但在这一片盛世繁华之下，隐藏着危机和疑云。巨型垄断企业联合着快速崛起的导航者家族控制了亚空间航行的每一个方面，任何殖民地，如果胆敢反抗，绝望的孤立就是他们必然的宿命。
灵能者已然出现，虽然尚未遍及每一个殖民地，但是各式袭击事件已被反复目击发生。
垄断企业集合而成的巨型托拉斯的影响早已渗入共和政府的每一个角落，军队也无法幸免，曾经的人民保护者逐渐变成大公司之间争权夺利的工具，而羸弱的共和政府完全无力阻止这一切。
曾经蓬勃发展的民间科技研究逐步凋零，独立科研机构只有两个选择，加入大企业，或者被挤压灭亡。
但是，也有一丝火光，来自于银河各个角落的科学家们和自由论者，他们开始聚集在一起，并成立了一个小小的组织。
出于对亚空间航行的忧虑，联合开始探索一种全新的技术，可以让人类不再依靠亚空间，让每一个人都可以自由穿行于星辰之间。
他们最终打破了曲速的极限，一种全新的技术，相位跃迁，诞生了。
相位技术的诞生使得这些科学家们开始思考联合的未来。
但是对于这一移民行动不同的看法，使得联合内部形成了多个派系。
被称为秩序派的人，期望能够建立一个政治清明的民主国家，并帮助如今的银河政府重塑统治权。
被称为至高派的，希望能让联合变成一个强大的国度，有朝一日回到银河建立自己的统治。
被成为纯粹派的，只关注于联合的科学建设，他们希望那个国度能够支持科学的全面发展。
以及进步派，他们要求断绝联合与银河系的一切联系，并愿意为联合整体不惜一切代价。
当建设终于完成之时，共和政府在大企业的操作下宣布联合为恐怖组织，并派遣军队前来，而那些曾经支持联合的财团，如今要求联合交出完整的相位技术以换取他们的保护。
但这不是故事的结束
进步派清楚，要想让联合真正发展壮大，就要斩断联合与银河的一切联系。
所以，进步派内有一些人选择留在银河，并启动了他们埋设在各个基地内的反物质炸弹，以断绝财团们发现相位资料的一切可能。
另一部分，则改写了舰队的航行日志，最终使得舰队在飞离银河系后丢失了一切返程数据，失去坐标，联合便无法重归银河。
其后，联合便无法借助相位跃迁定位银河的坐标，而银河系的财团们，也满足于自己的垄断终于被维护而更加无法挑战。
不知是否是天意，当财团终于在数千年下定决心重现相位技术时，ai叛乱和亚空间风暴席卷了银河系，并终结了银河人类的黄金时代。
而在遥远到无法统计的河外，联合却已浴火重生。
联邦，一个新的力量，开始以自己的方式，书写自己的历史。