21世纪,人类补完计划背后的秘密组织NERV通过研究远古"死海文书",发现了光之力与暗之力的终极对决预言。三条蕴含光子血液的腰带诞生,开发主任涉谷唯的意外死亡,其女儿凛继承了夏娃灵魂,成为连接人类始祖亚当与现世的关键——"神之子"。
随着奥菲以诺之王和暗之力的觉醒,三条腰带演化为适配神之力的帝王系统,凛的agito之力也随之觉醒,大修卡的疯狂让世界陷入危机,光之战士Agito、科技战士Faiz、觉醒究极之力的空我等旧平成骑士联手,成立跨越时空的"骑士联盟"。
这场跨越十年的战争,既是假面骑士的终极集结,也是对人类文明存续的深刻诘问——当世界走向终焉,真正能守护未来的是什么?