行星伊甸，是移居太空的地球人最早踏上的几颗星球之一。然而在这么一颗星球，也发现了原始文明的遗迹。遗迹的规模很大，联邦军和研究原始文明的机构DSSD联合开始了研究，并雇佣了（刚刚用某种手段招收到新人的）艾斯卡维特挖掘公司对遗迹进行挖掘。
“我是SMS的勇·戴逊，来为你们引路。”一架沙黄色的YF-29靠近了挖掘船，示意挖掘船向目标地点移动。“这就是迷之最新锐机体的速度……如果它参加竞速的话……”里克显然十分兴奋。
“不，I-machine再怎么快也不可能超越战斗机吧。”
（挖掘现场）
随着对遗迹地下部分勘探的深入，遗迹开始发生震动。挖掘队赶在完全坍塌之前撤出了遗迹，随即遗迹就坍塌成一个漏斗形的大坑。
在坑的正中央，一件依稀可以辨认出是红色的巨大金属物品半陷在泥土之中。正当挖掘队准备着手处理之时——
（伊甸同步轨道）
“fold out。立刻进入大气层降下程序。”
“切，真麻烦，居然要我们空中骑士团运送这种怪物……罗伊德那家伙怎么想的？”
两架不明VF带着一群圆盘生物降下了伊甸的大气圈。
（章节名动画~）
“还是……找联邦军帮忙比较好吧。”新被吸收进公司的玛雅说道。
“没办法，联邦的驻军在星球的另一侧，通信也不太正常，这里只能硬上了。”
两年前格里普斯战争期间在地球联邦军中服役过的挖掘船的船长格雷曼吐出这么一句话。
贝加兽，那是在格里普斯战争之间趁乱入侵地球的贝加星联合的主力侵略兵器的总称。当时来到地球的古莲泰沙和各种联邦系军事组织为了应付这些魔物着实伤了一番脑筋。
“啧，这就是边境星区新出现的那种VF吗……”原本引路的勇和YF-29也只好加入了战斗。他的对手是来自温德米尔空中骑士团的两骑SV-262。
这时，恰好路过的伊甸本地少年科斯摩和他的伙伴误入了挖掘地区，并进入了废墟中央的红色机械。似乎是响应了他的操作，伊甸王从废墟之中站起。
贝加兽的目标似乎就是伊甸王，但巨神轻松的手撕了两台扑向它的贝加兽。随后，伊甸王、VF和I-machine组成的临时战线，开始了对入侵者的反攻…