在神奥传说中，整个宇宙，包括神奇宝贝世界，是由一位名为阿尔宙斯的神奇宝贝创造的。阿尔宙斯从虚无之地的蛋中诞生，是第一只存在于世界的神奇宝贝。接着阿尔宙斯创造出帝牙卢卡，帕路奇犽，还可能包括骑拉帝纳。阿尔宙斯分别给了帝牙卢卡与帕路奇犽掌控时间与空间的能力，而骑拉帝纳则存在于另一个次元之中。接着，在世界诞生之初，阿尔宙斯创造了亚克诺姆，由克希，和艾姆利多，分别代表共存于现代的人类和神奇宝贝之中的意志、知识与感情。它们生存于今天被称为立志湖，睿智湖，心齐湖的湖泊底部，被称为湖中的传说神奇宝贝。在此期间，梦幻在神奇宝贝世界诞生，并包含了当时及未来存在的全部神奇宝贝的遗传基因。
固拉多与盖欧卡的大战
很久很久之后，固拉多从地底的岩浆中诞生，盖欧卡在深海的海沟中出现，烈空坐则形成于臭氧层的物质中。烈空坐在臭氧层中盘旋，偶尔也会来到天空之柱休憩。固拉多和盖欧卡分别扩张着大陆与海洋。两只超古代神奇宝贝终于碰面，带来了为争夺在神奇宝贝世界之初的优势而进行的激烈战斗。烈空坐最终平息了这场战斗，并使得固拉多与盖欧卡回到各自长眠的洞窟中。为了防止两只超古代神奇宝贝再度醒来，红色宝珠与蓝色宝珠被制造，并保管于送火山。当时，梦幻在世界各地出现，有相当多的分布数量。除此之外，神奇宝贝世界中出现了天冠山一类的地块，随着雷吉奇卡斯在陆地间的移动，形成了各个地区，在天冠山周围形成的是神奥地方。在这场造山运动中，神奥地方的东北部出现了严酷山，在其中的岩浆中诞生出席多蓝恩。阿尔宙斯创造了金刚玉魂、白玉魂和白金玉魂，之后进入了长眠之中。
远古时代的未知图腾
许多年之后进入了史前时代，并出现了多种存在于那个时期的神奇宝贝。考古学家已证实这些神奇宝贝分布于各个陆地，在今天形成了化石并包含着神奇宝贝的遗传基因。这一时期可能梦幻的数量开始减少，世界上更多地存在其它种类的神奇宝贝。除了神奇宝贝之外，神奇宝贝世界上还出现了人类。
在石器时代、冰河时代和铁器时代，分别出现了雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇鲁，它们藏于丰缘地方，并作为打开在切锋神殿雷吉奇卡斯封印的钥匙。
烧焦塔在被烧毁150年之后
约3000年前，卡洛斯地方发生战争。当时的国王az的神奇宝贝朋友花叶蒂死亡。az因而开发出了最终兵器。
1500年前，最早的文字书写方式在阿露福遗迹、阿斯卡纳遗迹和随意遗迹出现。考古学家尚不能确定未知图腾和这种书写方式究竟哪个最先出现，但显然它们之间有某种关联。在此时期，鲤鱼王的种群发生突变，成为了最脆弱的神奇宝贝。
在700年前的近代，在圆朱市相继建造了9层高的铃铛塔和钟之塔。两座塔象征着神奇宝贝与人类之间的友谊和共同生活的希望。从塔顶一览的情景十分壮丽。西边的是唤醒神奇宝贝的钟之塔，而东边的塔是神奇宝贝的休憩之处。据说在当时，一只巨大的银色神奇宝贝栖息于钟之塔顶，相对的铃铛塔则住着彩虹色的凤王。然而，在150年前，一场闪电击中了钟之塔，剧烈的大火燃烧了整整三天，在一场倾盆大雨之后才被熄灭。洛奇亚和凤王逃离了这场灾难，之后洛奇亚到漩涡列岛栖息。在那时起，第一届神奇宝贝联盟比赛开始举办。在现代时期，秋叶原博士创造了第一只人造神奇宝贝3d龙。
在数年前，人类从梦幻的基因中克、隆出超梦，超梦逃脱了人类的控制并破坏了红莲岛上的神奇宝贝屋。不久之后，红莲岛的火山喷发破坏了岛上的许多区域。另外火岩队和水舰队的首领唤醒了固拉多与盖欧卡并使它们再度交战，又再度被烈空坐平息。
