二十一世纪初期，保护伞公司是全美最大的企业体。
表面上，它是世界顶尖的电脑科技、医疗保健的供应者，连员工都不知道其庞大利润实来自军事科技、基因实验，以及生化武器。
它的三位创始人分别是奥斯威尔·E·斯宾塞、詹姆斯·马库斯、爱德华·亚希福特，其势力范围包括政治、经济、军事的方方面面，实际上是一个垄断组织。
浣熊市是个典型的美国中西部高科技城市，其经济广泛地受到保护伞公司所支配。该公司对于城市的各项计划慷慨地提供资金，借此创造浣熊市民心中的正面形象。虽有50%的市民受雇于此家国际企业，但大多数的人们对于该公司许多不法的活动仍一无所知。
在浣熊市的边缘位置有一栋别墅古堡，外形非常的美丽。
尤其是傍晚时分，夕阳红彤彤的挂在古堡顶上，美的像是一幅油画。
一个不速之客的到来，打破了这份平静，他穿着一身漆黑的连帽衣与长裤，脸被藏在帽子的阴影中， 这个人自然是李林。
古堡的下方有一条通往保护伞公司秘密实验室蜂巢的路。接下来整个《生化危机1》的三个小时剧情，都会在那一栋古堡下的巨大蜂巢中发生，里面有他想要的T病毒， T病毒全称“Tyrant－Virus”，T-病毒最初的设计方案是抗衰老、治疗神经方面的疾病，它具有激活死亡细胞的能力。
它会与接受病毒的人融合并把宿主变成以下两种情况，变为怪物，拥有超强能力，外形不变，拥有超强能力。
而且，如果成功融合了T病毒会获得超能力，普通人没有不想获得超能力的。
女主角爱丽丝获得了念力，大反派威斯克更是拥有着极速移动这一能力。
这将会很好的帮助李林将身上的黑光病毒变得更强，而且比起T病毒，李林更想获得G病毒，它除了可以改变生物的遗传因子以外，还会使受感染的生物在基因水平进化、变异，甚至能遗传给子孙后代。
G病毒的会不可控的变异，这个变异的方向是不定的，可能朝好的方向也可能朝坏的方向，但对于有着黑光病毒的李林来说，他可以操纵自己的细胞，选择往想要的方向变异并将其整合到自己的能力中。跟别提蜂巢中存在的人工智能红后。
进入别墅是肯定的，但不是现在。
“还没开始，时间在这个点吗？”
他没有选择立刻进入别墅，想要进入蜂巢，显然就必须让原电影中的可怜雇佣兵帮忙，他们掌握着密码。
夕阳终于慢慢的落山了，夜色如墨，瞬间吞噬了天边的红霞，并在眨眼之间侵略了整个世界。
周围安静的可怕，风吹动，却没有声响。
突然出尖叫声的怪鸟不知身在何处，只是这突然尖锐的一叫让人心慌。
如同突然划破夜空的猛鬼尖啸，让人忍不住的打了个哆嗦。
李林缓缓的向着古堡的方向走了过去，并在墙角位置站定，躲藏好。 全身都是黑色的他只要不发出响声，就不会被发现。
靠近古堡的地方安静的形成了一个无风区。
只是这无风区很快便被天空之上的强风给打破，一架直升机横空停在别墅顶端。
李林只听到头顶树叶被大风刮的哗啦啦直响，螺旋桨的声音也越来越清晰。
他将身体贴近古堡的墙，只是双眼紧盯着右方位置，他知道在那个窗口雇佣兵小队即将登场。
果不其然，紧接着强烈的照明灯将靠近窗户的一侧照的宛如白昼，幸亏李林藏在犄角旮旯里，不然少不了一番麻烦。
几根绳索从直升机上被抛下来，不停的有雇佣兵顺着绳索滑下来，他们打碎了窗户，直接破窗而入。
直升机并没有过多的停留，在盘旋了一会儿，收起了绳索之后直接离去。
李林紧贴着墙，直到照明灯撤去才从墙角出来。
而此时已经失忆的爱丽丝显然如同剧情中那样，和雇佣兵小队队长詹姆士发生了冲突。
呵斥，询问，以及爱丽丝的高声反抗，李林听得真切，却没有上前英雄救美。
虽然对方是个红衣美女，却不值得他毁掉自己的计划。
王歌等了一会儿，古堡中渐渐安静了下来。
应该是去地下室了，不过他还是谨慎的又等待了五分钟，确保房间完全无声才进去。
吱嘎
摄像头扭动了一下，将镜头对准李林，红点在不停的闪烁。
应该是人工智能红后正在通过摄像头对李林进行观察。
他突然跳起来，右手变成爪子将摄像头捏碎，走到了刚才雇佣兵进入的入口位置，门突然自己开了，看来是红后想要把李林引入蜂巢，进去之后，门有自己关上了，估计是想断了后路。
当所有雇佣兵登上了火车并找到了史宾斯·帕克斯时，李林用超越人类想象的速度跟在火车后面奔跑，当火车开始停下的时候李林跳上了地铁的天花板上，趁所有人离开火车的时候找到了放着T病毒和疫苗的箱子。
【完成支线任务：取得T病毒与疫苗。（奖励点数1000）】
