御雷九光，一个普通的现代热血青年，在熬夜打游戏时被系统选中，带着“超能力觉醒系统”穿越到了幻想乡。

然而，他刚落地就发现幻想乡正陷入一场前所未有的危机——“失格异变”：博丽灵梦的符卡失去了威能，雾雨魔理沙的魔法阵黯淡无光，爱丽丝的机关人偶全部停摆，整个幻想乡的妖怪、人类与神明，都在一夜间失去了赖以生存的能力与力量。

当穿越者的超电磁炮撞上魔法侧的全面瘫痪，御雷九光成为了这片土地上唯一能稳定使用“超能力”的存在。他一边用电力驱动停滞的神社，用电磁波解析异变根源，一边还要用那台神秘的机器，为失去力量的幻想乡居民们赋予全新的科学侧能力。

是选择成为救世主，用科学重塑幻想乡的秩序？还是在这个充满妖怪与传说的世界里，找到更牢靠的羁绊？一场属于穿越者的幻想乡大冒险，就此展开！