随着时间的流逝，令世间万物为之恐惧的魔王已经被消灭到了第一百代。每一代魔王，都会由同时代的勇者进行讨伐。

　　但魔王已经不再是最大的威胁，一个个异次元黑洞出现在世界各地，一个个不同的世界与蓝星相连，来自异界的威胁成为众人头顶的达摩克里斯之剑，随时都会刺下。

　　第一百代魔王莫歌，和第一百代勇者意外的成为了青梅竹马，并收到了中央学院的入学通知，然而就在前往途中，飞机被新诞生异次元黑洞吞噬，莫歌来到了全新的世界。

　　看着眼前黑压压的魔物，莫歌拿起一朵枯萎的紫罗兰，举向天空。

　　“魔法少女（），变身！”