很久很久以前，在一座叫奥多马雷的岛上住着一位老公公和一位老婆婆。
一天，他们在海边救回一对受伤的小兄妹。
在两位老人的细心照顾下，两个孩子所受的伤渐渐痊愈了。
但是突然有一天！
邪恶的怪物来侵袭岛屿了，就在岛屿就要被怪物吞噬时，在老公公和老婆婆面前，小兄妹的样子发生变化。
原来他们是无限小精灵，拉帝欧斯和拉帝亚斯。
两只宝可梦飞向空中，呼唤来他们的同伴。
他们带来了赶走黑暗邪恶的力量。那是一颗叫心之水滴的宝石。
于是岛上恢复了和平。
从此之后，拉帝欧斯和拉帝亚斯经常拜访这座心之水滴所在的岛屿，并且再也没有邪恶的怪物来袭击岛屿了。
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在桧皮镇海边的一间博物馆里，有两个人正在偷偷翻阅着有关奥多马雷和心之水滴的文献。博物馆昏暗无比，只有那两个人的手电露出光芒。
哒……哒……哒……
脚步声近了，两人从容不迫地将手中的古籍揣在怀里，互相对视一眼。然后从窗户悄无声息地翻越而出，顺着自己设置的缆线，很快就从博物馆一侧的悬崖下到公路上。
两人坐进了自己的车子，户外的月光使得两人的面容变得清晰。那是两个长得很漂亮的女性，一个银色短发，另一个则是黄色的双马尾。
她们就是在盗贼的世界中排名第一的——桑娜和莉安。
而在博物馆，走入两人原先窃书的地方的，并不是她们想象的带着手电的保安。而是穿着海蓝色大衣，围着白围巾的宇落。
“还是慢了一步吗……看来必须要去奥多马雷了……在那里，掣肘就变得多了许多了……”
宇落并没有注意被两人带走的书的原本位置被一枝玫瑰取而代之。两边的书向中间倾倒，压弯了里面的纸牌。
同样，宇落也是顺着窗户跳了出去，看着奥多马雷的方向，看着海面渐渐消失的光点，默默地想着。
[希望一切顺利……]
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海面上，桑娜和莉安开着由汽车变成的飞机，向着奥多马雷行进。车上——
“什么传说故事吗……没意思。”
“心之水滴和传说的神奇宝贝拉帝欧斯和拉帝亚斯都是存在的……而且传说里还有隐藏剧情……”
“这不重要！只要有宝石就够了……”
“还有比宝石更美妙的东西呢……”
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水都——奥多马雷，被誉为全世界最美丽的城市。因为其城内小型运河错综交叉，亦被称为水之都。
它类似于宇落家乡西方罗马政府的水城威尼斯。曾经宇落为了追捕一个敌人，去过威尼斯。并为之惊叹。
而现在，雪拉比叮当所说的活动，已经开始。这就是奥多马雷最著名的——水上竞速大赛！
在其中，小智、小霞以及他们的小锯鳄、太阳珊瑚，正在水中等待出发。
“3”“2”“1”“开始！”
随着三只天然雀和一只天然鸟的报时发令，所有人立刻破浪而出。
开始了激烈的角逐。
很快……
小智、小霞以及上一年的冠军罗西，就拉开了其他人很长一段距离。
而此时，宇落正在……
坐着一只吼吼鲸，向着奥多马雷前进。
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而就在比赛进行的时候，有的人发现了，面前的光线似乎偏折了。而如果有这种感受的人所在的点连成一条线，不难看出，这是沿着水上竞速赛道上发生的。
正是水都的守护神，拉帝欧斯与拉帝亚斯。
这个时间段，拉帝亚斯还没有变成人身的能力，只能通过光线的偏折而制造幻象。但是拉帝欧斯则是可以。
跟着比赛的选手们，看着他们的角逐，即使是已经成年的拉帝欧斯，也是很轻微的扬起了嘴角。他还并不知道，未来会发生的悲剧。
只是看着欣喜的拉帝亚斯，明明即将成年，却丝毫不喜欢训练的，一点也不成熟的妹妹。眼中有无限的宠溺。
“啊！”
这是一个急转弯，小智和他的小锯鳄没有控制好平衡，从冲浪板上摔了下来。因为小智身上的凤王的气息，使得拉帝亚斯飞到墙边接住了他。
突如其来的，拉帝亚斯抓住了小锯鳄的绳子，让小锯鳄的速度突然变得很快。
迅速赶超了其他选手，甚至也超过了领先的小霞和罗西。就在胜券在握的时候，拉帝欧斯似乎感到了什么，带着拉帝亚斯离开。
但是没想到拉帝亚斯忘记了自己还带着小锯鳄的绳子。让小锯鳄和小智却突然转入了错误的水道。冲上楼梯又掉下水后总算停了下来。
而在另一边，小霞凭借太阳珊瑚的角的优势，成功的拿下了水上竞速赛的冠军。
比赛结束，前冠军罗西带着小智一行人乘坐着他自己的小舟，游览奥多马雷。还向小智他们介绍了奥多马雷的守护神——拉帝欧斯和拉帝亚斯。
“我们一直相信，即使还是现在，水都的双子依旧会守护着我们……”
罗西是这样说的。
与此同时，宇落刚刚到达奥多马雷。
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然后，桑娜和莉安，向着奥多马雷的各地散布了监视器。姐姐是这样说的：“拉帝欧斯他们会化成人的样子，一定混在人群中，但是他们的体温一定与人类不同！”
这个理论就很神奇了……
传说中的小精灵若是变成人类，其实是与人类并无二样的，包括体温、激素、身体器官等等。
若是说体温与人类不同，那只有两种可能。
一是，他们本身就与人类相似，简单的打扮一下就可以在外表上与人类一样，但是体温之类的依旧是小精灵的特征。
另外一个，那就是小精灵其实并没有变成人形，他们只是给自己套上了一层幻象而已……
很不幸，拉帝亚斯中招了……
“找到你了！拉帝亚斯酱~”
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小智一行人下了船，和罗西道别后打算去买些吃的。
皮卡丘却心不在焉地走进了一个小广场，见到了一位少女。
这时，小智跑回来。他向少女问好。而少女一句话也没说，盯着小智围着他，转了一圈。好像在嗅着什么气息。之后微微一笑，跑开了。
少女穿过小巷，在水道边行走，两个女贼却悄悄从后面跟过来。
透过她们特制的墨镜看到，少女正是拉帝亚斯
桑娜一句话说破了少女的真面目，少女看来者不善转身就跑。
但是，桑娜和莉安的太阳精灵和阿利多斯控制住了拉帝亚斯。若非皮卡丘感受到了异样，带着小智过来解救了拉帝亚斯，恐怕实力在当时仅仅是精英级的拉帝亚斯就会被抓了吧……
短暂击退了桑娜和莉安，小智和拉帝亚斯在奥多马雷的小巷中穿行。先是小智带着乱跑，后来变成了熟门熟路的拉帝亚斯带跑。
很快小智就找到了小霞一行人。但是拉帝亚斯也消失不见。
在另一边，想要追击拉帝亚斯的桑娜和莉安，被人堵上了……
“你是谁？”
桑娜看着站在自己姐妹面前的，直面两只准天王而面不改色，甚至击退了他们的人，面露惮色。
“你也是为了心之水滴而来的吗？”
在她们对面，宇落看着两人。淡淡的说：
“差不多……我是来……阻止你们的！”