圣安奴号，世界级的豪华巡航舰。每年的这段时间，圣安奴号都会在关东的枯叶市停靠，接待来自于关东各个市镇的游客。
“那小智boy，我就送你们到这了。”一位一头金色刺发的大汉用力地拍了拍小智的肩膀，爽朗地笑道：“下次路过枯叶市，记得来道馆找我作客啊！”
“啊，再见了马志士，好好锻炼你雷丘那慢得跟野生懒人翁有得一拼的速度，别再这么轻松被我打败了啊。”小智揉了揉被对方拍得有些发痛的肩膀，口中开了个玩笑。
马志士闻言又是一阵大笑。
笑着笑着，马志士又将目光转向了站在一旁的小叶，眼中带上了几分歉意：“不好意思啊，小叶girl，之前对你的妙蛙草下了那么重的手。”
小叶摇了摇头，看着这个之前自己十分讨厌的道馆主，嘴角勾起了一抹微笑：“没什么了。毕竟，你也是有自己的苦衷。”
“滴——”的一声，圣安奴号的汽笛被拉响，开船的时间就要到了。
小智收回望向游轮的目光，向着马志士挥手道：“那，就这么告别吧。有空的话，记得来石英高原看我的比赛。记得啊，以后对来挑战的训练家好一点。”
“No problem！”马志士吹了声口哨，欣然道：“通过跟你的对战，我也切实体会到了训练师自己的精灵被痛击之后的伤心，放心吧，以后来挑战的boy和girl，我会好好对待他们的。”
“再见啦小智boy，一路顺风！”
“保重咯，马志士！”
随着圣安奴号的出发，小智、小叶、圣代和小刚也带着枯叶道馆馆主——马志士的友谊，踏上了前往蓝普尔其的海上之旅。
关于他们间的结识，还得从之前说起……
……
正当小智考虑着应该收服什么水系精灵之时，在沿途的一座城镇上，小智三人同专注于捣乱的杰尼龟军团，撞上了。
“有兴趣去见识一下更广阔的世界吗？”在用新收服的妙蛙种子教训了一下想抢夺食物的杰尼龟后，小智察觉到了为首的杰尼龟眼中的向往，不由得用上了波导，口中问道。
“杰尼！”
带着一副有别于其他杰尼龟的倒三角墨镜，身为老大的杰尼龟感受到了小智波导中的诚挚，成为了小智的最后一个空位的主人。
在离开城镇之后，小智直接带领着小刚和圣代，来到了正辉博士所居住的灯塔。之前曾跟老师一起在双子岛居住过一段时间的小智，同老师一起接待过正辉博士，听闻小智开始了新手训练家的旅行后，正辉在跟小智的通讯中邀请小智经过之时一定要来灯塔找他。
“没想到，小智你还认识这么厉害的人物啊。”身为研究学院“学术”一科成绩名列前茅的圣代，自然不会没听过正辉的大名。用来传输神奇宝贝的传送系统，就是在十多年前正辉的改良下，克服了关东和城都地区间因石英高原的高海拔而造成的传输的不稳定，使得两大地区得以更紧密地合作。仅凭此项成绩，就足以正辉名列联盟英知部的荣誉名单之上。（原著是正辉发明的两大地区的传送系统，这里修改了一下）
“哈，跟大木博士相比，我可算不上多么厉害的人物啊。”正辉博士听到圣代的话语，摇了摇头，并不以此自得，“小智可是大木博士的助手呢。”
“诶？小智是大木博士的助手？！”这次连见多识广的小刚都惊讶了起来。“虽然听说了小智来自真新镇，但是我还以为只是单纯的新手训练家和博士间的关系……”
“……我没跟你们说过吗？”小智有些后知后觉地思考了一下，“好像确实没跟你们提过……我在出发前，的确是帮着博士管理那些精灵，算是博士他的半个助手吧。”
“难怪你没有读过学院，却对精灵的各项资料掌握得这么扎实……”圣代自以为找到了小智对于各种精灵的了解不下于自己、甚至超过了自己的原因。
小智没有多说什么，只是偷偷向着正辉博士打了个眼色。正辉博士了悟了小智的意思，微微一笑，也不继续解释小智的知识其实大多来自他的老师，直接带着三人前往客房。
就这样，小智他们在正辉灯塔这住了下来。在这期间，小智也因为队伍里一下子就新进入了两只精灵，所以刻意拖慢了前进速度，打算先规划一下妙蛙种子和杰尼龟的基础锻炼，故而在正辉的灯塔一呆就是一周。
在正辉的邀请下，一起见证了某个藏于雾中的巨大神秘精灵之后，小智一行人重新踏上了旅途。
枯叶市，已经近在咫尺了！
……
“乔伊小姐，你是说，这些精灵都是被枯叶道馆的道馆主马志士打伤的？”从乔伊小姐那得到了肯定的答案后，小智一直显得温和阳光的脸色，不由得沉了下来。
“什么嘛，这种虐待精灵的人有什么资格当道馆主啊！”圣代秀眉一蹙，将自己代入那些精灵被严重打伤的训练家之后，即使是侧重于学术、较为理性的她也不由得对素未谋面的马志士升起了不满。
“看你们的样子，应该也是参加了关东联盟的训练家吧。”乔伊小姐满脸忧色地劝诫着：“如果没有十足把握的话，你们还是先行前往下一个道馆比较好哦？也有许多对马志士的行为感到愤懑的训练师，但几乎无一例外，都被他打伤了，少数几个赢了他的训练师也是损耗很大。刚才有一位叫小叶的女孩子，虽然最终赢了，但她的妙蛙草也因此重伤，直接被送来抢救。”