李林看着系统的提示，又看了看倒计时。
【系统主线任务：离开蜂巢】
【传送冷却倒计时：23：03:20（冷却完毕后可选择回归系统空间）】
关闭面板后李林开始偷偷摸摸的尾随雇佣兵。
“杰迪”
詹姆士双手端住枪，对着自己身旁的一个队员扭头示意了一下。
那人带上了夜视仪，缓步踏入了基地之中。
现在基地漆黑一片。
啪嗒啪嗒的脚步声，在空旷且安静的黑暗空间中尤为清晰。
“找到了”
一分钟后，缓步前进的杰迪停下，按下了一个按钮。
然后整个空间亮了起来。
他找到了灯的开关。
双眼重获光明的瞬间，所有雇佣兵小队的成员瞬间冲了进去，展开了戒备。
“消灭剂清除干净”医疗兵拿着一个一起检测了一下，所有人才真正的有些放松。
“窗外有风景，地下工作还不错”麦特，也就是一开始想要困住爱丽丝的年轻人走到窗户前，看着窗外的风景道。
现在外面是晴天，太阳很亮。
不过麦特的双手被手铐铐住，因为他的身份无人能够查证，雇佣兵们却又不想将他击杀，为了避免意外生，只能将他拷住，还好他很明智没反抗。
爱丽丝站在麦特的身边，瞄了一眼窗外的风景，背靠在窗户上没有说话，而是在想着其他的事情。
自己一人的思考没有持续多久便被打断了，前往探查情况的雇佣兵们现电梯因为未知的原因摔了下去，如果想要到达最下面人工智能红后的主控室，只能选择走楼梯了。
一行人不得不迅的开跑。
爱丽丝还记得，一个雇佣兵好像拿了个定时器放在了入口处，时间是2小时48分。
本来，大本营中的设备如果完好，这一趟来顶多2o分钟，可现在，事情展的好像并不简单。
如果他们不能在规定的时间出去，爱丽丝想不到接下来会生什么，是爆炸？还是其他的？
所以他们只能跑起来，时间有些紧张了。
狭窄的楼梯通道，钢化的楼梯扶手无其他杂色。
只有在拐角的地方有一个保护伞的标志，仅此而已。
“报告情况”
“红后锁定我们了，她知道我们进来了”
“谁是红后？”爱丽丝问道。
“是最先进的级电脑，掌控整座大本营”
在经过一个个实验室的时候，众人遇到了一小点麻烦，实验室或许触了火警警报，每个实验室中都注满了水，看上去像是一个个抽满水的大注射器。
“卡普兰，寻找替代路线”詹姆士吩咐道。
不过这里实验室的异常，也引起了其他几人的疑惑。
詹姆士只好再度解释“五小时前，红后突然大开杀戒，封锁大本营，杀光了所有的人，我们知道后，奉命前来关闭她”
“她为什么这么做？”爱丽丝问道。
“不知道”詹姆士摇了摇头“可能受到了外界的影响”他的意思是红后可能被电脑病毒入侵。
就在几人相互之间谈论着关于红后的事情的时候，突然站在一旁的麦特大叫了一声跳开了。
原来是他身后被注满水的玻璃实验室中突然一具女尸飘了过来，正好出现在他眼前！
女尸因为在水中漂浮着，头如同水草，无意识的飘动。
所有雇佣兵被这突然出现的尸体吓了一跳，不过毕竟是经历过生死阵仗的人，很快便冷静了下来。
而且尸体的出现，让几人没了交谈的心思。
几人迅的离去。
而这个密封的空间中唯一能出一个力的，只有那具已经死掉的女尸。
顺着楼梯，几人迅的来到了最底层，凭借着强健的体魄，这也浪费了他们接近1o分钟的时间。
他们来到了b栋餐厅，这里是员工聚餐的地方，也是一行人想要到达红后所在控制室的必经路线。
喷着淡淡冷气烟雾的b栋餐厅，看上去非常的诡异安静。
一个个巨大的箱子被密封着放置在这里。
看到这一幕的人很难将眼前的东西和餐厅联系在一起，这或许像一个实验室，又或者一个杂货间，多过像一个餐厅。
“雷恩，杰迪，看住人贩”詹姆士吩咐道“其他人跟我来，记住要跟紧！”
一个小队，兵分两路。
詹姆士带着一小分队的人出现在了红后主机房前，而堵在他们面前的就只有一个通道而已。
计算机专家卡普兰在疯狂的敲动着键盘，摆在他面前的是一个大型的分屏计算机，看规格，应该是给主管用的，用来操控红后，毕竟人类不会真的放心一个人工智能。
“红后启动了防御措施”卡普兰不停的敲击着键盘，可是面前的大门一直紧锁，不见丝毫动静“这可能会比较棘手”
在开启这道门浪费的时间，已经足有十分钟！
不过卡普兰话还没有说完，他在尝试着另外一种破译方式，可通道的门却突然的开了！
愣了一下，卡普兰还想说些什么，队长詹姆士却已经话了“门开了，我们进去”
“如果我是你，我就不会进去。”跟在他们身后的李林警告他们。