2002年亚种圣杯战争在日本京都开启，但是自1994年后的战争以后，圣杯战争居然发生了天翻地覆的变化。但是，2002年发生在日本京都的亚种圣杯战争居然出现了16个英灵，甚至出现特殊介职ruler和avenger。这两个从来没有出现在圣杯战争的介职，居然也出现在圣杯战争里。但是所有人并不知道，这个圣杯战争背后，被一个神秘的人监视着，并进行着不可告人的秘密