在现代，由于环境的异常变化，神奥地方开始变得寒冷。敌对组织银河队使用红锁链使湖之众神召唤出了帝牙卢卡，帕路奇犽和骑拉帝纳。由于主角的干涉，银河队的计划没有得逞。那时在天冠山顶出现了一个时空裂缝，也是破格的世界的入口。骑拉帝纳和银河队首领赤日进入了破格的世界，之后这个入口的关闭让神奥地方恢复了平和。
在近年，以n为首的电浆团在合众地方活动。魁奇思以合众的建国传说四处游说，表面上是想解放神奇宝贝，实际上在酝酿更大的阴谋。而n则为他的理想收服了捷克罗姆或雷希拉姆，当击败冠军阿戴克后，主角在合众八位道馆训练家的帮助下，唤醒了另一条龙神奇宝贝在n的城堡及时阻止了n，但n幕后的魁奇思露出了他的真面目。由于主角的活跃，逮捕了魁奇思，n乘着捷克罗姆或雷希拉姆飞走。国际刑警官员大帅在主角的帮助，逮捕了电浆团余党，合众地方的风波被平定。
2年后，电浆团分裂成两派。魁奇思带领电浆团企图用酋雷姆的力量把合众地方冰冻，后来被主角及n阻止。魁奇思却让酋雷姆和捷克罗姆b2或雷希拉姆w2合体。最后，酋雷姆被主角制服，合众地方免于受到危机。
就在这段时间里，卡洛斯地方的闪焰队打算使用“最终兵器”改变这个世界。因而唤醒了哲尔尼亚斯x或伊裴尔塔尔y。主角制伏了它们以后，卡洛斯地方3000年前的国王az的后代，闪焰队首领弗拉达利使用能进行超进化的神奇宝贝打算阻止主角离开闪焰队秘密基地。最后，主角成为冠军，回到密阿雷市接受表扬。az与花叶蒂再次相遇。卡洛斯地方脱离了危险。
文化：
在神奇宝贝世界，神奇宝贝和人类一起生存，作为训练家的人类会收服神奇宝贝，训练神奇宝贝，和神奇宝贝一起对战，培育神奇宝贝，或者把神奇宝贝作为宠物，亦或作为一门研究的学科，或利用神奇宝贝的能力完成各种工作。许多神奥传说也说人类与神奇宝贝的关系非常亲近，历史上甚至有一段不分彼此的时期。
广义地说，神奇宝贝训练本身就是基于两个这样的问题：训练家和神奇宝贝应该有怎样的关系，如何才能增进这种关系。因为有着不同的观点，不同的训练家也会有不同的训练方式，专长于不同的领域。并没有任何一种方式是正确的训练方式，每一种方式都有其有利于不利的一面。
然而，许多训练方式最终其实都分属两类。第一类是专注于神奇宝贝的感受和幸福，建立强大的友谊；第二类是专注于神奇宝贝的力量和能力。训练家经常会为这两种观点争执不休。在神奇宝贝系列的价值观里，则突出地强调训练家与神奇宝贝之间，友情才是最重要的，而只要有爱与关心，就能发挥出任何神奇宝贝的强大力量。
神奇宝贝世界史显然与现实世界不同，并侧重于描写人类与神奇宝贝相处的部分。在世界上并没有主要的宗教，但许多信仰和神话都围绕着传说中的神奇宝贝，所以也可以说，神奇宝贝是这个世界人类的主要信仰。而且，许多人类都对神奇宝贝表现出友好和尊重，世界各地也有与神话传说相关的神殿。
然而，也有许多人希望利用神奇宝贝满足自己的野心。有些人希望获得物质的收获，而有些人则希望达成一些不被这个世界接受的理想。另外，至少在历史上，神奇宝贝世界曾有过战争，并且分属不同阵营的神奇宝贝也曾参与其中。
神奇宝贝是神奇宝贝世界之中，和人类一起生活的生物。许多人类尊重并善待神奇宝贝，也有一些人类试图滥用神奇宝贝。神奇宝贝具有感情，并在某种程度上能理解人类的语言。生态环境的变化也受神奇宝贝的影响。和现实世界的生物相比，许多神奇宝贝拥有超出现实世界生物的能力。
