平凡的少年因为意外而转生成为平行世界的真嗣，在初号机吞噬了所有使徒的s2机关后与初号机和整个负之宇宙彻底融合成为神，将原本所在的世界与另外一个世界融合，创造出了一个没有EVA的世界后，回想起自己转生之前的记忆，所以决定前往不同次元进行时空旅行。

某一天，无数的车票，落入了各方世界人们的手中。

而紧随车票来的，是遨游无数世界的EVA时空特快列车。

登上这辆列车，便拥有去往不同世界旅行的资格。见识各界风景，认识各界人物，学习各界知识，品味各界美食……

　　并且，因为这辆列车的出现，各界人物的命运发生了改变，悲剧被扭转，遗憾被弥补。