级别的科学仪器只有那些大财团能够做到。
泽井总监也展开了针对那些财团的调查。这里面也包括了正木敬吾。
但这些大财团哪个是省油的灯，无论和这件事有没有关联，一个个的都把自己伪装了起来。
没办法的泽井总监只能继续派遣新的调查队开始调查。
另一边，真一的寝室内。
“所以说，那个光名叫进化之光，是类似卡欧斯头部的东西？”
真一正拿着进化超越者问道，经过了上次事件之后，进化超越者好像是不需要再牵制那种光了，跟真一的交流也开始频繁起来。
“是的，根据你记忆中的卡欧斯头部来看，进化之光就是跟卡欧斯头部同源的光。”
本来已经习惯进化超越者沉默的真一发现，这玩意儿好像有变成话痨的趋势。
真一又问道：“这个光在我体内消失了之后，对我有什么影响吗？”
“这个你放心，进化之光的本源还在你的灵魂深处繁衍生息。”进化超越者说了一句令真一浑身难受的话：“毕竟他和卡欧斯头部一样，是一种奇特的病毒，不会真的消失的。那个魔神将这股本应该在你更强的时候才觉醒的力量提前勾了出来，现在看来，那个人类抽走了那些暴躁的进化之光对你来说还是一种好事。”
之前丹后的作战，使真一的能源核心变成了淡红色，现在随着时间的推移，真一的胸口再次变得亮红。
可真一还是担忧的说道：“进化之光毕竟有很大的破坏力，万一被人利用的话不就糟了？”
“你装可乐的杯子再大，没有可乐机，你喝完这一杯不就没了？进化之光也是如此，没有你的灵魂，那些光就会慢慢的被耗尽的。”
真一这才放心，要是脱离他体内的光还会不停地增生，那样的话就糟了。
某一天，众人正在指挥室里工作，突然收到了警报，众人立刻出发。
真一和大古乘坐飞燕一号，其他人乘坐飞燕EXJ，这是一种经过武器研发部门改造的新式战机，能够分离成两个独立的战机。
“野瑞！怪兽前进的方向是哪边？”
野瑞立刻跟宗方说道：“指挥，怪兽正在前往下北泽！”
听到这个有些熟悉的地名，真一不由得想起了前世的一些事情，但是很快就被大古的声音打断了。
“这里是大古，我和真一先过去了！”
看着率先前进的飞燕一号，宗方立刻说道：“新城，你去β机上待命！”
“收到！”
等大古来到下北泽的时候，飞燕一号上面的两人也看到的类似鲨鱼鳍的东西。
“是在地底游动的鲨鱼吗？”
大古说完，拿出通讯器说道：“已经看到了怪兽的踪迹，现在怪兽没有动作，请指示！”
居间惠听到之后立刻说道：“先扫描一下怪兽的具体情况！”
大古听到之后，悬停在了怪兽的正上方，开始准备扫描怪兽。
就在这个时候，鲨鱼鳍突然释放了一道光波，笼罩了飞燕一号。
大古和真一同时感到不对劲，大古拿出神光棒，发现自己的神光棒居然开始冒着微光。
真一满头地黑线：“你还是像原来那样闭嘴吧！”
大古听到真一的吐槽，急忙说道：“真一，你的变身器也有反应吗？”
“你别理他，他在那里闹着玩呢。那个扫描器应该是上一次那个窃取我力量的人布置的，应该是冲着你来的。”
大古惊讶的说道：“这么说，这个怪兽很有可能是人造的？”
正在两人讨论的时候，飞燕一号的仪器突然全部失灵了！
大古立刻跟宗方说道：“指挥！飞燕一号无法运转了！”
新城听到大古的声音，立刻进行了战机分离来支援飞燕一号！
“大古！我来支援你！你可别掉下去了！”
听到新城的话，正在全力操控飞燕一号的大古咬着牙说道：“你说的倒是简单！”
新城操控着β机对着怪兽的背鳍发射了光弹，攻击使得怪兽无法在影响飞燕一号的系统。
看着恢复正常的飞燕一号，大古松了一口气：“太好了，恢复控制了！”
“好什么啊好，你看看前面。”
飞燕一号，再起不能。
另一边，随着飞燕一号的坠落，地底鲨鱼也准备离开现场，崛井看准时机，朝着怪兽发射了一个追踪器。
等到众人把真一和大古救出来之后，发现两人都没有太大的伤势。
真一挂着死鱼眼说道：“我再和大古坐一架飞机我就是狗。”
崛井正一脸疑惑的看着自己的追踪器，以往十分好用的追踪器现在连一点反应都没有。
真一跟崛井说道：“会不会是那个怪兽自身携带的电磁干扰。”
崛井纳闷的点点头，现在看来只有这个可能了。
此时，指挥室内。
泽井总监正在看着胜利队众人，喃喃的说道：“......一定有关系！”
居间惠听到之后，疑惑的问道：“总监，你知道什么吗？”
泽井总监回头之后，犹豫了片刻。看到泽井总监的神情，居间惠知道这可能是涉及到机密的事情。
正准备岔开话题的居间惠，看到泽井总监举起了手说道：“没关系，这件事你有权利知道。其实，最近几天，秘箱一直有反常的震动，我担心会不会和这个怪兽有关。”
居间惠从来没听过秘箱，泽井总监便跟居间惠解释了一下。
所谓的秘箱，就是存放远古奥特曼石像的箱子，在哥尔赞和美尔巴被消灭之后，TPC本来打算回收那些石像的碎片，可就在采集作业进行的时候，石像居然开始快速的风化。
TPC到最后只收集到了一小部分的样本，泽井总监立刻下令，在出现能够防止样本风化的技术之前，不允许打开秘箱。
而在丹后博士背叛之前，这个秘箱一直是由他保管的。