战争结束后，千界树一族的参战者一边进行修缮因为战争而破损的城堡，一边积极运作，和时钟塔进行和谈。
因为有“第二魔法使”和“时空魔法使”的介入，时钟塔没有过分追究千界树一族的叛乱，只是象征性地做出了些惩罚草草了事。
虽说有超过半数的领主对此表达不满，但在老人“新收三名弟子”和士郎“如果不照做，你们的封印指定执行部就不想要了。”的诱惑和威胁下，毫无节操地抛弃了原本的坚持。
虽说成为“宝石翁”的弟子基本等同于和废人划上等号，但并不是没有例外，而且这也能和神秘世界当之无愧的巨头拉近关系的好机会。而且时空魔法使的存在也让所有人激动不已，可惜的是没有见到本人。
转眼之间，时钟塔的领主们将千界树一族叛乱一事抛到了九霄云外，每个人都跑回各自的门去，没日没夜地为了选拔人选，不停地骚动着。
在这样的大背景下，只用了半个月的时间，圣杯战争的余波悄然抚平。为了表达诚意，菲奥蕾的胞弟，考列斯·弗尔维吉·千界树入学时钟塔，成为了有着“问题儿童收容所”之称的“艾尔梅洛伊教室”的成员。
蕾蒂西亚在战争结束的三天后离开罗马尼亚，回到了法国。平时最听话乖巧的学生突然离开学校，下落不明十多天，虽说有室友代为请假，可随着时间的推移，必然会引起校方的怀疑，尽快回去是最好的选择。
之所以拖了三天，一来是因为千界树一族要准备一个合适的理由，二来，蕾蒂西亚和贞德也有些舍不得这些并肩作战的友人们。
几天以后，贞德才在抑制力的呼唤下离开。
差不多同一时间，千界树一族也完成了善后处理，成员各奔东西。
罗歇带着离开了米雷尼亚城，前往福雷因家族的工房继续自己的研究。
塞蕾尼凯也落魄的离开了。
戈尔德也走了，带着部分人造人返回穆吉克家族，一方面进行人造人的续命研究，另一方面他要好好教育自己的儿子，以免他走自己的老路。
达尼克和菲奥蕾维持家族的稳定。
夜晚的时候，菲奥蕾经常这样想道:“我们还能再见面吗？”
…………分割线…………
士郎和赛米拉米斯现在在飞船上。
这是一艘由黄金和绿宝石打造的游鱼形状的不明飞行物悬浮在空中。
乘坐的飞船名为“维摩那”，是记载于古印度神话最核心的的两大史诗《罗摩衍那》和《摩珂婆罗多》中的神话之舟，士郎的银色涟漪跟吉尔伽美什的“王之财宝”有很多不同的地方。
一是“王之财宝”中拥有有所有宝具的原型，或是人类发明的的雏形与古往今来的财宝或珍品。但是却无法解放真名使用。而士郎的银色涟漪空间出现的宝具可以解放真名。而且威力比起使用者还要强上一个等级。
二是“王之财宝”没有新人类创造出的，以完全崭新的概念来实现的东西和以其他天体的智慧生命体的文明技术来实现的东西。士郎的银色涟漪中有这样的物体，因为第一魔法，第四魔法的原因。他可以行走在空间和时间中，除非空间的概念消失了，不然只要是以概念存在的东西都可以在里面。
三是“王之财宝”里面最强的宝具是天之锁和被吉尔伽美什称为EA的“天地乖离开辟之星”，而士郎的银色涟漪出现的有恩奇都的光之钉的升级之力和三把士郎在成为守护者之王时期制造的三把枪。
“想不到Master连这个都有啊。”赛米拉米斯有点惊讶。
“让你惊讶的还在后面的。”士郎笑道。
“闭上眼睛。”士郎道。
赛米拉米斯不解。
士郎打了一个响指。
赛米拉米斯感觉到有一阵风袭来。于是她睁开了眼睛。
“这是？”赛米拉米斯第一次发现这样的东西。
“无人驾驶飞机！这个是吉尔的宝库中都没有的。”士郎道。
“连英雄王都没有的啊。”赛米拉米斯惊讶了。
气氛陷入了沉默。
“赛米拉米斯，是想回英灵殿了吗。”士郎问道。
“我们英灵跟你们魔法使不同，我们注定是要回英灵殿的。”赛米拉米斯有点落寞。
“那去我的英灵殿，怎么样？”士郎笑着问道。
“Master,你也有英灵殿？”赛米拉米斯震惊了。
“走吧！”士郎牵着赛米拉米斯的手，随后两人闭上了眼睛。
士郎和赛米拉米斯到了一处区域。
“看吧！”士郎道。
赛米拉米斯看向周围，被震惊了。
“这是英灵殿！！”
士郎和赛米拉米斯到达了殿外。
“嗯，不过是我得到的英灵殿的一部分能力自己建立的。”士郎道。
