当神性最终摧毁了人类的防线，连同辛苦铸就的文明一并撕碎时，“古人类”一词已然成为被遗忘的历史。

而隶属于s--c--p基金会的Alpha-9小组成员“∏”在经过五万年的长途跋涉抵达地球后，却发现这个世界早已不是他记忆中的模样。

S--C--P 2000的错误执行让这片荒芜的大地诞生了许多类人生物，昔日文明的碎片却仍然闪烁于这些生物所建城市的霓虹之中。

带着身边仅存的异常项目S--C--P 079，∏开始了他的异世之旅。