进化：
在神奥传说中，神奇宝贝和人类最初并不分彼此，属于同一个种群。随着时间的推移，一部分生物演变形成了人类。这种说法在神奇宝贝世界中提到很多次，但并未得到证实。梦幻是所有生物的祖先，它演化成为其它神奇宝贝。最早的人类诞生于数百万年前的石器时代。在生物学和遗传学上，所有的神奇宝贝都同属一种物种的不同分支，所以虽然不同种的神奇宝贝也有可能在饲育屋中生蛋。
在现代的神奇宝贝世界，进化一词专指神奇宝贝在生长到一定阶段、或在特定条件下转变为另一种神奇宝贝的过程。进化并不只是体型变大，一般进化型态的神奇宝贝拥有更强大的种族值，学会不同的技能，甚至改变属性。许多神奇宝贝都可以进化。
神奇宝贝的进化，更类似于现实世界的生物变态而非进化，和进化一词相似的神奇宝贝进化是结草儿，它会根据环境来改变进化后的型态。
繁殖：
几乎所有神奇宝贝都可以进行繁殖。完全进化的，或者经过幼年型态的神奇宝贝可以和相同蛋群的神奇宝贝生蛋。没有性别的神奇宝贝也可以和百变怪生蛋。除了玛纳霏和霏欧纳之外，幼年型态的神奇宝贝以及传说中的神奇宝贝不可以生蛋。和现实世界的生物一样，许多神奇宝贝有性别之分，有些神奇宝贝可以通过性别差异分辨。通常，训练家神奇宝贝一般在神奇宝贝饲育屋中生蛋。神奇宝贝繁殖的方式并不为人所知，也不为人所见。
神奇宝贝在出生之前生活在蛋里，神奇宝贝蛋有坚硬的外壳保护它的成长。蛋的外形通常会有所属的神奇宝贝的花纹。和现实世界的动物一样，神奇宝贝会竭力保护它们的蛋，把蛋守护在离它们很近的地方。在成长到一定程度后，神奇宝贝就会从蛋中孵化出来。神奇宝贝孵化所需要的时间依神奇宝贝的种类而有所不同，但若把蛋存放在电脑里，蛋的成长就会暂停。
有些神奇宝贝有幼年型态。幼年型态的神奇宝贝在进化之后，就可以进行繁殖。许多存在幼年型态的神奇宝贝的蛋只会孵化成为幼年型态；然而有些神奇宝贝的蛋一般会孵化成略成熟一些的型态，只有在生蛋时携带对应的熏香，才会使蛋孵化成幼年型态。
食物：
在神奇宝贝图鉴中，曾多次提到一些神奇宝贝会以其它种类的神奇宝贝为食，比如比雕会从水中捕捉鲤鱼王。一些地方也提到人类会食用神奇宝贝，比如主角妈妈的红莲火山汉堡，火箭队兜售的美味尾巴。大葱鸭也因为被过度捕食而数量锐减。一些神奥传说中也提到了食用神奇宝贝，其中称如果把它们的骨头捡干净放回它们原先所在的地方，神奇宝贝就会获得重生。
分类：
神奇宝贝分布在不同的地区，并由当地的神奇宝贝博士统计，编成神奇宝贝图鉴。大木博士统计了关都地方存在的151种神奇宝贝，和不同地区的神奇宝贝编成全国图鉴，在关都地方、城都地方、丰缘地方、神奥地方、合众地方、卡洛斯地方，一共有719种神奇宝贝存在。
神奇宝贝也依据属性进行划分，不同属性的神奇宝贝有所克制和所不利的属性，属性一共有18种，神奇宝贝可以有一个或两个属性。
地理和自然：
神奇宝贝世界和现实世界在地理上有相似之处。都有大陆、海洋和适合生物生长的天气气候，所以神奇宝贝世界的体积和与恒星间的距离均与地球相近，有相似的月亮，相似的气候和潮汐。许多地方也揭示了神奇宝贝世界和现实世界存有相关之处。
