这是一个有着真正的神明存在的世界。
遍布日本全境的，是传统的民族宗教“神道教”。即使世界已经迈入现代社会，神社和宗教在这里也占据了人们生活的一部分，在人们心中有着很高的地位。
诸神隐入幕后，不再现身人前，只是接受着人们的信仰与供奉，同时还以些许的“恩惠”罢了。
然而，因为一个意外的发生，这本该是和平而又繁华的世界，却在悄然之中逐渐步向毁灭。
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“出现了。”
某个宏大而又朦胧的声音，在未知的空间中响起。
“拥有着‘资质’，可以与我们‘相连’的人类，正一个接一个地出现。”
空间在震荡，诡异的气氛不断蔓延。
紧接着，另一个声音响起。
“......这是紧急的异常事态，必须通报众神......共同商讨。”
“声音”渐渐地传开，跨越了空间向远方扩散而去。这不是人类所能理解的声音，而是某种高次元的存在所拥有的，意识之间的交流。
“是吗？人类居然踏入了神域啊，的确是值得讨论的事件。”
“这种行为绝不容许，必须阻止，神之领域不是微小的人类可以进犯的！”
“荒谬，荒谬，我等天之神必须对此加以惩戒——”
一个又一个的意识从黑暗中醒来，时间逐渐流逝。
“天照大神，我等诸神的领袖，照耀天地的太阳，高天原的统治者，请您为此事做下定夺吧。我等，究竟该如何应对，如何处理这异常呢？”
声音回荡在空间之中，意识的交流逐渐停止了，天之神们静静地等待着，等待着那位大人的回应。
然后，“太阳”从黑暗中升起了。
“人类......傲慢、卑劣、渺小，多么可悲的生物啊。”
强大的灵压扩散开来，震撼着诸神们的意识。天照睁开了她的眼睛，望向了遥远的世界，在那里，有着壮丽的山川，绵延的河流，以及，遍布大地的人类。
“战争，侵略，强夺，”天照缓缓说道，“我们已经见识了人类的劣根性，每次出现都是一场灾难。”
“如果人类获得了我等的力量，那么一切都将无法挽回，这颗星球将会被人类的恶质毁灭，我等也将无法幸免。”
“那么......”
“毁灭吧，用我等的力量给予人类制裁，将其从大地上灭绝，根除后患。就以——”
“苇原中国真正的统治者的身份！”
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“这不可能，天之神啊，是想打破数千年来我等修订的盟约吗？”
大地在震荡，地之神的怒火直指苍天。
“这片大地上的人类都是我等的子民，与我诸神已经共存了数千年，怎能轻易毁灭？”
“人类纵有缺陷，祸乱大地，我等亦然感到遗憾。但罪不至死，天之神竟如此蛮横无理，可恨，可恨！”
“纵然实力不济，我等也要拼尽全力，让独断专行的天神们见识见识地之神的愤怒！”
“绝对不能让高天原得逞！”
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“去回报给我的姐姐吧，这次是高天原挑起的战争，我无法相助。”
宁静的意识回荡在黑夜之中。
“您是要，站到地神的那一边去吗？”
“地神的反抗是意料之中，但这与我等无关，我等对于人类的看法没有改变。还请告诉天照，夜之食原两不相帮，也不会对地上的人类发起攻击。”
“......遵命”
意识渐渐地远离了，明亮的月亮陷入了沉思。
“这场动乱，究竟会如何收场呢？”
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2015年夏季，高天原
天照大神与其弟须佐之男的谈判破裂，须佐之男叛逃离开高天原，前往自己的领地海原。地上的众神与须佐之男联合，与高天原的诸神在次元的夹缝间展开了决战。
一开始，双方相持不下，战斗持续了数周。但由于实力上的差距，即使是获得了天地间最高位的三柱神中一柱的帮助，胜负的天平还是逐渐导向了高天原那一边。
而“神器”的启用更是加速了地神阵线的崩溃，即使是须佐之男也独力难支。
事到如今，地神们也只能无可奈何地承认了自己的失败，从战场上撤退回到自己的领地。
地神是与大地、自然相关的神明，由于地神们的灵体都受到了不同程度的损伤，损伤被反馈到现实世界，引发了地震、山崩、海啸各种灾难。
同时，获胜的天之神则开始了他们的计划，巨大的神力结界在宇宙空间展开，包围了整个星球。
天神以此实施他们的毁灭计划，创造出持有些许神力的量产生物——vertex，vertex拥有战斗用的智能，可以自行分裂、复制、组合、进化。
以天神的神力可以无限制地生产vertex，其特性超越了地球上的一切生物，是完美的杀戮兵器。
七月三十日，天神向人世投放了已经制造完毕的vertex，世界陷入浩劫之中。
地神们虽然战败，但并没有放弃希望。他们固守在各自的神殿之中，建立防卫，并与残余的人类通过特定的路线开始转移。一时间，众神向着计划中的目的地——四国聚集而来。
然而，就在天神开始投放vertex的那一天，一个意想不到的事情发生了。
一道光芒从遥远的宇宙急速飞来，穿过了天神的结界，落向大地。
这一意外打乱了天神的安排，他们不禁感到疑惑。
“是什么？”
地神们抬头望去，相同的疑惑在他们心中一并响起。
“是什么？”
黑暗之中，月读命睁开了眼睛。
“是光。”
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vertex投放第二日，在海滨的一座城市里，秩序已经彻底崩溃，街道上毁坏的车辆，倒塌的高楼，零落的枪声，还有燃烧的大地。
残存的人类四散逃开，试图躲避那些白色的猎杀者，来不及逃跑的人一个个倒下。
偶尔会有刀光亮起，明明拥有免疫枪弹的身体，那些白色异形依然会被这些冷兵器斩断。
指挥人们避难的人，勇敢地与异形战斗的人，也依然存在着。
不过一切都是徒劳。
少女的长枪刺穿了一只vertex的身体，将其甩到一边。她抬起头，一只大型个体将身体上的“箭”对准了她。
少女的脸色煞白，抬起手中的枪。
“箭”射了出来，笔直地飞向了她，然后在空中爆炸了。
“哎？”
躲在一旁的人们愣住了。
“快看，那是什么？”
一个孩子叫了起来，伸手指向一旁。
人们随着他指向的方向看了过去，然后——
“......光？”
光从地面上升起，
银色的巨人，屹立在大地之上。