来自宇宙的侵略者和名为怪兽的恐怖生物。

人类的武器在他们面前毫无还手之力。

神秘的光之巨人“奥特曼”在危机关头救下了人类，被人类赞颂。

当然这些都是过去的故事。

全体人类的记忆被篡改，隐藏在地底的巨大核心，曾经被奥特曼消灭的怪兽和侵略者再次出现在这残破的星球上。

名为使徒的怪物也在肆虐着，人类的最强兵器EVANGELION无法战胜的困境。

曾经的光之巨人再次屹立于大地之上，但是这次，人类是否还会帮助祂呢。