一位名为神秘的绿眼男子偶然遇到一位失忆的少女丽莎菲莉娅，接着二人便遭到了穿梭空间而来的不明傀儡小队的攻击。苦战将她救下后，他们发现时间与空间遭到了破坏。同日，当地军工企业龙头“留斯工业”的公子哥乐尔·留斯在不明的流星残骸附近捡到一只绿眼睛的幼犬。两条时间线开始汇集……