人类和自然在神奇宝贝世界和谐相处，许多城镇依自然环境而建。值得一提的是，和现实世界不同，神奇宝贝世界中的人类和自然有着更紧密的联系，除了极少数的敌对组织之外，人类的建设极少影响到自然环境。固拉多和盖欧卡等神奇宝贝还可以影响自然环境，带来无法解释的干旱、暴雨和地震。
神奇宝贝世界分为多个地区，包括关都、城都、丰缘和神奥地方等。除了这些地区之外，还有不属于任何一个地区的岛屿，岛屿之间可以组成群岛，比如橘子群岛、杰可罗拉群岛和七岛。虽然地区之间有一些共同点，但也有一些显著的不同，比如神奇宝贝的分布，神话、历史以及传说。无论从气候还是人文方面，从不同地区前来的游客都能感受到当地与家乡的不同。由于术语全国图鉴的存在，这些地区可能同属一个国家，亦或整个世界是唯一的一个国家。在神奇宝贝主系列游戏中只有5个地区，欧雷和菲蕾地方等地则在其它游戏中出现。动画中另外还提到了一些小型的王国，位于难以到达的地方。
关都、城都、丰缘、神奥地方的地理与现实世界日本的地区具有相似之处。关都地方可以对应日本的关都地方和中部地方的东部，而城都地方则对应中部地方的西部和关西地方，丰缘地方对应日本的九州地方和冲绳县一部分，神奥地方的设计原型则是北海道、国后岛和库页岛的一部分。
合众地方的设计原型则是来源于纽约，似乎于不同以往，但也体现了设计者的深意。卡洛斯地方的设计原型则是来源于法国。
气候：
许多地区都有不同的气候。较南方的地区和岛屿例如丰缘地方和橘子群岛相较北方显然更暖和。而神奥地方则比其它地区要凉爽，并且因为发生的气候变化更变得愈发寒冷。在神奥北部还有常年的积雪。一些神奇宝贝比如固拉多、盖欧卡、烈空坐可以影响气候和天气。
神奇宝贝世界同样有天气变化，有阴晴雨雪和水循环。许多在地球上存在的天气在神奇宝贝世界当中同样存在，例如下雨、冰雹、下雪、浓雾、沙尘。神奇宝贝世界有植物和树木的正常生长，所以可以推断碳循环、氮循环在神奇宝贝世界同样也是存在的。
环境：
神奥地方最高的山峰天冠山，顶上是破格的世界的入口
神奇宝贝世界的自然环境与地球相近，树木聚集形成森林，不毛之地成为沙漠，松软的沙粒形成吸引人类和神奇宝贝游玩的海滩。丰缘和神奥地方还有热带雨林和大片雪地等多种丰富的环境。
神奇宝贝世界被繁茂的绿色覆盖，树木、灌木、草丛等植物分布在世界各处。高草丛成为了野生神奇宝贝的栖息之处。神奥传说之中这样解释了人类走到高草丛里神奇宝贝就会出现：神奥刚刚出现的时候，神奇宝贝认为它们应该永远准备帮助人类。在世界中还有高山和平原，最大的山峰是天冠山，将神奥地方分割成东西两部。人造和自然之景，比如洞窟和隧道可以帮助人们通过高山，到达另一座城镇。神奇宝贝世界的一些自然现象，比如火山灰，是由附近的火山所形成的。
人类和自然是神奇宝贝世界里紧密共存，许多城镇依自然环境而建，而并不影响自然。例如暮水镇建在漂浮于太阳珊瑚群的木筏之上，琉璃市则环绕在中空的火山口。植物、神奇宝贝和人类共享着同一片生态环境，而神奇宝贝相较人类更能适应自然。
物理和科技：
神奇宝贝世界的科学技术比现实世界更要先进，科技的进步可以使神奇宝贝存放于电脑中，把神奇宝贝发送的世界各地，复活化石创造出古代神奇宝贝，虽然人类的生活依旧朴素自然。能量转换等科技成就和进化、可以记录事件的花等奇特自然现象使得神奇宝贝世界和现实世界存有很大的不同。得文制造股份有限公司的一些研究员还在尝试更加先进的科技想法，比如将神奇宝贝的梦境投影，和神奇宝贝直接交流，将人类变成神奇宝贝（正辉曾意外造成这样的事件）等等。制造失重的机器和基本的交通方式比如自行车和卡车一同存在。
