龙神世家:
种花家的守护者,传说是人皇赐予其权柄。传承至少超过五千年,自上古时期就一直守护着种花家,不与世俗外界交流。拥有灭国级战力,高等战力为世界上数一数二的。保存有人皇伏羲赐予的数件法宝,用来守护种花家。目前情况不明,为外国所忌惮。
银色暮光组织:
在世界各地拥有不少分部的大组织,即使在种花家也有分部。不过据说是与龙神世家达成了相关协定,才得以驻扎在种花家。本部在米国,拥有无数清扫人员为其工作。创办的目的无人所知,人员的职位有严格规定。从清扫者、情报者、灭迹者、天启者、领导者等职位划分。主要收集孤儿,培养他们成为组织的成员。
教廷:
基督教会的正体,有两千多年的历史。传说是上帝之子耶稣基督亲自建立,拥有圣约柜作为镇教重宝。有独立的宗教审判所,牧师协会,内部分裂很严重。教廷的主体又分裂为天主教与东正教两大部分,实际上教廷已经变为了东西欧分裂的组织,每一任教皇都想要整合教会,但都无人成功。每一任教皇均为灭国级强者,是欧洲神秘势力的领头羊。教廷极为仇视黑暗生物,遇到便不放过。
魔导收容协会:
欧洲的神秘组织,致力于收集上古纪元时的魔导遗物。组织首领不明,不愿意与外界组织有所接触。但因为多次抢夺珍贵的魔导器具,与不少组织结下了梁子。曾多次与教廷交战,想要夺走圣约柜。教廷为此发布了剿灭魔导收容协会的命令,还悬赏重金要魔导收容协会首领的命,但却一无所获。整个组织沉迷于各种实验,制造了不少惨案。具体存在时间不明,但应该不下于一千年。
日本四大家族:
有神无月家族、蓬莱山家族、八意家族、安培家族联合组成,是日本实际的统治者,掌握着日本的军事、外交、经济等大部分领域。四大家族各有分工,有所不同。神无月家族是精通于阴阳术。主要负责守护日本本土,消灭异常现象。蓬莱山家族信仰月之神----月夜见尊。每一代都会选出月姬负责与神明沟通,实力最为弱小。八意家族是守护家族,保护四大家族中的蓬莱山家族。安培家族最有实力,野心勃勃,领导者日本军部势力,妄图吞并种花家,但从未成功过。四大家族每四年开一次家族大会,总结前四年的成败,决定日本接下来的行动。