圣代从来没见过男孩脸上露出这么着急的神色，一时不由得对那个叫小叶的女孩产生了好奇。
“对，就是她。你是她的朋友吗？”
“我和她是一个城镇出来的。乔伊小姐，请问她现在在哪？”
“她就在急救室的走廊外，可以的话，我希望你去安慰安慰她——”乔伊小姐的话音未落，小智已经冲了出去。
急救室外，小叶双手合十，祈祷着妙蛙草平安无事。女孩的眼角，隐约还可见一丝丝泪光。
“小叶！”
一道男孩的声音从拐角处传来，划破了此处的宁静。小叶耳中听到这熟悉万分的叫喊，身躯一颤，不由得睁眼望去。
眼帘中，那个曾经替她挡下了百十烈雀、自己伤痕累累的男孩，那个自己隐约有着一缕缕情愫的青梅竹马，正着急地向自己跑来。
女孩张了张嘴，想出声，却又无言。
“……没事了。”这是小智第二次见到女孩泪眼朦胧的样子，抿了抿嘴，不知道该说些什么安慰她：“放心吧，妙蛙草它会没事的……”
女孩没等小智说完，已经一把抱住了男孩，将头埋在男孩的肩上。隐约中传来的抽泣声和肩膀上的湿意都在告诉男孩，自己的青梅竹马的伤心和担忧。
手，不自觉间已然握紧。
‘马志士，电系道馆吗？’眼中一道冷光闪过，比之研究学院遇到小淳时，更强烈的怒火涌上了心头，‘希望，你的实力有传闻中的那么强。’
……
“等一下，雷、雷丘失去战斗能力，皮卡丘获胜！”裁判看到场中发生的景象，连忙加速了判决，直接裁定了皮卡丘的胜利。
“雷……”雷丘浑身焦黑地躺在地上哀嚎着，脸上的痛苦仿佛一道刻刀，深深刻在了马志士的心头。
“雷丘！”马志士连忙冲进了场中，直接抱住了自家精灵，丝毫不顾自己的双手也被雷丘身上残余的电量电得几乎失去了知觉。此刻的他，心中只有后悔。
小智看着一人一精灵，眼中闪过一道悔意，暗道自己是不是做得太过分了。皮卡丘的小脸上也有些纠结，转过头看着小智，口中轻轻地叫了一声。
“小智……”小叶也走上前来，不忍地说道：“就这样吧，马志士他也得到应有的惩罚了。雷丘的‘雷劫’，你就帮它解了吧。”
“抱歉，抱歉！一切都是我不好，是我下令雷丘做的，它是无辜的！小智boy，请你把它身上的技法解了吧！”人高马大的马志士，此刻却着急的像一个孩子，脸上焦急的神色表明了他对雷丘的在意——至少在对待自己的精灵上，他是真心的。
同样也对自己的行为感到太过分的小智，向着皮卡丘点了点头。皮卡丘身形一闪，已经来到了雷丘身边，尾巴与雷丘一触，笼罩在它身体表面那一层淡淡的电网仿佛有生命一般，被皮卡丘收回。雷丘体内蓄积起来无从发泄的电力，此刻终于被解除了束缚，通过雷丘的尾巴导向了大地，雷丘的情况得以好转。
小智取出一瓶特效药，手上一边采用特殊的手法拍击、揉捏着雷丘的身体，一边将特效药洒下，一阵忙碌后，雷丘的状况终于稳定了下来。
比赛后，马志士向小智坦承了自己之前那么做的原因：身为退伍佣兵的他，有几个过命交情的战友，不幸在执行防卫盗猎团伙的任务中逝世，而自己一力承担起了几个家庭的生活。为了赚更多的钱，他与枯叶市的药店经销商达成了协议，只要自己多将来挑战的训练师的精灵打伤，精灵中心向他们下的那些药物订单中，自己可以得到一定的抽成。为了战友的家属们，自己只好故意装作崇尚暴力，大量击伤往来的训练师。
“……原来是这样。”小智听完后，若有所思。小叶心中的怒气随着雷丘的惨状，消减了不少，闻言也同圣代、小刚般沉默了下来。
“现在想想，我其实一直在伤害别的训练家与他们的精灵，这样的我，即使有着借口，却跟那些黑心商人也是一丘之貉了。”金发大汉说到这里，脸上露出一抹苦涩的微笑。
“好了，boys and girls，谢谢你们愿意听我的倾诉。”马志士从沙发上站了起来，取出一枚徽章，递给了小智：“这是打败我的橙色徽章，拿着吧。我也不知道我接下来到底该怎么办，不过，打伤精灵的事，我不会再干了。”
“这个事情上，我想我应该可以帮你。”小智看着自己的图鉴上刚收到的消息，对着马志士笑了笑。
“……诶？”
……
“所以说，”圣代坐在遮阳伞下的白色木椅上，好奇地望向靠着船舷的栏杆上的小智，“你是怎么帮马志士拉到那笔投资的？”
小刚和小叶闻言也纷纷看向小智，眼神中满是疑惑。
感受到三双眼睛的逼视，小智双手背在后脑勺上，看着远方的白云，“我只是得到消息，希鲁夫公司最近要重新翻修十号路的无人发电厂，需要一个对这方面比较在行的顾问，所以跟大木博士和正辉博士提了一下，让他们推荐马志士做这个。电系馆主、退伍佣兵、还是枯叶市的，正好一拍即合啦。”
“原来是大木博士的面子啊，那难怪了。”三人闻言，也不再追问。
小智见他们不再追问，松了口气。偷偷取出图鉴，只见上面又出现了一只3d龙，口中还衔着一封信。
“小智君，初步接触后，你和大木博士他们推荐的这个人选十分不错，我很满意。在此希望转达一下我们希鲁夫公司对迦南先生对我们工作的支持的感谢。——希鲁夫公司总裁：希鲁夫老人。”