在未来，伴随着科技的发达，人类对神明的敬畏越发的降低。而时间的流逝，也使得人们渐渐淡忘了处于神明统治下的苦难与伤痛。越来越少的人愿意去相信神明的存在，他们宁愿自欺欺人的认为世界属于人类自己的。

于是，每一代都转生为人守护大地与和平的女神雅典娜，惊讶的发现——自己居然手下没有人了！！

一直守卫她的88颗星座，至今一颗都没被觉醒。而来自宇宙中的邪恶正步步逼近世界，这可是急坏了未来的雅典娜。

没有办法的雅典娜，只好找到了超神——克罗诺斯，去寻求帮助。

在超神的帮助下，雅典娜将自己的一部分小宇宙和克罗诺斯的小宇宙融合，形成了一个小小的分身——雅典娜酱。

她不止拥有了雅典娜的神力，又获得了超神穿越时空的能力。

雅典娜命令小雅典娜酱，穿梭时光，去寻找可以继承圣斗士之名的战士们，并且训练教导他们，让他们来保卫未来，并把所有的圣衣交付给了她，希望她为它们能够找到合适的主人。

穿越世界时，小雅典娜遇到了一点点问题——她饿了。饥饿的影响下，小雅典娜使用时空之力失误，于是被带到了其他的时空，并且与她的本体雅典娜联系中断了。

她意外的出现在了主角所在的时空，与主角相逢后，倒霉的小雅典娜又发生了一系列的意外，导致她的力量流失了大半。

负有全责的主角不得不踏上找回小雅典娜力量的旅行，同时训练着自己，来成为一名合格的圣斗士。