六十八年前，在日本的神户，曾举行过由七位魔术师与英灵参加的“圣杯战争”。然而趁着战争的混乱，魔术师“千界树”夺走了圣杯。数十年过去，千界树一族以圣杯为家族的象征，叛离了魔术协会。愤怒的魔术协会派遣了刺客，却遭到了千界树一族召唤出的Servant的反击。

对抗Servant的只能是Servant。“圣杯战争”的系统被变更。以罗马尼亚的图利法斯为舞台，前所未有的七对七，最大规模的圣杯战争“圣杯大战”开始了。

然而与另一个世界线中的圣杯大战不同，本次大战中的“赤”之Archer阿塔兰忒是位于所有英灵顶点的至高猎手和弑神英雄。

而阿塔兰忒的Master洛特维尔-贝尔金斯基身为苏维埃联盟的狂热拥护者，则有着恢复联盟荣光的梦想。

圣女信任人类、奇迹之子救济人类、至高猎手引导人类。彼此的理念与梦想互相碰撞，这是人类未来的路线之争。

人类到底会迎来不确定的未来、永生的飞升还是世界人民大团结的赤色黎明呢。