“什么意思。”赛米拉米斯不解。
“我建立的英灵殿与抑制力的英灵殿不同的是，这里的英灵，只要是与我有契约的，就不会再返回那边的英灵座。”士郎道。
赛米拉米斯震惊了。
“也就是说……”赛米拉米斯道。
“也就是说，只要是我契约的英灵，经抑制力同意后就会到这里来。”士郎推开了门。
“嗨。士郎。你来了。”一个穿着红色连衣裙的女性英灵跑了过来道。
“你好，尼禄。”士郎道。
“你好，士郎。”许多英灵朝着士郎打招呼。
有圆桌骑士的高文,特里斯坦，有罗马的暴君尼禄，有英国的传奇女王布狄卡，有夏洛克·福尔摩斯，有安徒生，有莎士比亚。至少20位欧洲的英灵。
“嗨，爸爸。”小杰克跑了过来道。
“杰克也在啊。”士郎把她抱了起来。
“大家，我先走啦，要好好相处啊。”士郎道。
“好的，士郎。”后面传来了一些笑声。
赛米拉米斯和士郎回到了无人驾驶飞机上。
“这些英灵是怎么认识你的啊。”赛米拉米斯问道。
“他们有的我曾经参加过圣杯战争的英灵，有的是曾经一起执行拯救人理的伙伴。”士郎道。
“人数不多，还是强大的英灵的。”士郎道。
“对了，我看那个罗马的暴君尼禄看向你的眼神有点不对啊。”赛米拉米斯道。
“别提了，每次我去那边，她就找我。”士郎苦笑道。
士郎从口袋里拿出了七张金卡，上面显示有7个职介。
“这是？”赛米拉米斯问道。
“这是我做的魔法礼装。如果他们想在现世活动，就可以通过这个召唤他们。”士郎道。
“Saber的这个怎么有点淡啊。”赛米拉米斯道。
“因为有一个Saber已经在现世了啊。”士郎道。
“那是？”赛米拉米斯问道。
“亚瑟王阿尔托莉雅·潘德拉贡！”士郎道。
“根据抑制力和我的约定，要在现世待着，也是需要条件的。”士郎道。
“什么条件？”赛米拉米斯问道。
士郎按着赛米拉米斯的头部，赛米拉米斯感觉自己回复了英灵本体的力量。
“这是我用第三魔法天之杯得到的力量。可以让英灵暂时性的受肉。”士郎道。
“我感觉我的力量接近于本体了。”赛米拉米斯惊讶道。
“现在你是从者，而不是英灵的本体啊。”士郎苦笑道。
“那我也可以去你的英灵殿吗？”赛米拉米斯问道。
“你想去吗？”士郎最后确定了一下。
赛米拉米斯点头。
士郎的手上出现了一个光球。他拿着光球朝着赛米拉米斯扔了过去。
“这是？”赛米拉米斯不解。
“你先回抑制力那边的英灵殿就知道原因了。”士郎道。
十几分钟后，赛米拉米斯就回来了。
“赛米拉米斯，你回来了。”士郎微笑道。
赛米拉米斯递给士郎几张纸条
“这是？”士郎疑惑了。
【嗨，士郎酱，虽然你没有办法作为我们的守护者，你还是可以选择自己的人生的，之前将你一直想见的阿尔托莉雅送过去了。惊不惊喜，意不意外。】
【那个盖亚就喜欢说废话，听好，士郎，之前给你的英灵殿的能力在经过我们同意的情况下，那些与你有契约的英灵就可以成为你的专属英灵了。】
【对啊，士郎酱的专属英灵，和我们英灵殿的英灵都是差不多的，不过只会接受你的召唤的。就算有圣杯战争，别人也是无法召唤的】
【是的，士郎，知道原因吗，那就是你的专属英灵，特别是女性的英灵，基本都对你有爱慕之心的。】
【没错，士郎酱已经成为魔法使了，开后宫是没有问题的，嘻嘻，我和阿赖耶希望士郎酱多开后宫哦，有的女性英灵生前因为感情问题而死的，就让士郎酱来帮助她们给予她们吧。对了，贞德也在士郎的英灵殿了。她一直想见士郎的。】
看完他们给的纸条，士郎彻底愣住了。女性英灵一大半就是他的后宫。他觉得盖亚和阿赖耶在报复他和坑他。
士郎发现赛米拉米斯也是一脸通红。
“那个，赛米拉米斯。”士郎打算说什么的时候赛米拉米斯吻住了他。
“夫君是不喜欢妾身吗。”赛米拉米斯放开了士郎后，深情的看着士郎道。
士郎回吻了赛米拉米斯，然后道:“压抑感情太久了吧。”
赛米拉米斯红着脸点头。
士郎回抱着赛米拉米斯，道:“不后悔吗？我可不止一个女人呢。”
“妾身不会后悔呢。夫君是最棒的男人。”赛米拉米斯靠在士郎的肩上道。
士郎把赛米拉米斯公主抱了起来，接着传出阵阵娇媚的喘息声。