在怪兽格斗大师，雷布朗多星人捍卫宇宙和平的第四个千年，曾经傲世宇宙的雷布朗多星人突然死亡，没有人知道原因。

但是在他死前，全宇宙的每个生命的脑中都出现了一句话“想要我的遗产吗？那就去成为大怪兽格斗大师吧。”

起初，所有人都不明白这句话的含义，也不敢相信那个宇宙霸主真的死了，甚至怀疑这只是他为了刺激野心家的钓鱼执法。

直到第一个雷奥尼克斯的出现，所有文明才猛然惊觉，那位霸主是真的不在，一时间，为了角逐宇宙霸主的遗产，被压制数千年之久的野心家们开始蠢蠢欲动，文明之间再次相互倾轧。

于是，大怪兽格斗时代，开始了。