精灵球，神奇宝贝世界最常用的科技
神奇宝贝世界最为先进和常用的技术之一是神奇宝贝球，可以把神奇宝贝收纳到口袋中的小球里。在对战中，如果对手野生神奇宝贝的体力减弱，训练家就会扔出宝贝球。如果宝贝球击中了神奇宝贝并且没有被弹开，宝贝球就会张开，把神奇宝贝收入其中，然后关闭。接着在宝贝球摇晃的期间，如果神奇宝贝没有挣脱宝贝球，那么就算收服成功。宝贝球最早来源于圆柑果实而非人工制造，近代的宝贝球需要人工拧开螺丝将神奇宝贝放出。宝贝球有各种各样，分别用于不同的用途和场合，掌门球可以万无一失地*收服神奇宝贝。
尽管神奇宝贝世界有各种各样的先进科技，但神奇宝贝训练家更倾向于徒步旅行，寻找野生神奇宝贝，达成自己的梦想，可能是因为徒步比较容易遇到神奇宝贝，而乘坐交通工具会错过很多野生神奇宝贝生活的地方。因此通常训练家都只会选择仅能徒步穿越的道路旅行，很少会走在汽车行驶的公路上，也很少有训练家驾车或长时间乘车。
通常训练家们为了更便捷的旅行，会穿着跑步鞋，部分地区的训练家还会穿着直排轮以获得更快和机动的移动，而有些训练家会去拜访自行车店，购买自行车来代替徒步，虽然也有骑乘摩托车的训练家，但是大部分10岁左右的训练家都没有到达驾驶摩托车和汽车的年龄。
汽车几乎不被训练家们使用，仅用作大宗运输。除此之外还有飞机、热气球或飞行船，但是一样被用作大宗运输或豪华享受的工具，鲜少见到训练家乘坐这些交通工具旅行。训练家在地区之间最常见的交通方式是渡船，许多地区都有自己的航线和港口，也有些地方兴建了火车列车，如城都地方和关都地方的磁悬浮列车以及合众地方的对战地铁，人类也可以利用神奇宝贝来飞翔和冲浪。神奇宝贝世界亦存在着潜水艇等交通工具。
动画中，神奇宝贝世界的物理规律有时并不真实，比如不寻常的体力和能力，躲过致命的攻击等。
细节：
神奇宝贝图鉴的存在，不同的未知图腾图案，还有226号水道的大师，梅丽莎，大帅都说明在神奇宝贝世界有不同语言的存在。
早期设定中，神奇宝贝世界被设定为现实世界的一部分，在各种作品的文字中多次出现现实世界的事物，尤其以第一世代最为突出，在之后的版本中则开始刻意回避现实世界的事物，神奇宝贝世界逐渐与现实世界分离，为此动画中还创造了动画文字。
第一世代中对神奇宝贝世界的世界观还是以唯物主义为主，基本以进化论作为基准，而在之后则逐渐引入了神话传说。到第四世代时则突然转变为了神创论的唯心主义世界观，但是神奇宝贝世界仍然拥有高科技技术。
对于神奇宝贝世界是否只有神奇宝贝与人类，还是拥有更多的生物，官方没有给出任何解释。但在动画初期有非神奇宝贝生物出现的镜头，神奇宝贝超级愿望中也出现了一些疑似非神奇宝贝的鱼类，而植物在神奇宝贝世界的定位也不甚明了。
虽然神奇宝贝世界内存储所有神奇宝贝信息的图鉴被称作全国图鉴，但是这里的“全国”所指的范围却无从得知，每个地区究竟是独立的还是算作某个“国家”的部分，官方并没有给出任何解释。
除神奥地方外，其他的地区的地图边境几乎都出现了群山，但是除了关都和成都被判明互相联结之外，这些群山的对面究竟有什么却是个谜。
目前在玩家中普遍认为，每个地区边境的群山对面，是一些尚未写入神奇宝贝系列游戏的地区。
主系列游戏
关都、城都、丰缘、神奥、合众、卡洛斯、七岛
动画原创
橘子群岛、杰可罗拉群岛
神奇宝贝世界——摘自“神奇宝百科”